95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1345 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1345  multiheme cytochrome  100 
 
 
742 aa  1510    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2603  hypothetical protein  96.09 
 
 
742 aa  1399    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430741  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1244  hypothetical protein  97.44 
 
 
742 aa  1419    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0505071  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1257  hypothetical protein  41.65 
 
 
762 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0910  hypothetical protein  29.89 
 
 
731 aa  233  9e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.688824 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2292  hypothetical protein  27.88 
 
 
782 aa  205  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3200  hypothetical protein  33.11 
 
 
820 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6275  decaheme c-type cytochrome, OmcA/MtrC family  28.3 
 
 
741 aa  189  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1580  decaheme cytochrome c MtrF  27.6 
 
 
639 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0766819  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2763  decaheme cytochrome c MtrF  27.98 
 
 
639 aa  147  6e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0120659  hitchhiker  0.0000444921 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4083  hypothetical protein  37.5 
 
 
826 aa  144  6e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0344261  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1614  decaheme cytochrome c MtrF  28.39 
 
 
639 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0474266  normal  0.168927 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1591  decaheme cytochrome c MtrF  28.84 
 
 
639 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000158979  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2674  decaheme cytochrome c MtrF  29 
 
 
639 aa  142  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0899912  normal  0.105553 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4080  hypothetical protein  26.06 
 
 
936 aa  141  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000183317  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1211  decaheme cytochrome c MtrF  28.71 
 
 
639 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1528  decaheme cytochrome c MtrF  26.09 
 
 
646 aa  141  6e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2508  decaheme cytochrome c MtrF  28.81 
 
 
639 aa  140  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00292179  decreased coverage  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2576  decaheme cytochrome c MtrF  28.62 
 
 
639 aa  140  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134423  decreased coverage  0.00876105 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  27.53 
 
 
639 aa  139  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4079  hypothetical protein  25.85 
 
 
885 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299167  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0963  hypothetical protein  25.67 
 
 
816 aa  137  8e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.830117  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3371  hypothetical protein  24.37 
 
 
895 aa  136  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.94917  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1187  hypothetical protein  24.6 
 
 
778 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2521  decaheme cytochrome c MtrF  26.38 
 
 
639 aa  126  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0875  hypothetical protein  23.74 
 
 
893 aa  126  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0421546 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2694  decaheme cytochrome c MtrF  25.71 
 
 
640 aa  125  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3251  hypothetical protein  26.16 
 
 
788 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1268  hypothetical protein  25.06 
 
 
789 aa  124  6e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.487663  hitchhiker  0.00130496 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3098  hypothetical protein  24.39 
 
 
789 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3108  hypothetical protein  24.88 
 
 
788 aa  114  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1526  decaheme cytochrome c  24.18 
 
 
738 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.324001  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2299  hypothetical protein  26.65 
 
 
809 aa  110  9.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2228  decaheme cytochrome c  26.27 
 
 
755 aa  108  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.236086  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2764  hypothetical protein  24.88 
 
 
843 aa  107  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.185672  hitchhiker  0.000000808171 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2695  decaheme cytochrome c  23.93 
 
 
719 aa  107  9e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734788  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1479  hypothetical protein  25.18 
 
 
833 aa  105  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0424195  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2696  hypothetical protein  23.41 
 
 
822 aa  103  9e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0998  decaheme cytochrome c  26.71 
 
 
766 aa  102  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4254  decaheme cytochrome c  23.81 
 
 
729 aa  102  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.353597  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0918  decaheme cytochrome c  25.09 
 
 
764 aa  102  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.613412  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2524  decaheme cytochrome c  25.44 
 
 
725 aa  102  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000418395  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1380  decaheme cytochrome c  24.92 
 
 
765 aa  98.2  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2509  decaheme cytochrome c  25.6 
 
 
731 aa  97.4  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000184393  hitchhiker  0.000632353 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1473  decaheme cytochrome c  25.39 
 
 
761 aa  97.4  9e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000262006  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2697  decaheme cytochrome c  23.83 
 
 
745 aa  97.1  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0633196  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2216  hypothetical protein  29.29 
 
 
898 aa  97.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.352223  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1658  hypothetical protein  29.5 
 
 
898 aa  96.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.131846  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2577  decaheme cytochrome c  24.87 
 
