More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4168 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4168  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 237 aa  480  1e-135  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.426048 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1848  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 236 aa  210  1e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0065624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0507  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 236 aa  194  7e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1334  two component transcriptional regulator  44.21 
 
 		 243 aa  191  6e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3569  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.35 
 
 		 235 aa  189  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1879  DNA-binding response regulator  43.16 
 
 		 238 aa  182  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000557668  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1342  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.78 
 
 		 234 aa  182  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0144629  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2942  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.35 
 
 		 234 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1291  two component transcriptional regulator  42.36 
 
 		 240 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000572556  hitchhiker  0.0000375019 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0622  two component transcriptional regulator  41.45 
 
 		 240 aa  179  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0768  two component signal transduction response regulator  43.04 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000566504  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3821  response regulator receiver  40.71 
 
 		 264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169085  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0411  two component transcriptional regulator  42.24 
 
 		 230 aa  169  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1402  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 241 aa  169  5e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.154165 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4159  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.667277  normal  0.0359145 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2903  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.05 
 
 		 234 aa  165  6.9999999999999995e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  40.85 
 
 		 230 aa  164  9e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3061  two component transcriptional regulator  42.11 
 
 		 229 aa  164  9e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.56 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.08 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0673  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.39 
 
 		 235 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.996485  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2988  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.44 
 
 		 256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 232 aa  162  6e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.43 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3446  response regulator receiver  39.83 
 
 		 234 aa  160  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.664648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  40.09 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  37.13 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  38.3 
 
 		 231 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0260  response regulator receiver protein  40.95 
 
 		 224 aa  159  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820416  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  40.34 
 
 		 229 aa  159  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2286  osmolarity response regulator  40.34 
 
 		 240 aa  159  5e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  37.45 
 
 		 231 aa  159  5e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  43.1 
 
 		 236 aa  158  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00621  osmolarity response regulator  41.2 
 
 		 239 aa  158  7e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0311  two component transcriptional regulator  42.29 
 
 		 232 aa  158  8e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.280613 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001870  two-component system response regulator OmpR  41.2 
 
 		 239 aa  158  9e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.360284  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  41.28 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  39.3 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2741  winged helix family two component transcriptional regulator  40.25 
 
 		 250 aa  157  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0957275  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 230 aa  156  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.68 
 
 		 231 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.52 
 
 		 230 aa  156  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0439  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 		 230 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  40.51 
 
 		 234 aa  156  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  40.93 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.77 
 
 		 239 aa  155  5.0000000000000005e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.42 
 
 		 236 aa  155  6e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.77 
 
 		 233 aa  155  7e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1977  DNA-binding response regulator  40.43 
 
 		 229 aa  155  7e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.166768  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0440  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 		 230 aa  154  9e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46550  response regulator  41.1 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0203573  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  40.77 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0359  osmolarity response regulator  41.05 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3871  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.56 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000473157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3369  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 250 aa  153  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.881494  normal  0.845013 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2416  two component transcriptional regulator  40.42 
 
 		 255 aa  154  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0279623 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.53 
 
 		 226 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.77 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.2 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1832  DNA-binding response regulator  41.13 
 
 		 229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.372268  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1975  DNA-binding response regulator  41.13 
 
 		 229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0483655  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2010  DNA-binding response regulator  41.13 
 
 		 229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.93984e-43 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  38.1 
 
 		 236 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.06 
 
 		 226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0260  osmolarity response regulator  40.17 
 
 		 246 aa  152  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.948807  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.41 
 
 		 229 aa  152  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.06 
 
 		 226 aa  152  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0769  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.82 
 
 		 236 aa  152  5e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1827  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 		 227 aa  152  5e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03947  osmolarity response regulator  39.32 
 
 		 240 aa  152  5e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1806  alkaline phosphatase synthesis response regulator  40.87 
 
 		 229 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000153503  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1789  alkaline phosphatase synthesis response regulator  40.87 
 
 		 229 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.11323  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0875  two component transcriptional regulator  38.53 
 
 		 242 aa  152  5.9999999999999996e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000486966  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3061  two component transcriptional regulator  39.66 
 
 		 227 aa  151  7e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.799336  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4665  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.99 
 
 		 235 aa  151  7e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  0.209776 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  37.92 
 
 		 231 aa  151  7e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  34.05 
 
 		 229 aa  151  7e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  37.39 
 
 		 236 aa  151  8e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  39.22 
 
 		 225 aa  151  8e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.26 
 
 		 238 aa  151  8e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  39.3 
 
 		 230 aa  151  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.45 
 
 		 243 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.45 
 
 		 243 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.53 
 
 		 224 aa  151  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  38.77 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.09 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4338  osmolarity response regulator  40.52 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  39.21 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31270  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  39.39 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.014564  normal  0.249814 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4206  osmolarity response regulator  40.52 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3400  two component transcriptional regulator  38.77 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105495  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4134  osmolarity response regulator  40.52 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  39.74 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4633  osmolarity response regulator  40.09 
 
 		 241 aa  149  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  39.91 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>