102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1365 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1365  DoxX family protein  100 
 
 
139 aa  270  5.000000000000001e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0662293  normal  0.0953632 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2081  DoxX family protein  54.81 
 
 
135 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2877  DoxX family protein  53.62 
 
 
136 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2379  DoxX family protein  48.76 
 
 
121 aa  100  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.618537  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3329  DoxX family protein  51.47 
 
 
134 aa  100  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2817  DoxX family protein  49.46 
 
 
138 aa  89.4  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3707  DoxX family protein  45.13 
 
 
149 aa  86.7  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4104  DoxX family protein  47.06 
 
 
138 aa  79.3  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434829  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0630  DoxX family protein  36.13 
 
 
140 aa  73.6  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.470761  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2251  DoxX family protein  40.59 
 
 
146 aa  73.2  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.431284  normal  0.139813 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2087  DoxX  38.53 
 
 
119 aa  68.2  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  34.75 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  37.74 
 
 
135 aa  67.4  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  35.65 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  35.65 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7619  DoxX  36.7 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5753  DoxX  34.86 
 
 
137 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6117  DoxX family protein  34.86 
 
 
137 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.111641 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6600  DoxX family protein  34.86 
 
 
137 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.563715 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0868  DoxX family protein  36.63 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.879404  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1200  DoxX  37.5 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  32.17 
 
 
137 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  31.3 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3552  DoxX family protein  37.62 
 
 
137 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583897  normal  0.164311 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  31.3 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2500  hypothetical protein  31.82 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  0.0755951 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  31.3 
 
 
137 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4121  DoxX  30.97 
 
 
129 aa  57  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.575367  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1986  DoxX family protein  37.96 
 
 
137 aa  57  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.338792  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  35.85 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  29.57 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1786  DoxX family protein  37.04 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0867  membrane protein yphA  33.04 
 
 
152 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2564  DoxX family protein  35.85 
 
 
137 aa  55.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5841  DoxX  31.9 
 
 
134 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2109  DoxX  28.46 
 
 
150 aa  55.5  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  32.17 
 
 
127 aa  55.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3205  DoxX family protein  36.52 
 
 
137 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2930  DoxX family protein  36.36 
 
 
137 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3973  DoxX family protein  35.96 
 
 
135 aa  53.9  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2360  DoxX family protein  31.3 
 
 
136 aa  53.9  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.233009 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2074  DoxD-like family protein  32.2 
 
 
145 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480184  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1422  DoxX family protein  46.59 
 
 
149 aa  53.5  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0099  DoxX family protein  33.33 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00508391  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3132  DoxX family protein  29.82 
 
 
143 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0701  DoxX family protein  32.48 
 
 
128 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0302  DoxX family protein  34.19 
 
 
136 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0320339 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  30.25 
 
 
137 aa  52.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  30.7 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2855  DoxX family protein  29.66 
 
 
379 aa  52  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1637  DoxX  33.93 
 
 
137 aa  52  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00123238  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2900  DoxX  34.17 
 
 
136 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290679  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1542  DoxX  30.63 
 
 
129 aa  51.6  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294668  normal  0.482647 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3877  hypothetical protein  28.26 
 
 
151 aa  51.2  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52615  normal  0.304969 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  30.33 
 
 
137 aa  51.6  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  29.57 
 
 
149 aa  51.6  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3348  DoxX  32.69 
 
 
146 aa  50.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0716703  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4295  hypothetical protein  35.34 
 
 
140 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.023682 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5222  DoxX family protein  30 
 
 
144 aa  50.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2341  DoxX  29.03 
 
 
152 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201028  normal  0.120907 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4280  hypothetical protein  34.55 
 
 
128 aa  48.1  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.92358  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3403  DoxX family protein  37.66 
 
 
276 aa  48.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351564  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  38.82 
 
 
131 aa  48.1  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2205  DoxX  33.91 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000990864  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4094  hypothetical protein  31.06 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.887917  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2136  DoxX family protein  36.78 
 
 
164 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.289686 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2764  DoxX family protein  30.91 
 
 
136 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2535  DoxX  33.03 
 
 
136 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.275634  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2498  DoxX  26.36 
 
 
149 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3021  DoxX family protein  27.78 
 
 
133 aa  47.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867125  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  35.71 
 
 
136 aa  47  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0512  DoxX family protein  30.09 
 
 
138 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0809066 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  27.27 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1701  DoxX family protein  32.23 
 
 
174 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00286745  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  27.27 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2298  DoxX family protein  30.09 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000018841  hitchhiker  0.00171371 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0467  DoxX family protein  30.43 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.123633  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0860  DoxX  26.32 
 
 
136 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2035  normal  0.169459 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3130  DoxX family protein  37.66 
 
 
315 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.470972  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2151  transporter  32.46 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.447191  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3451  DoxX family protein  31.01 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182426  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3623  DoxX family protein  31.86 
 
 
174 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  0.0330424 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4441  DoxX family protein  30.97 
 
 
129 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.147857  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4661  DoxX family protein  32.56 
 
 
145 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526141  normal  0.512029 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2517  DoxX  37.66 
 
 
321 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2562  DoxX family protein  37.66 
 
 
321 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2554  DoxX family protein  37.66 
 
 
321 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225464  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3474  DoxX family protein  35.59 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.418038 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2221  DoxX family protein  27.1 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.631105 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39020  predicted membrane protein  34.78 
 
 
238 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2382  DoxX family protein  33 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5054  DoxX family protein  32.81 
 
 
181 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47840  DoxX-like protein  31.36 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18970  predicted membrane protein  28.1 
 
 
236 aa  42.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.129095  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2574  DoxX  36.52 
 
 
136 aa  41.6  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.404201  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0296  DoxX family protein  32.17 
 
 
271 aa  41.6  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3035  DoxX family protein  24.78 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156785  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0449  DoxX family protein  36.21 
 
 
182 aa  41.2  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3428  DoxX family protein  33.62 
 
 
175 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.315995  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1932  DoxX family protein  30.28 
 
 
137 aa  40.8  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.486729 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>