290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0978 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0978  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 189 aa  372  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6699  NUDIX hydrolase  56 
 
 		 215 aa  206  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.121967 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1659  NUDIX hydrolase  45.25 
 
 		 194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.074052  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2209  NUDIX hydrolase  38.2 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.022301  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4146  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 		 180 aa  104  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 181 aa  98.6  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2826  pyrophosphohydrolase related protein  33.92 
 
 		 192 aa  98.6  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2771  NUDIX hydrolase  35.52 
 
 		 192 aa  97.4  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6067  NUDIX hydrolase  33.7 
 
 		 193 aa  96.7  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0114891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5434  NUDIX hydrolase  39.62 
 
 		 213 aa  95.5  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000494994  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  33.71 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 		 177 aa  94  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 209 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 209 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  31.55 
 
 		 179 aa  92.4  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  29.89 
 
 		 180 aa  92  5e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1662  NUDIX hydrolase  33.14 
 
 		 201 aa  91.7  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 		 184 aa  90.9  9e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  36.53 
 
 		 180 aa  90.1  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0271  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 		 180 aa  90.1  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.443042  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0471  NUDIX hydrolase  31.98 
 
 		 184 aa  89.7  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 201 aa  89.7  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 		 209 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  32.35 
 
 		 207 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  36.48 
 
 		 177 aa  89.4  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0180  NUDIX hydrolase  33.14 
 
 		 183 aa  89.4  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195159 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  33.54 
 
 		 178 aa  89.4  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6125  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 		 178 aa  89  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  34.44 
 
 		 211 aa  89  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0219  NUDIX hydrolase  29.59 
 
 		 184 aa  88.6  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  41.03 
 
 		 201 aa  88.6  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2474  MutT/nudix family protein  32.95 
 
 		 182 aa  87.8  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.131904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4021  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 		 181 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4096  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 		 181 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.196207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4251  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 		 181 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.0489284 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2429  NUDIX hydrolase  34.44 
 
 		 182 aa  86.3  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3049  NUDIX hydrolase  34.44 
 
 		 182 aa  85.5  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  30.51 
 
 		 183 aa  85.5  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 210 aa  84.7  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  36.13 
 
 		 210 aa  84.3  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2174  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 		 190 aa  84.3  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0334323  normal  0.0698698 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2467  NUDIX hydrolase  35.88 
 
 		 181 aa  84.3  9e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  29.61 
 
 		 177 aa  84.3  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000782  ADP-ribose pyrophosphatase  27.68 
 
 		 179 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0157  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 		 180 aa  82.4  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0179624  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2029  NUDIX hydrolase  32.42 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3000  NUDIX hydrolase  31.69 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  31.46 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1523  NUDIX hydrolase  30.29 
 
 		 180 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  30.12 
 
 		 178 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  32.45 
 
 		 172 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02241  hypothetical protein  29.94 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0727099  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29440  NUDIX family protein  34.13 
 
 		 179 aa  80.1  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2192  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.349846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  30.99 
 
 		 281 aa  78.6  0.00000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3069  NUDIX hydrolase  28.25 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4063  NUDIX hydrolase  34.64 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0818284  normal  0.284545 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2018  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1439  NUDIX hydrolase  33.55 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0976  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3458  NUDIX hydrolase  30.94 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.185858  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3241  NUDIX hydrolase  35.26 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.021012  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0942  NUDIX hydrolase  30.12 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4523  NUDIX hydrolase  33.99 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 		 194 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1043  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 		 196 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.391418 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  33.57 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4737  NUDIX hydrolase  32.86 
 
 		 174 aa  73.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1444  NUDIX hydrolase  30.41 
 
 		 181 aa  74.3  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.9766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1076  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32.93 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  31.71 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  30.52 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  32.78 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0333  MutT/nudix family protein  29.83 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0452702  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1579  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.904804  normal  0.0162238 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  31.15 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3753  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.641661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3513  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.200164 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  34.96 
 
 		 196 aa  72  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  34.96 
 
 		 196 aa  72  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1221  NUDIX hydrolase  26.56 
 
 		 190 aa  72  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3065  hypothetical protein  27.68 
 
 		 181 aa  72  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194764 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  32.22 
 
 		 208 aa  72  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  34.96 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  34.96 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  29.7 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1814  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  31.61 
 
 		 196 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0428  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  31.61 
 
 		 196 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1145  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  31.61 
 
 		 196 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107087  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0722  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  31.61 
 
 		 196 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1305  NUDIX family hydrolase  31.61 
 
 		 196 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9435  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1314  NUDIX family hydrolase  31.61 
 
 		 196 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.861294  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1451  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  31.61 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  27.17 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15030  NTP pyrophosphohydrolase  34.68 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.202896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  31.72 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  26.9 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>