185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0806 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_0806  penicillin amidase family protein  100 
 
 
802 aa  1609    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0950  peptidase S45 penicillin amidase  100 
 
 
759 aa  1516    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.841423  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  29.38 
 
 
783 aa  269  1e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  28.15 
 
 
779 aa  241  2.9999999999999997e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  30.23 
 
 
770 aa  232  3e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  29.85 
 
 
827 aa  231  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  29.13 
 
 
827 aa  230  6e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  28.83 
 
 
817 aa  227  8e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  26.72 
 
 
796 aa  225  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1553  penicillin amidase  29.6 
 
 
774 aa  223  9e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275425  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  26.3 
 
 
796 aa  223  9e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  26.04 
 
 
796 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  26.33 
 
 
796 aa  223  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  25.59 
 
 
796 aa  220  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  29.34 
 
 
787 aa  219  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  25.9 
 
 
796 aa  219  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  25.94 
 
 
796 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  25.94 
 
 
796 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  25.91 
 
 
796 aa  218  5e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  26.14 
 
 
796 aa  217  9e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  29.37 
 
 
769 aa  212  3e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0772  hypothetical protein  25.89 
 
 
810 aa  209  2e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  27.26 
 
 
821 aa  206  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  27.93 
 
 
804 aa  204  4e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  28.57 
 
 
829 aa  197  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0269  penicillin amidase  28.9 
 
 
789 aa  196  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.29223 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  26.57 
 
 
823 aa  196  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  28 
 
 
803 aa  192  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  25.74 
 
 
809 aa  191  4e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  28.57 
 
 
821 aa  191  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  27.86 
 
 
792 aa  191  5.999999999999999e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0858  penicillin acylase  24.07 
 
 
780 aa  190  7e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.459366  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  28.19 
 
 
810 aa  189  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0396  hypothetical protein  26.71 
 
 
795 aa  188  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03980  hypothetical protein  26.78 
 
 
795 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5164  penicillin amidase family protein  26.42 
 
 
788 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0502  peptidase S45, penicillin amidase  23.78 
 
 
795 aa  178  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.269122  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  26.83 
 
 
818 aa  174  6.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5071  peptidase S45, penicillin amidase  26.53 
 
 
788 aa  173  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5217  peptidase S45 penicillin amidase  26.59 
 
 
787 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  25.03 
 
 
819 aa  172  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5300  penicillin amidase family protein  25.17 
 
 
795 aa  172  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1448  penicillin amidase  26.45 
 
 
823 aa  172  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2845  putative penicillin acylase (penicillin amidase)  26.33 
 
 
823 aa  170  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1846  penicillin amidase  25.67 
 
 
698 aa  168  4e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.275998 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1565  acylase precursor  26.43 
 
 
827 aa  167  5.9999999999999996e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0134254  normal  0.042074 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1840  penicillin amidase  29.16 
 
 
821 aa  167  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.643427  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  26.43 
 
 
855 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  25.36 
 
 
819 aa  166  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4858  penicillin amidase  24.73 
 
 
795 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5398  penicillin amidase  24.65 
 
 
803 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111495  hitchhiker  0.00200209 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  27.24 
 
 
818 aa  164  5.0000000000000005e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  24.94 
 
 
857 aa  162  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  30.86 
 
 
809 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0301  peptidase S45 penicillin amidase  25.44 
 
 
787 aa  162  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.916585  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  30.86 
 
 
809 aa  160  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  31.14 
 
 
813 aa  160  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2505  penicillin amidase or acylase  25.27 
 
 
843 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.468551  normal  0.2535 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  23.29 
 
 
811 aa  159  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1588  penicillin amidase  25.65 
 
 
693 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0427638 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1495  penicillin amidase  25.68 
 
 
821 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.505124  normal  0.225613 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  25.98 
 
 
806 aa  157  8e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4199  peptidase S45 penicillin amidase  24.87 
 
 
809 aa  157  8e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4309  peptidase S45 penicillin amidase  24.87 
 
 
809 aa  157  8e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1397  penicillin amidase  26.45 
 
 
762 aa  155  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5635  penicillin amidase (peptidase S45)  24.78 
 
 
812 aa  154  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2999  peptidase S45 penicillin amidase  24.86 
 
 
807 aa  155  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  26.15 
 
 
808 aa  154  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1644  penicillin amidase  25.83 
 
 
854 aa  152  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2327  penicillin amidase  26.8 
 
 
826 aa  151  4e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00682213  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1726  penicillin acylase  27.03 
 
 
837 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1089  penicillin amidase family protein  25.49 
 
 
761 aa  149  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1877  putative penicillin amidase  27.03 
 
 
823 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0887  putative penicillin amidase  27.03 
 
 
837 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1174  putative penicillin amidase  27.03 
 
 
837 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0371  putative penicillin amidase  27.03 
 
 
837 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2152  putative penicillin amidase  27.03 
 
 
837 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3025  penicillin acylase II  26.75 
 
 
786 aa  148  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1594  peptidase S45 penicillin amidase  27.02 
 
 
836 aa  149  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0278  putative penicillin amidase  27.03 
 
 
837 aa  149  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23695  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  27.11 
 
 
864 aa  148  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4002  penicillin amidase  26.69 
 
 
818 aa  147  9e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3735  penicillin amidase  27.47 
 
 
758 aa  147  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3277  penicillin amidase  25.84 
 
 
782 aa  145  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2452  penicillin amidase  26.13 
 
 
889 aa  145  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288116  normal  0.271218 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1568  peptidase S45 penicillin amidase  28.15 
 
 
854 aa  144  6e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0038  peptidase S45 penicillin amidase  25.8 
 
 
807 aa  142  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00221465  normal  0.102906 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0788  penicillin amidase  30.47 
 
 
872 aa  142  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4805  peptidase S45 penicillin amidase  26.07 
 
 
844 aa  137  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4133  penicillin amidase family protein  24.42 
 
 
824 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.699184  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1354  penicillin amidase  28.1 
 
 
829 aa  136  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342409  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50980  putative penicillin amidase  24.79 
 
 
847 aa  135  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.646025  hitchhiker  0.000000127919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4349  putative penicillin amidase  24.79 
 
 
847 aa  135  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6210  peptidase S45 penicillin amidase  28.87 
 
 
858 aa  135  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329512  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3871  penicillin amidase  24.01 
 
 
824 aa  132  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3220  penicillin amidase  26.19 
 
 
768 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1213  peptidase S45, penicillin amidase  22.72 
 
 
816 aa  130  9.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.951411 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3540  penicillin amidase  26.86 
 
 
768 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2814  peptidase S45 penicillin amidase  27.02 
 
 
870 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.893736  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3478  peptidase S45 penicillin amidase  25.93 
 
 
847 aa  129  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>