More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3788 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3788  ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
429 aa  805    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0136936  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3931  protein of unknown function DUF214  95.34 
 
 
429 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.597389  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3845  protein of unknown function DUF214  95.8 
 
 
429 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3460  protein of unknown function DUF214  28.91 
 
 
469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.617969  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2826  cell division protein FtsX  22.84 
 
 
453 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2606  hypothetical protein  29.02 
 
 
420 aa  70.1  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000189226  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2626  protein of unknown function DUF214  21.31 
 
 
467 aa  67.8  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  29.81 
 
 
414 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  25.9 
 
 
414 aa  67  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  28.8 
 
 
421 aa  65.1  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0289  protein of unknown function DUF214  22.1 
 
 
457 aa  65.1  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0996073  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  27.22 
 
 
421 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  28.5 
 
 
421 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  22.25 
 
 
406 aa  64.3  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  24.65 
 
 
397 aa  63.5  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  25.33 
 
 
404 aa  63.2  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  20.99 
 
 
397 aa  63.2  0.000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  29.03 
 
 
387 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  22.54 
 
 
643 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  25 
 
 
417 aa  62  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  25 
 
 
413 aa  62  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  22.32 
 
 
371 aa  61.6  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  25.9 
 
 
415 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  34.78 
 
 
394 aa  61.6  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  25.18 
 
 
414 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  22.25 
 
 
410 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  26.44 
 
 
417 aa  61.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2385  protein of unknown function DUF214  28.46 
 
 
466 aa  61.2  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0890  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  31.2 
 
 
502 aa  60.5  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1006  hypothetical protein  26.63 
 
 
401 aa  60.5  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  35.21 
 
 
395 aa  60.5  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1201  putative permease  26.16 
 
 
431 aa  60.5  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0390517  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0164  efflux ABC transporter, permease protein  31.4 
 
 
455 aa  60.1  0.00000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  22.16 
 
 
410 aa  59.7  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.32 
 
 
413 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1639  hypothetical protein  27.83 
 
 
415 aa  58.9  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  25.45 
 
 
414 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0490  protein of unknown function DUF214  23.93 
 
 
443 aa  58.9  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  26.8 
 
 
396 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  26.06 
 
 
662 aa  58.5  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3172  hypothetical protein  21.52 
 
 
471 aa  58.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.534068  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  30.98 
 
 
400 aa  58.5  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0953  hypothetical protein  34.11 
 
 
402 aa  58.2  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  23.11 
 
 
417 aa  58.2  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4414  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.96 
 
 
413 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7003  protein of unknown function DUF214  22.82 
 
 
423 aa  57.4  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00437024  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  27.94 
 
 
397 aa  57  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  21.48 
 
 
409 aa  57  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0937  hypothetical protein  30.43 
 
 
400 aa  56.6  0.0000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.391687  hitchhiker  0.00182616 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  24.32 
 
 
409 aa  56.6  0.0000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  23.6 
 
 
407 aa  56.6  0.0000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  30.35 
 
 
654 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1676  hypothetical protein  23.02 
 
 
412 aa  56.2  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.503245  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  22.37 
 
 
398 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3702  hypothetical protein  20.36 
 
 
449 aa  56.2  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.962253  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0984  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.77 
 
 
817 aa  56.2  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000176456 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  26.49 
 
 
421 aa  56.2  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4806  protein of unknown function DUF214  35.77 
 
 
867 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2787  putative ABC transport system permease protein  24.84 
 
 
394 aa  55.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000544033  hitchhiker  0.000418311 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  22.64 
 
 
400 aa  55.1  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0903  protein of unknown function DUF214  32.29 
 
 
416 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1336  hypothetical protein  25 
 
 
395 aa  55.5  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  34.38 
 
 
443 aa  55.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1575  protein of unknown function DUF214  27.43 
 
 
402 aa  54.7  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000796219  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  28.1 
 
 
410 aa  55.1  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  29.11 
 
 
401 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  40.7 
 
 
866 aa  54.7  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  21.18 
 
 
409 aa  54.3  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  26.89 
 
 
413 aa  54.3  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  31.3 
 
 
386 aa  54.3  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  31.82 
 
 
649 aa  54.3  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3659  protein of unknown function DUF214  29.13 
 
 
462 aa  54.3  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.410687  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  28.33 
 
 
397 aa  54.3  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  23.89 
 
 
400 aa  53.9  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  28.08 
 
 
850 aa  53.9  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0383  hypothetical protein  39.74 
 
 
419 aa  53.9  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  32.58 
 
 
646 aa  53.5  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2109  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  30.09 
 
 
416 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  25.39 
 
 
381 aa  53.5  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0795  ABC transporter, permease protein  25.11 
 
 
422 aa  53.5  0.000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.372785  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3463  hypothetical protein  32.85 
 
 
402 aa  53.1  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  25.62 
 
 
403 aa  53.1  0.000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1669  hypothetical protein  31.25 
 
 
421 aa  53.1  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  23.74 
 
 
408 aa  53.1  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  30.47 
 
 
452 aa  52.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  36.43 
 
 
410 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  31.06 
 
 
649 aa  52.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1904  hypothetical protein  30.09 
 
 
416 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.745747  hitchhiker  0.00175073 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  29.11 
 
 
401 aa  53.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  26.67 
 
 
404 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  30.43 
 
 
398 aa  52.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  29.11 
 
 
401 aa  53.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  31.82 
 
 
648 aa  52.8  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.05 
 
 
437 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  27.27 
 
 
412 aa  52.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  23.92 
 
 
401 aa  52.8  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0399  ABC transporter related  28.19 
 
 
1090 aa  52.4  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.961547 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0895  hypothetical protein  25 
 
 
387 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0198854  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  31.06 
 
 
648 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2974  hypothetical protein  21.23 
 
 
411 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>