More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0796 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0796  hypothetical protein  100 
 
 
340 aa  675    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.980673  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0805  hypothetical protein  45.36 
 
 
328 aa  268  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0604  hypothetical protein  47.64 
 
 
329 aa  258  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0236  hypothetical protein  40.13 
 
 
329 aa  253  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4405  hypothetical protein  45.45 
 
 
329 aa  252  7e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3116  twin-arginine translocation pathway signal  42.91 
 
 
331 aa  248  9e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.143461  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2451  hypothetical protein  40.69 
 
 
330 aa  247  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0073  hypothetical protein  44.16 
 
 
330 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0198  twin-arginine translocation pathway signal  40.58 
 
 
328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.297337  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0136  hypothetical protein  40.58 
 
 
355 aa  236  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4540  hypothetical protein  44.67 
 
 
330 aa  236  5.0000000000000005e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645973  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0710  hypothetical protein  43.92 
 
 
331 aa  231  9e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1766  twin-arginine translocation pathway signal  40.06 
 
 
338 aa  229  5e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1801  hypothetical protein  39.61 
 
 
343 aa  218  8.999999999999998e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.939675  normal  0.361643 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4305  hypothetical protein  39.43 
 
 
327 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  35.45 
 
 
324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  36.9 
 
 
330 aa  200  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  36.16 
 
 
326 aa  195  9e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4788  hypothetical protein  37.93 
 
 
328 aa  192  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0126294  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  37.29 
 
 
328 aa  192  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  36.73 
 
 
334 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0712  hypothetical protein  39.86 
 
 
324 aa  189  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.780507 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  36.21 
 
 
355 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4430  hypothetical protein  34.01 
 
 
328 aa  189  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.840915  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  36.52 
 
 
322 aa  189  8e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1798  hypothetical protein  36.86 
 
 
329 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.379878 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4563  hypothetical protein  35.37 
 
 
329 aa  186  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011816  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  36.21 
 
 
353 aa  186  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2127  hypothetical protein  37.24 
 
 
332 aa  186  6e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00713348 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  36.18 
 
 
343 aa  186  7e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  34.35 
 
 
325 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2663  hypothetical protein  37.71 
 
 
324 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3311  hypothetical protein  37.71 
 
 
324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.187965 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  33.85 
 
 
324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  37.88 
 
 
334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  34.12 
 
 
325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  35.86 
 
 
337 aa  183  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  36.21 
 
 
322 aa  183  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  33.76 
 
 
325 aa  182  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  35.65 
 
 
327 aa  182  8.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  36.14 
 
 
326 aa  182  9.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2943  hypothetical protein  36.18 
 
 
333 aa  182  9.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.357737  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  37.98 
 
 
326 aa  182  9.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  36.39 
 
 
321 aa  181  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  36.39 
 
 
321 aa  181  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4796  hypothetical protein  37.16 
 
 
331 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  34.35 
 
 
336 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  36.05 
 
 
334 aa  180  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  34.48 
 
 
341 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6131  hypothetical protein  38.44 
 
 
314 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.554613  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  36.3 
 
 
332 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  34.59 
 
 
324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  37.59 
 
 
324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  32.76 
 
 
334 aa  179  4e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  37.28 
 
 
335 aa  179  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  33.78 
 
 
328 aa  179  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  33.79 
 
 
322 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0909  hypothetical protein  37.41 
 
 
329 aa  179  5.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  36.55 
 
 
327 aa  179  7e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  34.76 
 
 
332 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  35.71 
 
 
349 aa  178  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  35.05 
 
 
326 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1838  hypothetical protein  35.62 
 
 
330 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0187  hypothetical protein  34.72 
 
 
332 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  33.33 
 
 
323 aa  177  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  36.43 
 
 
358 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1315  hypothetical protein  36.05 
 
 
328 aa  177  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39846  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  33.33 
 
 
325 aa  176  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  35.58 
 
 
334 aa  176  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3994  hypothetical protein  35.92 
 
 
322 aa  176  5e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.189336 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  34.62 
 
 
334 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  36.99 
 
 
339 aa  176  5e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  36.05 
 
 
330 aa  176  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5507  hypothetical protein  36.1 
 
 
319 aa  176  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  34.46 
 
 
326 aa  176  6e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1950  hypothetical protein  34.35 
 
 
327 aa  176  6e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0031153 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  34.35 
 
 
338 aa  176  7e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2502  hypothetical protein  35.03 
 
 
333 aa  176  7e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0326182  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  34.07 
 
 
322 aa  176  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  34.15 
 
 
366 aa  176  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  34.49 
 
 
326 aa  175  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  35.6 
 
 
331 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1189  hypothetical protein  35.25 
 
 
330 aa  174  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  34.69 
 
 
327 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  37.14 
 
 
321 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  34.83 
 
 
334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3575  hypothetical protein  35.25 
 
 
334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.571272  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  36.9 
 
 
323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  34.48 
 
 
325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2783  hypothetical protein  36.59 
 
 
324 aa  173  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  35.52 
 
 
328 aa  174  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  36.27 
 
 
339 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  33.12 
 
 
321 aa  173  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  36.39 
 
 
333 aa  173  5e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  36.73 
 
 
320 aa  173  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  35.47 
 
 
314 aa  172  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  33.44 
 
 
324 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  31.99 
 
 
336 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  32.49 
 
 
351 aa  172  7.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  32.23 
 
 
330 aa  172  9e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>