53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1184 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1184  transcriptional regulator, CdaR  100 
 
 		 555 aa  1081    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000481254 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1107  purine catabolism PurC domain-containing protein  64.25 
 
 		 565 aa  676    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.166611  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  31.73 
 
 		 535 aa  160  6e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2240  transcriptional regulator, PucR family  33.11 
 
 		 531 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227847  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  29.53 
 
 		 485 aa  99  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  32 
 
 		 483 aa  90.1  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  34.24 
 
 		 486 aa  88.2  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  35.54 
 
 		 445 aa  85.9  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 502 aa  84.7  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  34.34 
 
 		 558 aa  78.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  33.83 
 
 		 598 aa  77.8  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  29.89 
 
 		 481 aa  76.3  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  27.34 
 
 		 501 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  34.65 
 
 		 505 aa  62.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  28.69 
 
 		 543 aa  63.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1423  transcriptional regulator, PucR family  34.41 
 
 		 456 aa  61.2  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal  0.788034 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  32.24 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.24 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 517 aa  58.2  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 412 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  32.79 
 
 		 519 aa  56.2  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1722  transcriptional regulator, PucR family  42.59 
 
 		 502 aa  56.2  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1307  transcriptional regulator, PucR family  29.66 
 
 		 491 aa  55.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  28.85 
 
 		 478 aa  53.9  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.46 
 
 		 459 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2065  transcriptional regulator, PucR family  30.25 
 
 		 549 aa  51.6  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 516 aa  50.4  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  27.56 
 
 		 480 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4276  CdaR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 552 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.416478  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  23.7 
 
 		 740 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  32.43 
 
 		 454 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3698  CdaR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 549 aa  47.4  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0012  polyketide synthase expression regulator  31.53 
 
 		 500 aa  47  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 552 aa  46.6  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  34.58 
 
 		 501 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  27.34 
 
 		 504 aa  46.6  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3298  transcriptional regulator, CdaR  27.16 
 
 		 582 aa  47  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  26.4 
 
 		 487 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2909  CdaR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 374 aa  45.8  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2205  putative transcriptional regulator, PucR family  35.14 
 
 		 505 aa  46.2  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0290612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  25.12 
 
 		 528 aa  46.2  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  27.5 
 
 		 486 aa  45.8  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 429 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4880  putative transcriptional regulator, PucR family  29.14 
 
 		 522 aa  45.4  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 429 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1274  putative transcriptional regulator, PucR family  33.57 
 
 		 420 aa  45.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 429 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  38.6 
 
 		 561 aa  44.7  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  30.17 
 
 		 400 aa  44.3  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  25 
 
 		 520 aa  43.9  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  35.38 
 
 		 558 aa  43.9  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  26.92 
 
 		 520 aa  43.9  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2691  transcriptional regulator, CdaR  31.65 
 
 		 365 aa  43.5  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>