More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0695 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0695  homoaconitate hydratase family protein  100 
 
 
409 aa  838    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1364  homoaconitate hydratase family protein  43.91 
 
 
426 aa  319  6e-86  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1630  3-isopropylmalate dehydratase  39.56 
 
 
418 aa  296  5e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1100  3-isopropylmalate dehydratase  38.01 
 
 
418 aa  286  5e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2075  3-isopropylmalate dehydratase  38.83 
 
 
416 aa  285  8e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0621  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.76 
 
 
418 aa  282  7.000000000000001e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0188797  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0519  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.24 
 
 
424 aa  282  8.000000000000001e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000192959  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1704  homoaconitate hydratase family protein  36.89 
 
 
419 aa  281  1e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0402  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.23 
 
 
418 aa  281  1e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.344506 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2259  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  40.77 
 
 
421 aa  279  5e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000792323  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0646  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.52 
 
 
418 aa  280  5e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00455068  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2017  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.61 
 
 
419 aa  279  6e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1191  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  39.28 
 
 
424 aa  276  5e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2338  homoaconitate hydratase family protein  37.11 
 
 
418 aa  275  8e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0990  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.86 
 
 
423 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0724  homoaconitate hydratase family protein  39.23 
 
 
418 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.694886  normal  0.102444 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0383  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.76 
 
 
417 aa  273  3e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2263  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.02 
 
 
413 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0195  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.95 
 
 
421 aa  273  6e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0289  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.72 
 
 
425 aa  272  7e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0366  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.52 
 
 
417 aa  272  1e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1194  homoaconitate hydratase family protein  38.04 
 
 
418 aa  271  2e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1588  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  39.13 
 
 
419 aa  271  2e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2194  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.85 
 
 
421 aa  269  5e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.454447  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0471  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.38 
 
 
424 aa  268  1e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.699773  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2167  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.13 
 
 
431 aa  267  2e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0098  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  38.52 
 
 
418 aa  268  2e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0436  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.38 
 
 
424 aa  268  2e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.560563  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0399  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.14 
 
 
424 aa  265  1e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.320252  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1466  homoaconitate hydratase family protein  36.39 
 
 
429 aa  265  2e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0167474  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2762  3-isopropylmalate dehydratase  37.29 
 
 
413 aa  263  3e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.452591  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0788  3-isopropylmalate dehydratase  42 
 
 
382 aa  263  3e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0376  3-isopropylmalate dehydratase  37.07 
 
 
416 aa  263  4e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1520  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.9 
 
 
424 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.984893  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0129  homoaconitate hydratase family protein  36.47 
 
 
418 aa  263  4.999999999999999e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.525388  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2485  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.55 
 
 
424 aa  262  6.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.836058  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0476  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  39.61 
 
 
431 aa  261  1e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0146744  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0448  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.08 
 
 
417 aa  260  3e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0608  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.37 
 
 
421 aa  259  5.0000000000000005e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0311  3-isopropylmalate dehydratase  37.53 
 
 
421 aa  258  1e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1961  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  40.29 
 
 
413 aa  258  1e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.344282  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0124  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.65 
 
 
419 aa  258  2e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0596  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.71 
 
 
420 aa  257  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000659262  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0741  homoaconitate hydratase family protein  36.34 
 
 
432 aa  258  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375835  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0789  homoaconitate hydratase family protein  37.08 
 
 
418 aa  257  3e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_390  aconitase/homoaconitase/3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  35.84 
 
 
417 aa  256  5e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0185  homoaconitate hydratase family protein  35.68 
 
 
419 aa  256  6e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.576372  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0425  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.84 
 
 
431 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2361  homoaconitate hydratase family protein  36.65 
 
 
417 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.859627 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1030  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.45 
 
 
431 aa  254  2.0000000000000002e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000620705 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1102  3-isopropylmalate dehydratase  36.36 
 
 
437 aa  253  4.0000000000000004e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1458  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.99 
 
 
419 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.888399  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0420  3-isopropylmalate dehydratase  37.29 
 
 
422 aa  253  6e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0665356 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1949  homoaconitate hydratase family protein  37.05 
 
 
417 aa  252  7e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0286  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.35 
 
 
418 aa  251  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1883  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.17 
 
 
428 aa  250  3e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2254  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.41 
 
 
421 aa  249  5e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2211  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.2 
 
 
419 aa  249  7e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00871543  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0356  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.51 
 
 
420 aa  248  1e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.928431  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1610  homoaconitate hydratase family protein  35.44 
 
 
417 aa  248  1e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3219  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.27 
 
 
418 aa  248  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1366  3-isopropylmalate dehydratase  34.54 
 
 
420 aa  247  3e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2220  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  34.22 
 
 
415 aa  246  4.9999999999999997e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2101  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  38.7 
 
 
429 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0493977  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0390  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.02 
 
 
419 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0110  homoaconitate hydratase family protein  35.76 
 
 
435 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1900  3-isopropylmalate dehydratase  34.82 
 
 
431 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3516  3-isopropylmalate dehydratase  34.95 
 
 
410 aa  243  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0737  homoaconitate hydratase family protein  35.21 
 
 
431 aa  243  6e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0126  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.11 
 
 
419 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10870  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  37.23 
 
 
420 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0601  3-isopropylmalate dehydratase  35.06 
 
 
431 aa  240  4e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04370  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  35.51 
 
 
423 aa  239  4e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0506  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.62 
 
 
420 aa  239  5e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0227  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  37.11 
 
 
421 aa  239  5e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0848  homoaconitate hydratase family protein  34.59 
 
 
431 aa  239  5e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.288921  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1053  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.17 
 
 
421 aa  238  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0607  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  37.83 
 
 
392 aa  238  1e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.181914 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3474  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.41 
 
 
419 aa  238  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0568206  hitchhiker  0.00508785 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1742  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.99 
 
 
420 aa  238  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.482523  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1167  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.77 
 
 
415 aa  238  2e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1792  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.4 
 
 
418 aa  237  2e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.602442 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0634  3-isopropylmalate dehydratase  36.5 
 
 
403 aa  236  4e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0544933  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0828  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.59 
 
 
416 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1693  homoaconitate hydratase family protein  34.1 
 
 
424 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27842  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2159  3-isopropylmalate dehydratase  33.09 
 
 
398 aa  233  4.0000000000000004e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.219475 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0233  hypothetical protein  36.68 
 
 
417 aa  233  5e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3302  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.37 
 
 
421 aa  233  6e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.879653  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_732  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  35.42 
 
 
417 aa  232  8.000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.999081  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0738  homoaconitate hydratase family protein  33.41 
 
 
432 aa  231  1e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0015  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.8 
 
 
418 aa  231  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2175  homoaconitate hydratase family protein  33.41 
 
 
431 aa  231  2e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2142  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.47 
 
 
419 aa  229  5e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.245729  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0747  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.19 
 
 
416 aa  229  7e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1036  homoaconitate hydratase family protein  31.96 
 
 
418 aa  229  7e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1156  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.44 
 
 
419 aa  229  9e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.369104 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1800  3-isopropylmalate dehydratase  34.36 
 
 
404 aa  228  1e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.947019  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2143  3-isopropylmalate dehydratase  34.47 
 
 
406 aa  228  2e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0275  3-isopropylmalate dehydratase  34.47 
 
 
415 aa  227  3e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.772667  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3602  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.45 
 
 
417 aa  227  3e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.187655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>