72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_0097 on replicon NC_010158
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010158  YpAngola_0097  putative tail fiber assembly protein  100 
 
 
202 aa  412  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000164491  hitchhiker  2.58934e-46 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2784  tail fiber assembly protein  62.63 
 
 
194 aa  256  1e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096055  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1285  tail fiber assembly protein  62.77 
 
 
194 aa  252  3e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1479  tail fiber assembly protein  62.77 
 
 
194 aa  252  3e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1644  tail fiber assembly protein  61.05 
 
 
193 aa  250  9.000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0834  tail fiber assembly protein  60.53 
 
 
194 aa  248  5e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390981  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2099  tail assembly chaperone gp38  61.58 
 
 
191 aa  248  6e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220604  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2112  tail assembly chaperone gp38  61.58 
 
 
191 aa  248  6e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.012456  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1755  tail fiber assembly protein  61.58 
 
 
191 aa  248  6e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259301  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2273  tail assembly chaperone gp38  61.58 
 
 
191 aa  247  9e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.724349  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1428  phage tail assembly protein  62.77 
 
 
189 aa  244  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.220507 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0872  putative Tail fiber assembly protein homolog  57.89 
 
 
190 aa  239  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4382  phage tail assembly protein  60.64 
 
 
189 aa  234  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0725445  hitchhiker  0.000673602 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2792  phage tail assembly protein  60.89 
 
 
192 aa  232  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1124  tail fiber assembly like-protein  59.47 
 
 
193 aa  231  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1091  tail fiber assembly like-protein  59.47 
 
 
193 aa  231  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1162  phage tail assembly protein  60.53 
 
 
193 aa  215  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3068  tail assembly chaperone gp38  61.76 
 
 
247 aa  180  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.577916  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2667  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  58.21 
 
 
138 aa  169  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000342551 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2023  tail fibre assembly protein  52.87 
 
 
293 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0278369 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4026  tail assembly chaperone gp38  38.92 
 
 
206 aa  125  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3483  phage tail assembly chaperone gp38  37.16 
 
 
198 aa  123  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.153729  normal  0.0386955 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2098  tail assembly chaperone gp38  36.31 
 
 
204 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1578  tail assembly chaperone gp38  35.84 
 
 
206 aa  116  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1536  tail assembly chaperone gp38  35.03 
 
 
209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2491  tail assembly chaperone gp38  38.38 
 
 
200 aa  112  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0363657  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2737  tail assembly chaperone gp38  34.46 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1816  tail assembly chaperone gp38  35.75 
 
 
203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0699911  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0300  Tail fiber assembly protein homolog  39.18 
 
 
197 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.656983 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2759  tail assembly chaperone gp38  36.11 
 
 
200 aa  104  8e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000908962 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00853  hypothetical protein  36.22 
 
 
200 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00847  e14 prophage; predicted tail fiber assembly protein  36.22 
 
 
200 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3034  Tail fiber assembly protein homolog  35 
 
 
200 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000774391 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  54.72 
 
 
442 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3817  tail assembly chaperone gp38  32.2 
 
 
208 aa  97.8  8e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1181  phage tail assembly protein  54.84 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.128725  normal  0.507373 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1693  putative tail fiber assembly protein  27.32 
 
 
198 aa  71.6  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  0.453071 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1018  domain of unknown function superfamily  63.46 
 
 
89 aa  70.9  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2197  hypothetical protein  31.48 
 
 
218 aa  70.9  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.107741  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0864  tail assembly chaperone gp38  41.51 
 
 
184 aa  70.1  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344022  hitchhiker  0.00356557 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1167  hypothetical protein  30.94 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1287  hypothetical protein  61.54 
 
 
88 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1481  hypothetical protein  61.54 
 
 
89 aa  68.9  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4536  tail assembly chaperone gp38  40.23 
 
 
171 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4954  tail assembly chaperone gp38  50 
 
 
170 aa  60.5  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.516672  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0915  tail assembly chaperone gp38  43.42 
 
 
142 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4584  hypothetical protein  30.81 
 
 
188 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11724  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5072  tail fiber assembly protein  32.35 
 
 
236 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0684  tail fiber assembly protein  32.35 
 
 
236 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1649  hypothetical protein  58.7 
 
 
82 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1861  bacteriophage-acquired protein  33.33 
 
 
253 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1450  tail fiber assembly protein, putative  35.71 
 
 
178 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.422094  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2077  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  55.32 
 
 
78 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.865934  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1920  putative tail fiber assembly-like protein  28.57 
 
 
250 aa  54.3  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.40687 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3091  tail assembly chaperone gp38  34.31 
 
 
138 aa  53.1  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0929  tail assembly chaperone gp38  32.69 
 
 
172 aa  52  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2371  putative phage tail fiber assembly protein  36.36 
 
 
139 aa  52  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.786543  normal  0.362441 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1305  tail assembly chaperone gp38  34.74 
 
 
114 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.059045  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01356  hypothetical protein  71.43 
 
 
36 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3110  tail assembly chaperone gp38  34.29 
 
 
145 aa  48.5  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130843  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4484  fels-2 prophage Tfa  36.36 
 
 
135 aa  48.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00667838 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1041  tail fiber assembly protein  40.54 
 
 
175 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2241  phage tail assembly protein  65.71 
 
 
47 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.206119 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0182  hypothetical protein  35.21 
 
 
145 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2808  tail assembly chaperone gp38  40 
 
 
139 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4342  tail fiber assembly protein GpG  40 
 
 
175 aa  43.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.894245  normal  0.082245 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1332  tail fiber assembly protein from lambdoid prophage e14  26.32 
 
 
223 aa  42.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2248  tail fibre assembly protein  43.84 
 
 
189 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0284731  normal  0.0191613 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1636  tail fiber assembly protein, truncation  77.78 
 
 
30 aa  42.7  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00269715  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1052  phage tail assembly chaperone gp38  29.87 
 
 
140 aa  42  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3934  tail fiber assembly domain protein  37.18 
 
 
92 aa  42  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.329117  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4854  tail assembly chaperone gp38  29.32 
 
 
292 aa  41.6  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>