More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0872 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0872  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
140 aa  278  2e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000611849  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0402  transcriptional regulator, AsnC family  47.86 
 
 
143 aa  143  8.000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0865  AsnC family transcriptional regulator  47.14 
 
 
140 aa  140  6e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.271014  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0150  AsnC family transcriptional regulator  47.14 
 
 
167 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0459  AsnC family transcriptional regulator  49.29 
 
 
140 aa  131  1.9999999999999998e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.531028  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0448  AsnC family transcriptional regulator  49.29 
 
 
140 aa  130  6e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1531  AsnC family transcriptional regulator  49.29 
 
 
140 aa  129  9e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0388  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 
140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.298931 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0889  transcriptional regulator, AsnC family  41.79 
 
 
142 aa  114  5e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.853519  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1446  transcriptional regulator, AsnC family  39.55 
 
 
142 aa  113  7.999999999999999e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2379  transcriptional regulator, AsnC family  40.3 
 
 
142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2846  transcriptional regulator, AsnC family  40.44 
 
 
142 aa  110  5e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00639698  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2162  transcriptional regulator, AsnC family  38.57 
 
 
142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  38.58 
 
 
156 aa  90.1  9e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2732  AsnC family transcriptional regulator  34.85 
 
 
157 aa  87.8  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 
155 aa  82  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5648  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 
140 aa  80.5  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.377862 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  33.59 
 
 
167 aa  80.1  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  34.97 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19100  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.29 
 
 
155 aa  79.3  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000170576  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6860  AsnC family transcriptional regulator  29.71 
 
 
485 aa  75.5  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.745549  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0417  AsnC family transcriptional regulator  34.68 
 
 
153 aa  73.9  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2269  transcriptional regulator, AsnC family  31.16 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921895  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.23 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000470477  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1076  transcriptional regulator, AsnC family  30.43 
 
 
167 aa  73.2  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.23 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.402412  normal  0.678119 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4215  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.23 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000923304  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  26.56 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0972  AsnC family transcriptional regulator  31.88 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.109068  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1811  AsnC family transcriptional regulator  27.14 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2273  AsnC family transcriptional regulator  31.88 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  28.68 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1625  AsnC family transcriptional regulator  31.78 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000585633  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  27.86 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2085  AsnC family transcriptional regulator  31.88 
 
 
193 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2141  AsnC family transcriptional regulator  31.88 
 
 
193 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1991  AsnC family transcriptional regulator  30.43 
 
 
152 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158914  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0354  transcriptional regulator, AsnC family  27.69 
 
 
338 aa  70.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1441  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.46 
 
 
150 aa  70.5  0.000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  43.48 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2305  AsnC family transcriptional regulator  31.88 
 
 
295 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2919  AsnC family transcriptional regulator  34.81 
 
 
154 aa  70.5  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0951  AsnC/Lrp family regulatory protein  29.13 
 
 
171 aa  70.5  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1906  AsnC family transcriptional regulator  31.01 
 
 
156 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.424603  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  31.01 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3982  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.69 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1646  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  26.21 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3111  transcriptional regulator, AsnC family  29.29 
 
 
296 aa  69.7  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1135  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.118615  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5021  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0987272 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1534  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1738  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6354  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0970  AsnC family transcriptional regulator  29.1 
 
 
167 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1724  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4906  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.92 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  hitchhiker  0.000490685 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4182  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.46 
 
 
154 aa  69.3  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146575  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00360  transcription regulator protein  32.14 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164175  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4246  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.46 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3553  AsnC family transcriptional regulator  32.52 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03627  DNA-binding transcriptional dual regulator  28.78 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0735302  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4224  transcriptional regulator, AsnC family  28.78 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4178  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.78 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0542256  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5179  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.78 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000121129  normal  0.124377 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  30.43 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1202  AsnC family transcriptional regulator  32.62 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.718344  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.36 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4251  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.78 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0324749 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  29.55 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1646  AsnC family transcriptional regulator  30.43 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3959  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.78 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0277733  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03571  hypothetical protein  28.78 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108686  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4259  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.78 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0444894  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2944  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.46 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4111  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.78 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00357287  normal  0.0580039 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2443  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.46 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0893  AsnC family transcriptional regulator  29.13 
 
 
171 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.518321  normal  0.419267 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4536  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.69 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.191553  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3230  AsnC family transcriptional regulator  29.13 
 
 
162 aa  67.4  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0684  AsnC family transcriptional regulator  31.36 
 
 
164 aa  67.4  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.465795  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2925  transcriptional regulator, AsnC family  31.39 
 
 
141 aa  67  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.820892  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1494  transcriptional regulator, AsnC family  26.56 
 
 
162 aa  67.4  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5594  transcriptional regulator, AsnC family  30.5 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1244  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2639  putative transcriptional regulator  28.89 
 
 
164 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  28.99 
 
 
155 aa  67  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  29.46 
 
 
158 aa  67  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.147044 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2860  transcriptional regulator, AsnC family  29.29 
 
 
155 aa  67  0.00000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.41994  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4332  AsnC family transcriptional regulator  28.37 
 
 
164 aa  67  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4209  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.06 
 
 
152 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.373389  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0104  transcriptional regulator, AsnC family  26.98 
 
 
148 aa  67  0.00000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274571  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4103  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.06 
 
 
152 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038241  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0833  transcriptional regulator, AsnC family  27.86 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4268  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.06 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420279  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.36 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.61 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2217  AsnC family transcriptional regulator  28.28 
 
 
157 aa  66.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0872223  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3479  AsnC family transcriptional regulator  28.37 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623546  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>