157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_19131 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_19131  NAD binding site:D-amino acid oxidase  100 
 
 
360 aa  721    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.119558  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18941  NAD binding site:D-amino acid oxidase  86.63 
 
 
360 aa  613  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1796  D-amino acid oxidase  85 
 
 
360 aa  605  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229908  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18941  NAD binding site:D-amino acid oxidase  62.4 
 
 
360 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21851  NAD binding site:D-amino acid oxidase  34.51 
 
 
370 aa  249  4e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1312  FAD dependent oxidoreductase  34.24 
 
 
368 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18391  NAD binding site:D-amino acid oxidase  35.52 
 
 
371 aa  228  9e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.299081  normal  0.626898 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2673  D-amino acid oxidase  28.61 
 
 
350 aa  212  9e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30031  NAD binding site:D-amino acid oxidase  27.83 
 
 
372 aa  203  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2302  D-amino acid oxidase  29.8 
 
 
302 aa  187  2e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5037  FAD dependent oxidoreductase  27.72 
 
 
360 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.484973 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0520  FAD dependent oxidoreductase  28.9 
 
 
369 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0537  FAD dependent oxidoreductase  28.9 
 
 
369 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1783  FAD dependent oxidoreductase  25.9 
 
 
381 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.359042  normal  0.766074 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1461  FAD dependent oxidoreductase  26.09 
 
 
379 aa  112  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942129  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0199  FAD dependent oxidoreductase  27.53 
 
 
366 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1793  FAD dependent oxidoreductase  25.69 
 
 
389 aa  105  9e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.075637  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  24.44 
 
 
372 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1677  hypothetical protein  23.6 
 
 
365 aa  87.8  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.32351  normal  0.49797 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  22.63 
 
 
363 aa  85.5  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  24.19 
 
 
369 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  24.46 
 
 
369 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  24.73 
 
 
369 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  24.19 
 
 
369 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  24.19 
 
 
369 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  24.19 
 
 
369 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  24.46 
 
 
369 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  24.46 
 
 
369 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  23.92 
 
 
369 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  23.39 
 
 
369 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  22.63 
 
 
375 aa  78.2  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  24.2 
 
 
652 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  23.56 
 
 
376 aa  76.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2483  glycine oxidase ThiO  21.45 
 
 
385 aa  76.6  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  25.15 
 
 
367 aa  74.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2430  FAD dependent oxidoreductase  22.47 
 
 
371 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0834847  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1370  FAD dependent oxidoreductase  23.12 
 
 
491 aa  70.5  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  21.25 
 
 
361 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  21.64 
 
 
404 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  22.66 
 
 
376 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  22.76 
 
 
369 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  21.93 
 
 
364 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  22.87 
 
 
401 aa  68.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  22.66 
 
 
376 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2569  oxidoreductase, DadA family  23.13 
 
 
371 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0599885 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2732  oxidoreductase, DadA family  23.13 
 
 
371 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2742  DadA family oxidoreductase  21.13 
 
 
371 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00153462  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  21.53 
 
 
375 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2489  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  21.2 
 
 
371 aa  64.7  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000926626  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0750  glycine oxidase ThiO  25.43 
 
 
365 aa  64.7  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2454  D-amino acid dehydrogenase small subunit  22.06 
 
 
371 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295637  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  22.75 
 
 
404 aa  63.9  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2777  oxidoreductase, DadA family  20.85 
 
 
371 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.848486  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1415  glycine oxidase ThiO  28.8 
 
 
377 aa  63.5  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  20.6 
 
 
382 aa  63.2  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  24.49 
 
 
360 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  21.99 
 
 
365 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  21.39 
 
 
405 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  22.64 
 
 
380 aa  61.2  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  21.41 
 
 
365 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  22.26 
 
 
366 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2529  DadA family oxidoreductase  21.35 
 
 
371 aa  60.1  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2715  DadA family oxidoreductase  21.35 
 
 
371 aa  60.1  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2728  oxidoreductase, DadA family  21.35 
 
 
371 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000981681 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4390  glycine oxidase ThiO  22.07 
 
 
361 aa  59.3  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1426  FAD dependent oxidoreductase  21.77 
 
 
374 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0313349  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  21.57 
 
 
371 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3533  FAD dependent oxidoreductase  21.74 
 
 
394 aa  58.9  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.972727  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  20.83 
 
 
374 aa  58.9  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  21.68 
 
 
666 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  21.68 
 
 
666 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01740  glycine oxidase ThiO  21.93 
 
 
388 aa  58.5  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  20.11 
 
 
440 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  21.7 
 
 
365 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2192  FAD dependent oxidoreductase  20.85 
 
 
375 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28291  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  22.54 
 
 
371 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  21.83 
 
 
365 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1848  FAD dependent oxidoreductase  21.45 
 
 
373 aa  57  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.344381  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  19.95 
 
 
960 aa  56.2  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  20.33 
 
 
379 aa  56.2  0.0000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  22.73 
 
 
375 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  21.31 
 
 
342 aa  55.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  21.28 
 
 
371 aa  55.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  21.01 
 
 
367 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1124  D-amino acid dehydrogenase small subunit  20.63 
 
 
411 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.548821 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3505  FAD dependent oxidoreductase  23.16 
 
 
465 aa  55.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.604467 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  22.67 
 
 
375 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2166  glycine oxidase ThiO  24.51 
 
 
346 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.402403 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  21.19 
 
 
368 aa  54.3  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1152  glycine oxidase ThiO  19.94 
 
 
360 aa  54.7  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  21.79 
 
 
376 aa  53.9  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  21.53 
 
 
371 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  20.61 
 
 
367 aa  53.9  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  29.3 
 
 
367 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  20.6 
 
 
411 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  19.29 
 
 
375 aa  53.5  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  21.89 
 
 
375 aa  53.1  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  20.6 
 
 
378 aa  53.1  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0048  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  22.22 
 
 
369 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1828  FAD dependent oxidoreductase  19.05 
 
 
371 aa  52.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>