More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1868 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1868  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 463 aa  877    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2000  major facilitator superfamily MFS_1  69.76 
 
 		 468 aa  552  1e-156  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0919237  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1703  major facilitator superfamily transporter  69.76 
 
 		 468 aa  554  1e-156  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.824746 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3366  major facilitator transporter  67.26 
 
 		 474 aa  528  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.209391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2896  major facilitator superfamily MFS_1  69.45 
 
 		 476 aa  521  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17584  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3373  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  52.33 
 
 		 474 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0970246  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2436  major facilitator transporter  52.97 
 
 		 455 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2300  major facilitator transporter  52.97 
 
 		 455 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1791  major facilitator transporter  51.11 
 
 		 455 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130423  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1680  major facilitator transporter  51.11 
 
 		 455 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2121  major facilitator transporter  52.14 
 
 		 480 aa  407  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000118824  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2655  major facilitator transporter  51.11 
 
 		 455 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0128885 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1267  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  53.65 
 
 		 457 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0903  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.47 
 
 		 457 aa  403  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1113  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.41 
 
 		 457 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239242  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3013  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.18 
 
 		 457 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5717  major facilitator transporter  52.75 
 
 		 455 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2143  major facilitator transporter  52.1 
 
 		 480 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172092  hitchhiker  0.000390012 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0899  major facilitator transporter  53.88 
 
 		 455 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0142459 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.18 
 
 		 457 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3304  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.18 
 
 		 457 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.028238  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3036  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.18 
 
 		 457 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1140  major facilitator superfamily MFS_1  52.11 
 
 		 485 aa  398  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1779  major facilitator transporter  52.53 
 
 		 455 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2391  major facilitator transporter  52.53 
 
 		 455 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3532  major facilitator superfamily MFS_1  51.86 
 
 		 464 aa  395  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0144741  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3647  major facilitator superfamily MFS_1  51.1 
 
 		 445 aa  394  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2396  major facilitator transporter  52.97 
 
 		 455 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.124422 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1107  transport protein YebQ  53.88 
 
 		 457 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2398  major facilitator transporter  49.67 
 
 		 457 aa  390  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.233467  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01799  predicted transporter  49.89 
 
 		 457 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.702332  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  49.89 
 
 		 457 aa  380  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0974065  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01787  hypothetical protein  49.89 
 
 		 457 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.868049  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1804  major facilitator transporter  49.89 
 
 		 457 aa  380  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.673075  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2057  major facilitator transporter  49.89 
 
 		 457 aa  380  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276099  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1919  major facilitator transporter  49.89 
 
 		 457 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591664  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2096  transporter, major facilitator family  49.89 
 
 		 457 aa  380  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000334622  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2560  transporter, major facilitator family  49.89 
 
 		 457 aa  381  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000336159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1359  major facilitator transporter  49.53 
 
 		 457 aa  378  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000544866  normal  0.0171999 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3520  major facilitator transporter  49.67 
 
 		 475 aa  378  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4770  MFS family transporter  49.78 
 
 		 474 aa  378  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3326  major facilitator superfamily MFS_1  50.79 
 
 		 459 aa  362  1e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1309  major facilitator superfamily MFS_1  50.67 
 
 		 455 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0923  major facilitator transporter  50.67 
 
 		 459 aa  350  3e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.298675 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3450  major facilitator superfamily MFS_1  50.12 
 
 		 459 aa  347  2e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3129  major facilitator transporter  49.88 
 
 		 459 aa  344  1e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0660329 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2768  MFS family transporter  45.97 
 
 		 464 aa  342  7e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3984  putative MFS superfamily transport protein  45.26 
 
 		 473 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3792  major facilitator transporter  44.84 
 
 		 488 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.57884 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1280  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.88 
 
 		 459 aa  332  7.000000000000001e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.086672  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0958  putative transporter  43.88 
 
 		 442 aa  332  1e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1017  transporter, putative  43.65 
 
 		 459 aa  331  2e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.525895  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2203  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  45.86 
 
 		 455 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190205  normal  0.434224 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5967  major facilitator superfamily MFS_1  44.84 
 
 		 455 aa  322  7e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3665  major facilitator transporter  44.98 
 
 		 466 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4320  major facilitator transporter  44.27 
 
 		 446 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142601  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2166  major facilitator transporter  44.25 
 
 		 498 aa  317  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3816  major facilitator transporter  44.47 
 
 		 491 aa  316  5e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524764  normal  0.933625 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4542  major facilitator superfamily transporter  44.13 
 
 		 490 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.061139  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2164  major facilitator transporter  43.83 
 
 		 476 aa  311  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3605  major facilitator transporter  44.47 
 
 		 472 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4444  major facilitator transporter  44.47 
 
 		 453 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3923  major facilitator transporter  44.47 
 
 		 453 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3110  major facilitator superfamily MFS_1  43.27 
 
 		 469 aa  306  4.0000000000000004e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3300  major facilitator transporter  43.68 
 
 		 497 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.471538 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4661  major facilitator transporter  44.07 
 
 		 468 aa  276  7e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2995  major facilitator transporter  39.34 
 
 		 461 aa  261  2e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.35009  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04823  putative efflux PUMP antibiotic resistance transmembrane protein  41.08 
 
 		 479 aa  254  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05653  putative efflux PUMP antibiotic resistance transmembrane protein  41.08 
 
 		 479 aa  254  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6200  major facilitator superfamily MFS_1  44.13 
 
 		 481 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6917  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.21 
 
 		 463 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.83 
 
 		 474 aa  189  5.999999999999999e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.75 
 
 		 477 aa  186  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.42 
 
 		 475 aa  186  6e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.25 
 
 		 477 aa  178  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.22 
 
 		 456 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  27.94 
 
 		 462 aa  166  5.9999999999999996e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.73 
 
 		 465 aa  164  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2797  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.92 
 
 		 482 aa  164  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.07 
 
 		 493 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.02 
 
 		 483 aa  161  3e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.787219  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  29.95 
 
 		 500 aa  152  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.12 
 
 		 483 aa  150  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.35 
 
 		 488 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.22 
 
 		 461 aa  145  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0977  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 503 aa  143  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132044 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.19 
 
 		 478 aa  143  7e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.98 
 
 		 482 aa  143  7e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.26 
 
 		 493 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  28.67 
 
 		 492 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.67 
 
 		 475 aa  141  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.98 
 
 		 482 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1810  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 		 491 aa  140  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174923  hitchhiker  0.00284389 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.66 
 
 		 528 aa  140  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1772  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 456 aa  139  1e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3381  major facilitator transporter  30.9 
 
 		 466 aa  139  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1035  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 456 aa  139  1e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.46638  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0909  major facilitator transporter  27.05 
 
 		 456 aa  139  1e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.6 
 
 		 477 aa  138  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 462 aa  138  2e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>