86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2162 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2162  hypothetical protein  100 
 
 
339 aa  674    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0151001  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2815  hypothetical protein  74.53 
 
 
341 aa  462  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.682313  normal  0.278413 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2304  protein of unknown function DUF58  73.91 
 
 
341 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2097  hypothetical protein  73.11 
 
 
372 aa  445  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3378  protein of unknown function DUF58  64.2 
 
 
323 aa  398  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1218  hypothetical protein  63.47 
 
 
355 aa  390  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.892265  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2385  hypothetical protein  62.15 
 
 
344 aa  376  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2530  hypothetical protein  64.09 
 
 
341 aa  368  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3147  hypothetical protein  62.65 
 
 
337 aa  363  3e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1244  hypothetical protein  59.05 
 
 
336 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2913  hypothetical protein  43.15 
 
 
362 aa  220  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.278272 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1838  hypothetical protein  38.32 
 
 
317 aa  202  5e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0467  hypothetical protein  38.92 
 
 
321 aa  179  8e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3010  protein of unknown function DUF58  36.76 
 
 
333 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29026  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3625  hypothetical protein  36.62 
 
 
316 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  32.31 
 
 
349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2518  hypothetical protein  34.85 
 
 
316 aa  162  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451759  normal  0.113037 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3855  protein of unknown function DUF58  36.56 
 
 
357 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3969  protein of unknown function DUF58  36.56 
 
 
357 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.068653 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1576  hypothetical protein  34.64 
 
 
339 aa  145  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0183217  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2249  hypothetical protein  33.13 
 
 
327 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497774  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  36 
 
 
326 aa  144  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03012  hypothetical protein  36.81 
 
 
352 aa  143  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1324  protein of unknown function DUF58  33.87 
 
 
344 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12431  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1884  hypothetical protein  35.65 
 
 
323 aa  140  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.65449  normal  0.844493 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5566  hypothetical protein  36.88 
 
 
346 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708703  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2369  hypothetical protein  28.3 
 
 
323 aa  139  7e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2075  protein of unknown function DUF58  36.54 
 
 
315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0220521  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2280  hypothetical protein  35.62 
 
 
317 aa  132  9e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2054  hypothetical protein  33.02 
 
 
318 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.285922  normal  0.509055 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2449  hypothetical protein  33.55 
 
 
318 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340294  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1117  hypothetical protein  31.58 
 
 
319 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1211  hypothetical protein  31.58 
 
 
319 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0863  protein of unknown function DUF58  33.54 
 
 
314 aa  114  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.344005  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1863  hypothetical protein  25.38 
 
 
316 aa  112  9e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1872  hypothetical protein  25.53 
 
 
316 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2417  hypothetical protein  28 
 
 
338 aa  103  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479744  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2349  hypothetical protein  27.27 
 
 
417 aa  100  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02437  hypothetical protein  31.39 
 
 
318 aa  99.8  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1944  hypothetical protein  25.29 
 
 
353 aa  99.8  7e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02556  hypothetical protein  25.95 
 
 
374 aa  98.6  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0820  hypothetical protein  28.82 
 
 
323 aa  97.8  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26920  hypothetical protein  32.29 
 
 
318 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1898  hypothetical protein  29.34 
 
 
342 aa  97.4  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2531  hypothetical protein  26.63 
 
 
372 aa  97.4  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1675  hypothetical protein  25.29 
 
 
353 aa  96.3  7e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1878  hypothetical protein  27.49 
 
 
330 aa  94.4  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2777  hypothetical protein  23.51 
 
 
337 aa  94  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668338  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1966  hypothetical protein  26.48 
 
 
329 aa  91.3  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0727  protein of unknown function DUF58  28.52 
 
 
302 aa  91.7  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  31.42 
 
 
943 aa  91.3  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2108  hypothetical protein  30.34 
 
 
354 aa  90.5  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2624  hypothetical protein  25.9 
 
 
329 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.681677  normal  0.0502315 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  28.31 
 
 
267 aa  84  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2151  hypothetical protein  29.38 
 
 
346 aa  84  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2050  hypothetical protein  29.01 
 
 
365 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2288  protein of unknown function DUF58  29.01 
 
 
365 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523334  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2097  hypothetical protein  29.01 
 
 
365 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2276  hypothetical protein  28.7 
 
 
365 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4562  hypothetical protein  28.7 
 
 
365 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2243  hypothetical protein  28.13 
 
 
361 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760307  normal  0.435241 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2127  hypothetical protein  26.23 
 
 
334 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2425  hypothetical protein  29.68 
 
 
276 aa  75.5  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337672  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1855  hypothetical protein  27.83 
 
 
361 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270651  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1777  hypothetical protein  27.52 
 
 
361 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  29.06 
 
 
380 aa  67  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  23.77 
 
 
294 aa  60.8  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1320  protein of unknown function DUF58  25.18 
 
 
275 aa  57.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1522  protein of unknown function DUF58  24.89 
 
 
293 aa  55.1  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  30.19 
 
 
458 aa  51.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2963  protein of unknown function DUF58  24.45 
 
 
275 aa  50.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.023693 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  24.25 
 
 
552 aa  47.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4950  hypothetical protein  34.75 
 
 
449 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4861  hypothetical protein  34.75 
 
 
449 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0629  protein of unknown function DUF58  27.57 
 
 
325 aa  46.2  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0885  protein of unknown function DUF58  30.77 
 
 
413 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5229  hypothetical protein  33.33 
 
 
449 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421211  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2086  protein of unknown function DUF58  24.58 
 
 
384 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1633  hypothetical protein  24.84 
 
 
257 aa  44.3  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447033  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1396  hypothetical protein  27.17 
 
 
405 aa  44.3  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60461  hitchhiker  0.00977716 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2130  protein of unknown function DUF58  24.89 
 
 
384 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  30.38 
 
 
399 aa  43.5  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3417  protein of unknown function DUF58  25.95 
 
 
384 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2536  protein of unknown function DUF58  33.02 
 
 
333 aa  43.1  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  37.63 
 
 
380 aa  42.7  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  25.47 
 
 
424 aa  42.4  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>