More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3040 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3040  D-glutamate deacylase  100 
 
 
481 aa  988    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.236527  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1820  D-glutamate deacylase  42.71 
 
 
497 aa  377  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09918  D-glutamate deacylase  37.29 
 
 
493 aa  353  2.9999999999999997e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6703  D-glutamate deacylase  33.87 
 
 
497 aa  264  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.103433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6214  D-glutamate deacylase  36.53 
 
 
490 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.786735 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1852  D-aminoacylase domain protein  33.26 
 
 
456 aa  225  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000129758  normal  0.0198034 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3031  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.76 
 
 
525 aa  202  9.999999999999999e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  31.62 
 
 
530 aa  199  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3836  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase/D-alanyl-D-alanine-endopeptidase  27.34 
 
 
1076 aa  171  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1358  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.76 
 
 
534 aa  170  7e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6759  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.43 
 
 
516 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0363476  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0178  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  28.54 
 
 
475 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2389  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  28.54 
 
 
475 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2309  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  28.54 
 
 
475 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2770  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  28.54 
 
 
475 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0263  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.54 
 
 
533 aa  154  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1467  N-acyl-D-amino-acid deacylase  26.25 
 
 
565 aa  154  4e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0723  amidohydrolase  29.44 
 
 
485 aa  154  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43512  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06353  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  27.71 
 
 
481 aa  154  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2753  Amidohydrolase 3  25.88 
 
 
530 aa  153  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.93 
 
 
477 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0310888  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0559  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.13 
 
 
493 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0926  D-aminoacylase  30.52 
 
 
490 aa  152  8.999999999999999e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.888276  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1862  D-aminoacylase domain-containing protein  30.27 
 
 
493 aa  152  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.555174  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0720  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.98 
 
 
547 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.066305 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2657  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.92 
 
 
493 aa  151  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2609  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.47 
 
 
651 aa  151  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2790  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.92 
 
 
493 aa  151  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4058  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.4 
 
 
493 aa  150  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3714  D-aminoacylase domain protein  29.31 
 
 
486 aa  149  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0656167 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0091  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.5 
 
 
499 aa  149  8e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.64957  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0366  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.95 
 
 
495 aa  149  8e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2766  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.67 
 
 
493 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0837  D-aminoacylase  27.69 
 
 
493 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0658  N-acyl-D-aspartate deacylase  27.69 
 
 
493 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.227387  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0674  N-acyl-D-aspartate deacylase  27.69 
 
 
493 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0546  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  27.69 
 
 
493 aa  147  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2128  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.52 
 
 
493 aa  148  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2740  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.52 
 
 
493 aa  148  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4361  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.97 
 
 
531 aa  147  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500767  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0415  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.54 
 
 
491 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6068  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.15 
 
 
493 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5117  N-acyl-D-amino acid deacylase family protein  28.12 
 
 
504 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0663  dihydroorotase  28.81 
 
 
493 aa  145  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0641  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.84 
 
 
493 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.34 
 
 
486 aa  144  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4896  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  27.86 
 
 
480 aa  141  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.591808  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5093  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.39 
 
 
494 aa  141  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00480971  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.33 
 
 
478 aa  141  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.602072  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4195  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.91 
 
 
494 aa  140  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4305  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.91 
 
 
494 aa  140  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1302  dihydroorotase  26.58 
 
 
533 aa  139  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0050942  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4959  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.33 
 
 
478 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.555934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5575  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.31 
 
 
534 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6029  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.32 
 
 
491 aa  139  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140081  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5030  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.3 
 
 
478 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  normal  0.647601 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5254  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.1 
 
 
478 aa  137  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1187  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  28.97 
 
 
494 aa  137  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.826213  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3337  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.1 
 
 
478 aa  136  8e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.198805  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5481  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.75 
 
 
529 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3298  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.77 
 
 
548 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0927  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.07 
 
 
499 aa  133  6e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3978  N-acyl-D-glutamate deacylase  27.26 
 
 
534 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2691  amidohydrolase family protein  25.19 
 
 
523 aa  131  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  26.65 
 
 
529 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0978  N-acyl-D-amino-acid deacylase  26.84 
 
 
488 aa  130  6e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2530  N-acyl-D-aspartate deacylase  26.28 
 
 
522 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.296499 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4772  D-aminoacylase  26.35 
 
 
487 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911342  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1552  N-acyl-D-glutamate deacylase  29.98 
 
 
507 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3331  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.37 
 
 
493 aa  128  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1221  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.81 
 
 
490 aa  127  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4020  N-acyl-D-amino-acid deacylase  26.56 
 
 
487 aa  125  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.24 
 
 
479 aa  124  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4816  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.79 
 
 
484 aa  120  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3252  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.25 
 
 
527 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.516885  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1130  N-acyl-D-glutamate deacylase  26.38 
 
 
499 aa  119  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000145932 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00370  D-aminoacylase, putative  26.42 
 
 
557 aa  116  8.999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  24.19 
 
 
848 aa  113  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3660  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.31 
 
 
532 aa  110  7.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0822791  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  24.9 
 
 
511 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  0.0756976 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1501  N-acyl-D-glutamate deacylase  25.85 
 
 
487 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5490  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.32 
 
 
532 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250149  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1032  N-acyl-D-amino-acid deacylase  44.93 
 
 
545 aa  97.8  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.396344 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3947  N-acyl-D-glutamate deacylase  24.08 
 
 
546 aa  96.7  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.291331  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08310  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  25.24 
 
 
558 aa  90.9  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.575602  normal  0.0585768 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2958  N-acyl-D-amino-acid deacylase  44.35 
 
 
528 aa  90.1  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0069  Amidohydrolase 3  25.05 
 
 
539 aa  89.4  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04600  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  39.39 
 
 
620 aa  89  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3006  Amidohydrolase 3  43.24 
 
 
533 aa  82.8  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1417  dihydroorotase  37.5 
 
 
558 aa  79.7  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  27.56 
 
 
425 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  26.56 
 
 
425 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  38.33 
 
 
534 aa  70.5  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  26.32 
 
 
424 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2980  D-aminoacylase domain protein  38.98 
 
 
528 aa  70.1  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.572399  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  26.24 
 
 
429 aa  68.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2578  phenylhydantoinase  26.33 
 
 
478 aa  68.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0965  dihydroorotase (DHOase)  25.39 
 
 
426 aa  68.6  0.0000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3699  dihydroorotase  30.69 
 
 
425 aa  67.8  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.52 
 
 
425 aa  67.4  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>