 
731 aa  95.9  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00883016  decreased coverage  0.00925289 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1509  decaheme cytochrome c  25.39 
 
 
764 aa  95.5  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.130709  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1731  multiheme cytochrome  29.24 
 
 
898 aa  95.9  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3588  decaheme cytochrome c  23.62 
 
 
745 aa  95.1  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2874  decaheme cytochrome c  25.22 
 
 
764 aa  94.4  8e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0594793  hitchhiker  0.00000891097 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1478  decaheme cytochrome c  25.22 
 
 
761 aa  94  8e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.174618  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1659  decaheme cytochrome c  24.41 
 
 
758 aa  94  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2675  decaheme cytochrome c  25.68 
 
 
724 aa  92.4  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000733685  normal  0.0455406 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1779  decaheme cytochrome c  23.43 
 
 
735 aa  93.2  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1210  decaheme cytochrome c  25.34 
 
 
727 aa  91.7  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.260087  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0913  decaheme cytochrome c  24.79 
 
 
770 aa  90.9  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546873  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3124  decaheme cytochrome c  22.25 
 
 
741 aa  90.9  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00184772  hitchhiker  0.000042193 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2787  decaheme cytochrome c  24.61 
 
 
762 aa  90.1  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1527  decaheme cytochrome c  23.32 
 
 
722 aa  89.4  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1713  hypothetical protein  25.78 
 
 
945 aa  87.8  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.436521  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2613  decaheme cytochrome c  25 
 
 
762 aa  87.8  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000355284  hitchhiker  0.00000740819 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1209  decaheme cytochrome c  29.43 
 
 
729 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00658895  normal  0.327868 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2636  decaheme cytochrome c  24.59 
 
 
724 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2680  decaheme cytochrome c  23.67 
 
 
762 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463028  unclonable  0.0000643351 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2522  decaheme cytochrome c  29.29 
 
 
720 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3353  hypothetical protein  24.71 
 
 
856 aa  79.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1613  decaheme cytochrome c  32.17 
 
 
730 aa  77  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1590  decaheme cytochrome c  32.17 
 
 
730 aa  77  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000452412  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1579  decaheme cytochrome c  32.17 
 
 
730 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874065  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3573  decaheme cytochrome c  24.38 
 
 
716 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1208  decaheme cytochrome c  23.73 
 
 
656 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.474569  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1525  decaheme cytochrome c  27.04 
 
 
660 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.100516  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3286  hypothetical protein  21.75 
 
 
714 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.909593  hitchhiker  0.000000468411 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003776  decaheme cytochrome c MtrF  26.02 
 
 
754 aa  66.2  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3163  hypothetical protein  34.75 
 
 
857 aa  64.7  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2637  decaheme cytochrome c  26.87 
 
 
653 aa  62.8  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3279  hypothetical protein  29.45 
 
 
854 aa  62  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2379  hypothetical protein  42.05 
 
 
1111 aa  60.1  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.49944  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1778  decaheme cytochrome c  23.32 
 
 
671 aa  57.8  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1612  decaheme cytochrome c  25.19 
 
 
650 aa  57.4  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0130523  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1589  decaheme cytochrome c  25.19 
 
 
650 aa  57.4  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000235795  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1578  decaheme cytochrome c  25.13 
 
 
650 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000205402  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2525  decaheme cytochrome c  23.89 
 
 
656 aa  55.8  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837992  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2698  decaheme cytochrome c  23.77 
 
 
671 aa  55.8  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0681671  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2765  decaheme cytochrome c  25.45 
 
 
650 aa  55.1  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00105295  hitchhiker  0.000000731399 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3125  decaheme cytochrome c  23.91 
 
 
667 aa  54.3  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00001045  hitchhiker  0.00000606277 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2578  decaheme cytochrome c  24.52 
 
 
650 aa  53.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00427395  decreased coverage  0.00803379 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2676  decaheme cytochrome c  24.97 
 
 
650 aa  52.4  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000503474  normal  0.0214929 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2510  decaheme cytochrome c  21.75 
 
 
655 aa  48.9  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178218  hitchhiker  0.000666167 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1478  decaheme cytochrome c  21.36 
 
 
663 aa  48.1  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000254716  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4048  hypothetical protein  22.3 
 
 
764 aa  46.2  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3466  hypothetical protein  25.48 
 
 
785 aa  45.4  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.724503 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>