More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1408 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001302  ANIA_03894  aconitate hydratase, mitochondrial, putative (Eurofung)  50.77 
 
 		 796 aa  750    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.26439  normal  0.611037 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05300  aconitate hydratase, putative (Eurofung)  52.3 
 
 		 798 aa  743    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.29403  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05525  Aconitase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J267]  57.72 
 
 		 783 aa  869    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.842678 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85181  Aconitase, mitochondrial  56.62 
 
 		 780 aa  847    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.154992  normal  0.331758 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2702  aconitate hydratase  50.33 
 
 		 751 aa  813    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01770  aconitate hydratase, putative  51.55 
 
 		 787 aa  728    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00912812  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02620  aconitase, putative  56.73 
 
 		 792 aa  861    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01590  aconitate hydratase, putative  50.47 
 
 		 770 aa  773    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2016  aconitate hydratase  59.33 
 
 		 757 aa  912    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964954 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1482  aconitate hydratase  54.65 
 
 		 754 aa  857    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90724  aconitate hydratase  49.28 
 
 		 800 aa  748    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.319181 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2025  aconitate hydratase  58.88 
 
 		 755 aa  906    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0971  aconitate hydratase  55.93 
 
 		 760 aa  855    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0660  aconitate hydratase  56.17 
 
 		 758 aa  857    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00945  aconitate hydratase  54.62 
 
 		 755 aa  859    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.181334  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1952  aconitate hydratase  56.39 
 
 		 765 aa  855    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2223  aconitate hydratase  56.72 
 
 		 755 aa  879    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1408  aconitate hydratase  100 
 
 		 755 aa  1526    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1208  aconitate hydratase  59.19 
 
 		 756 aa  887    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.2348  normal  0.0471939 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3767  aconitate hydratase  36 
 
 		 640 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0585  aconitate hydratase  39.88 
 
 		 645 aa  387  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.674704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0423  aconitate hydratase  39.88 
 
 		 645 aa  387  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.82263  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0606  aconitate hydratase  34.71 
 
 		 655 aa  380  1e-104  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0416  aconitate hydratase  35.23 
 
 		 639 aa  382  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1882  aconitate hydratase  38.26 
 
 		 641 aa  376  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.111034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2176  aconitate hydratase  33.8 
 
 		 642 aa  373  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0828952  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1930  aconitate hydratase  37.23 
 
 		 642 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221002  normal  0.0834672 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1771  aconitate hydratase  35.64 
 
 		 641 aa  363  9e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0020  aconitate hydratase  36.5 
 
 		 644 aa  361  3e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2258  aconitate hydratase  35.27 
 
 		 648 aa  359  9.999999999999999e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3158  aconitate hydratase  33.66 
 
 		 642 aa  358  1.9999999999999998e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107146  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1966  aconitate hydratase  35.08 
 
 		 648 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3193  aconitate hydratase  36.01 
 
 		 640 aa  354  2.9999999999999997e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.249489  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0524  aconitate hydratase  34.16 
 
 		 643 aa  352  2e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000206753  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1406  aconitate hydratase  35.96 
 
 		 643 aa  350  5e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.258962  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2445  aconitate hydratase  36.12 
 
 		 645 aa  346  1e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.430041  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1265  aconitate hydratase  34.76 
 
 		 644 aa  341  2e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2763  aconitate hydratase  34.48 
 
 		 648 aa  340  4e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1612  aconitate hydratase  33.98 
 
 		 646 aa  339  9.999999999999999e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3021  aconitate hydratase  35.3 
 
 		 641 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1102  aconitate hydratase  33.63 
 
 		 642 aa  334  3e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2707  aconitate hydratase  33.15 
 
 		 660 aa  333  6e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0285  aconitate hydratase  36.48 
 
 		 646 aa  333  7.000000000000001e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3383  aconitate hydratase  35.87 
 
 		 657 aa  328  2.0000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0597  aconitate hydratase  34.58 
 
 		 658 aa  324  3e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2450  aconitate hydratase  34.54 
 
 		 644 aa  322  9.999999999999999e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2106  aconitate hydratase  35.18 
 
 		 645 aa  322  9.999999999999999e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.12781  normal  0.0131142 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4177  aconitate hydratase  36.53 
 
 		 647 aa  319  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.304204 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1803  aconitate hydratase  34.68 
 
 		 657 aa  318  3e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1336  aconitate hydratase  35.03 
 
 		 656 aa  314  2.9999999999999996e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0098  aconitate hydratase  32.74 
 
