More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1874 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1874  response regulator receiver protein  100 
 
 
320 aa  631  1e-180  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.420153  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3661  response regulator receiver protein  44.54 
 
 
120 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442071  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0131  response regulator receiver  41.18 
 
 
132 aa  106  5e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  42.02 
 
 
121 aa  105  9e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  38.02 
 
 
124 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0150  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  42.11 
 
 
1177 aa  104  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  39.5 
 
 
121 aa  104  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  40.34 
 
 
121 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  38.52 
 
 
122 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  38.52 
 
 
122 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.01 
 
 
310 aa  101  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5307  response regulator receiver domain-containing protein  39.17 
 
 
121 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0137607  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 
1907 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  35.54 
 
 
121 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  35.54 
 
 
121 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  43.22 
 
 
161 aa  101  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3767  response regulator receiver protein  38.84 
 
 
130 aa  100  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.401563  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  36.97 
 
 
121 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  38.79 
 
 
125 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1498  two component transcriptional regulator  37.9 
 
 
247 aa  99.4  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220919  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5033  type IV pilus response regulator PilH  38.33 
 
 
121 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3637  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.9 
 
 
246 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4937  two component transcriptional regulator  38.71 
 
 
257 aa  98.6  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0404  response regulator receiver protein  37.5 
 
 
121 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  39.17 
 
 
1960 aa  98.2  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
225 aa  98.2  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0489  response regulator receiver  38.33 
 
 
121 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.646514  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3634  response regulator receiver domain-containing protein  39.34 
 
 
131 aa  97.4  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.185946  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 
1974 aa  97.4  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  36.07 
 
 
2476 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  34.5 
 
 
225 aa  96.7  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  36.51 
 
 
1866 aa  96.7  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0599  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.06 
 
 
313 aa  96.7  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.464892  normal  0.548622 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3633  response regulator receiver domain-containing protein  41.88 
 
 
120 aa  96.3  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480345  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  40.71 
 
 
231 aa  96.7  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3468  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40 
 
 
412 aa  96.3  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2061  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.5 
 
 
318 aa  96.3  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365539  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3924  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.5 
 
 
443 aa  96.3  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350169  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  35.83 
 
 
2458 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3221  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.5 
 
 
443 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0497788 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02441  two-component response regulator  39.02 
 
 
242 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72299  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1537  two component LuxR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
242 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2384  response regulator receiver protein  39.83 
 
 
123 aa  95.1  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  40 
 
 
121 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.02 
 
 
235 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1834  response regulator receiver protein  39.83 
 
 
123 aa  95.5  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00302805 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.2 
 
 
1426 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5207  winged helix family two component transcriptional regulator  37.1 
 
 
247 aa  95.5  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03422  hypothetical protein  39.52 
 
 
1128 aa  95.1  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2400  response regulator receiver protein  42.11 
 
 
135 aa  95.5  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.726464 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  40 
 
 
121 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  38.26 
 
 
120 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  40 
 
 
121 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2904  response regulator receiver protein  38.39 
 
 
137 aa  94.7  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002587  chitin catabolic cascade sensor histidine kinase ChiS  38.71 
 
 
1111 aa  94.4  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3898  response regulator receiver  41.53 
 
 
121 aa  94  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.22 
 
 
216 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0509  twitching motility protein PilH  36.67 
 
 
121 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.22 
 
 
216 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.04 
 
 
212 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1246  CheA signal transduction histidine kinases  36.13 
 
 
1643 aa  94  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0708097  normal  0.755815 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02637  regulatory protein PilH family  39.02 
 
 
128 aa  94.4  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2101  response regulator receiver domain-containing protein  39.47 
 
 
125 aa  94  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05330  twitching motility protein PilH  36.67 
 
 
121 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1818  two component reponse regulator  39.47 
 
 
125 aa  93.6  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1873  response regulator receiver  41.46 
 
 
326 aa  93.6  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  38.02 
 
 
215 aa  93.6  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1789  response regulator receiver protein  37.19 
 
 
128 aa  93.2  5e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2575  chitin degradation sensor protein  38.71 
 
 
1127 aa  93.2  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1724  response regulator receiver protein  37.19 
 
 
128 aa  93.2  5e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.999633  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.98 
 
 
247 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1963  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.29 
 
 
246 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.470012 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  37.5 
 
 
121 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.84 
 
 
243 aa  92.8  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.65 
 
 
326 aa  93.2  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.84 
 
 
243 aa  92.8  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3768  response regulator receiver protein  37.5 
 
 
120 aa  93.2  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48045  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1936  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.29 
 
 
246 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  37.6 
 
 
243 aa  92.8  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1500  two component transcriptional regulator  37.9 
 
 
248 aa  92.8  7e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  38.71 
 
 
619 aa  92.8  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5215  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.59 
 
 
217 aa  92.4  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02061  two-component response regulator  37.9 
 
 
248 aa  92.4  8e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.540525 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3186  twitching motility protein  38.39 
 
 
2092 aa  92.8  8e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0988113  normal  0.323736 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0436  response regulator receiver protein  34.09 
 
 
370 aa  92.8  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26531  two-component response regulator  37.7 
 
 
248 aa  92.4  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0241  response regulator receiver protein  38.98 
 
 
123 aa  92.4  9e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  42.4 
 
 
1427 aa  92.4  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4952  response regulator receiver protein  40.68 
 
 
317 aa  92.4  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0820  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.02 
 
 
593 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01511  two-component response regulator  37.9 
 
 
248 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  37.01 
 
 
1956 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0849  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.02 
 
 
593 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.386146  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  38.58 
 
 
230 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0136  two component transcriptional regulator  38.52 
 
 
248 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3688  response regulator receiver protein  39.68 
 
 
133 aa  92  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478813  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0472  response regulator receiver protein  40.71 
 
 
133 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01871  two-component response regulator  39.52 
 
 
242 aa  92  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  40.17 
 
 
121 aa  92  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.52 
 
 
236 aa  92  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>