More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2312 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2312  hypothetical protein  100 
 
 
330 aa  665    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258984 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1641  hypothetical protein  70.57 
 
 
328 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.502422  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4195  hypothetical protein  70.1 
 
 
331 aa  436  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5055  extra-cytoplasmic solute receptor  44.21 
 
 
322 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4497  twin-arginine translocation pathway signal  43.2 
 
 
322 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0693  hypothetical protein  40.96 
 
 
320 aa  218  7.999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  39.87 
 
 
348 aa  215  9e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4969  extra-cytoplasmic solute receptor  42 
 
 
364 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.332662  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  39.46 
 
 
331 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3165  hypothetical protein  44.72 
 
 
325 aa  210  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.209597  hitchhiker  0.0000237032 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0108  hypothetical protein  40.07 
 
 
332 aa  210  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251449 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6345  hypothetical protein  38.56 
 
 
330 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  38.49 
 
 
325 aa  205  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1680  hypothetical protein  41.26 
 
 
330 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  39.79 
 
 
326 aa  203  4e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  37.66 
 
 
331 aa  202  5e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  38.51 
 
 
326 aa  202  6e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4337  extra-cytoplasmic solute receptor  37.38 
 
 
335 aa  202  9e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  39.66 
 
 
334 aa  202  9e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  39.19 
 
 
337 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5203  hypothetical protein  36.45 
 
 
332 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  36.57 
 
 
322 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5251  hypothetical protein  39.06 
 
 
338 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0125  hypothetical protein  39.25 
 
 
332 aa  199  5e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3056  hypothetical protein  38.33 
 
 
332 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176831  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  40.33 
 
 
328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0441  hypothetical protein  39.46 
 
 
322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0368157  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3086  hypothetical protein  36.75 
 
 
332 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  36.14 
 
 
330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  36.82 
 
 
345 aa  196  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  36.15 
 
 
330 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  36.82 
 
 
345 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  36.04 
 
 
327 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1098  hypothetical protein  37.58 
 
 
339 aa  196  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  37.32 
 
 
330 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  34.53 
 
 
325 aa  196  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  37.54 
 
 
346 aa  195  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5147  extra-cytoplasmic solute receptor  37.67 
 
 
320 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.698563  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  35.89 
 
 
339 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3785  hypothetical protein  39.54 
 
 
362 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141562  normal  0.251227 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  36.99 
 
 
335 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  34.42 
 
 
330 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5949  hypothetical protein  40.72 
 
 
324 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011365  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  38.23 
 
 
324 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  38.08 
 
 
327 aa  193  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  37.62 
 
 
326 aa  192  7e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  34.53 
 
 
330 aa  192  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  35.83 
 
 
329 aa  192  7e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1021  hypothetical protein  36.52 
 
 
323 aa  192  8e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.345353  normal  0.559311 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  35.37 
 
 
338 aa  192  9e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  36.99 
 
 
336 aa  192  9e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0350  hypothetical protein  38.18 
 
 
336 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  36.92 
 
 
334 aa  191  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  36.25 
 
 
324 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  38.08 
 
 
327 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  38.11 
 
 
337 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  35.71 
 
 
328 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  37.59 
 
 
332 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  39.93 
 
 
347 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1931  hypothetical protein  36.51 
 
 
329 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4992  hypothetical protein  38.72 
 
 
333 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0110205  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5492  hypothetical protein  38.78 
 
 
329 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2519  hypothetical protein  38.83 
 
 
324 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0125  hypothetical protein  39.58 
 
 
331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5153  extra-cytoplasmic solute receptor  35.28 
 
 
329 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.415379 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2903  hypothetical protein  33.96 
 
 
327 aa  189  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  36.77 
 
 
328 aa  190  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0450  hypothetical protein  38.44 
 
 
322 aa  189  4e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.697568  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  40.67 
 
 
333 aa  189  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  37.92 
 
 
325 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1674  hypothetical protein  39.1 
 
 
326 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0696411  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  37.17 
 
 
333 aa  189  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  37.28 
 
 
327 aa  189  7e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3894  hypothetical protein  37.38 
 
 
327 aa  189  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0367386  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  39.62 
 
 
326 aa  188  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  35.49 
 
 
330 aa  189  8e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  38.1 
 
 
327 aa  188  9e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  39.85 
 
 
328 aa  188  9e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  35.19 
 
 
324 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3440  hypothetical protein  35.81 
 
 
330 aa  188  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.026727  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  35 
 
 
325 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  36.12 
 
 
336 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1400  hypothetical protein  38.49 
 
 
337 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  37.21 
 
 
325 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5891  hypothetical protein  34.97 
 
 
327 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  36.19 
 
 
328 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  41.13 
 
 
358 aa  187  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1323  hypothetical protein  34.15 
 
 
333 aa  187  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  34.94 
 
 
318 aa  187  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3420  hypothetical protein  37.5 
 
 
333 aa  187  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467518  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  37.75 
 
 
330 aa  186  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  40.15 
 
 
325 aa  186  4e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  37.75 
 
 
330 aa  186  4e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  39.18 
 
 
339 aa  186  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  36.24 
 
 
321 aa  186  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5574  extra-cytoplasmic solute receptor  37.79 
 
 
330 aa  186  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3214  hypothetical protein  39.06 
 
 
323 aa  186  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3288  hypothetical protein  36.56 
 
 
323 aa  186  6e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0157396  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  36.45 
 
 
334 aa  185  7e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  36.84 
 
 
386 aa  186  7e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>