 		 661 aa  311  2e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2774  aconitate hydratase  33.7 
 
 		 661 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23930  aconitate hydratase  32.68 
 
 		 649 aa  307  4.0000000000000004e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.161871  normal  0.0821905 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5705  aconitate hydratase  33.56 
 
 		 659 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.762683  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2153  aconitate hydratase  31.75 
 
 		 644 aa  306  1.0000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0908  aconitate hydratase  32.71 
 
 		 668 aa  303  7.000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.410888  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2824  aconitate hydratase  33.52 
 
 		 660 aa  294  5e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4932  aconitate hydratase  34.18 
 
 		 652 aa  283  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3640  aconitate hydratase  32.8 
 
 		 656 aa  279  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.506746  normal  0.0138117 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2060  aconitate hydratase  30.36 
 
 		 897 aa  270  7e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4768  aconitate hydratase  33.49 
 
 		 674 aa  270  8e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.682164  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05770  aconitate hydratase  32.97 
 
 		 647 aa  264  4.999999999999999e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295611  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2861  aconitase  30.56 
 
 		 891 aa  261  5.0000000000000005e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.509308  normal  0.643421 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0174  aconitate hydratase 1  29.45 
 
 		 900 aa  258  4e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0847223  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1402  aconitate hydratase 1  30.18 
 
 		 934 aa  255  3e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.365694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2862  aconitate hydratase 1  29.33 
 
 		 899 aa  253  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2637  aconitate hydratase 1  29.33 
 
 		 899 aa  253  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0828  aconitate hydratase  30.2 
 
 		 883 aa  251  3e-65  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00982227  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3580  aconitate hydratase 1  28.55 
 
 		 899 aa  251  4e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.068843  normal  0.451076 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3664  aconitate hydratase 1  29.18 
 
 		 900 aa  251  5e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.183384  hitchhiker  0.00133985 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3640  aconitate hydratase  29.13 
 
 		 907 aa  250  6e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.593974  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3635  aconitate hydratase  29.13 
 
 		 907 aa  250  8e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533912  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2068  aconitate hydratase 1  28.94 
 
 		 855 aa  250  9e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.461258  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3724  aconitate hydratase  29.51 
 
 		 907 aa  248  3e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.489907  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3408  aconitate hydratase  29.39 
 
 		 907 aa  248  4e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.741284  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3370  aconitate hydratase  29.39 
 
 		 907 aa  248  4e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3320  aconitate hydratase  29.39 
 
 		 907 aa  248  4e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0626  aconitate hydratase  29.07 
 
 		 895 aa  248  4e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3677  aconitate hydratase  29.39 
 
 		 907 aa  248  4e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0408  aconitate hydratase  28.15 
 
 		 905 aa  247  4e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3627  aconitate hydratase  29.39 
 
 		 907 aa  248  4e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0135995 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02721  aconitate hydratase  30.98 
 
 		 863 aa  247  4.9999999999999997e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3302  aconitate hydratase  28.85 
 
 		 907 aa  246  8e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12237  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1593  aconitate hydratase  29.39 
 
 		 907 aa  246  8e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0153252 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0382  aconitate hydratase  28.19 
 
 		 905 aa  246  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3357  aconitate hydratase  30.34 
 
 		 896 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2497  aconitate hydratase  30.25 
 
 		 869 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662485 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0365  aconitate hydratase  31.9 
 
 		 872 aa  245  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3296  aconitate hydratase  30.47 
 
 		 861 aa  244  6e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0890897 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2760  aconitate hydratase 1  28.87 
 
 		 899 aa  243  7e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2264  aconitate hydratase  28.6 
 
 		 907 aa  243  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1258  aconitate hydratase  31.34 
 
 		 908 aa  242  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000190759  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4724  aconitate hydratase  31.14 
 
 		 868 aa  242  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003390  2-methylcitrate dehydratase FeS dependent  30.13 
 
 		 863 aa  242  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.828333  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6080  aconitate hydratase  30.13 
 
 		 865 aa  241  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.76062 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1412  aconitate hydratase  29.94 
 
 		 901 aa  241  5e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.881286  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1439  aconitate hydratase  29.94 
 
 		 901 aa  241  5e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0727527  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53970  aconitate hydratase  30.96 
 
 		 868 aa  241  5e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2030  aconitate hydratase  28.68 
 
 		 890 aa  241  5e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.326085  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1920  aconitate hydratase  28.62 
 
 		 890 aa  240  5.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00387998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>