More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_0033 on replicon NC_010158
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010158  YpAngola_0033  RecA protein  100 
 
 		 358 aa  736    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3964  RecA protein  32.63 
 
 		 358 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0872  recombinase A  37.5 
 
 		 414 aa  156  5.0000000000000005e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.396783  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0858  recA protein  33.66 
 
 		 349 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.873565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  36.67 
 
 		 358 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4075  recA protein  32.84 
 
 		 358 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4108  recA protein  32.84 
 
 		 358 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.633837  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0881  recombinase A  38.91 
 
 		 340 aa  153  5e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  33.33 
 
 		 338 aa  152  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  33.33 
 
 		 338 aa  152  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3756  recA protein  37.97 
 
 		 316 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  35.98 
 
 		 336 aa  151  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0400  recombinase A  36.08 
 
 		 387 aa  149  9e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.392545  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3617  recA protein  34.21 
 
 		 316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  34.47 
 
 		 344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  35.85 
 
 		 358 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3687  recA protein  37.22 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1382  recombinase A  36.59 
 
 		 376 aa  148  1.0000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.217546  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1372  recombinase A  35.64 
 
 		 352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  38.4 
 
 		 364 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  34.59 
 
 		 378 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0597  recombinase A  34.25 
 
 		 356 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1291  recombinase A  35.23 
 
 		 357 aa  147  3e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260339  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  32.5 
 
 		 350 aa  147  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  35.98 
 
 		 341 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0745  recA protein  34.02 
 
 		 349 aa  146  5e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.624125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  33.63 
 
 		 357 aa  146  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0131  recombinase A  37.92 
 
 		 365 aa  146  6e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0584  recombinase A  38.7 
 
 		 385 aa  145  7.0000000000000006e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000230133  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1747  recombinase A  38.3 
 
 		 351 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000101073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  35.36 
 
 		 383 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3750  recA protein  34.96 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.79987  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4134  recA protein  33.08 
 
 		 345 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00773385  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  35.66 
 
 		 362 aa  144  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0663  recA protein  35.82 
 
 		 346 aa  144  2e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  33.58 
 
 		 348 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  34.04 
 
 		 347 aa  145  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2082  recombinase A  32.97 
 
 		 347 aa  145  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  33.21 
 
 		 355 aa  144  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0077  recombinase A  36.58 
 
 		 379 aa  144  3e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  35.19 
 
 		 362 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2093  recombinase A  36.86 
 
 		 379 aa  143  4e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00668121  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  37.34 
 
 		 366 aa  143  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0219  recombinase A  34.85 
 
 		 333 aa  143  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  30.95 
 
 		 360 aa  143  5e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0523  recombinase A  33.59 
 
 		 362 aa  143  5e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000473291  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  35.42 
 
 		 348 aa  142  6e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  34.71 
 
 		 348 aa  142  6e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  36.74 
 
 		 347 aa  142  6e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  32.99 
 
 		 360 aa  143  6e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  33.11 
 
 		 365 aa  142  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  33.44 
 
 		 364 aa  143  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0145  recombinase A  36.98 
 
 		 338 aa  142  7e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0988  recA protein  37.29 
 
 		 335 aa  142  7e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38560  recombinase A  34.96 
 
 		 349 aa  142  7e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07480  RecA protein  32.39 
 
 		 352 aa  142  7e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0526583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03079  recombinase A  34.85 
 
 		 348 aa  142  7e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.353429  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  33.58 
 
 		 390 aa  142  7e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  32.2 
 
 		 357 aa  142  8e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3179  recombinase A  32.12 
 
 		 340 aa  142  8e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  33.11 
 
 		 362 aa  142  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1288  recombinase A  32.61 
 
 		 348 aa  142  9e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2014  recombinase A  34.21 
 
 		 352 aa  142  9e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.306298 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0074  recA protein  34.96 
 
 		 344 aa  142  9e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2528  recA protein  34.33 
 
 		 343 aa  142  9e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1523  recombinase A  35.98 
 
 		 346 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1158  recombinase A  34.85 
 
 		 349 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0387  recA protein  36.29 
 
 		 347 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4033  recA protein  33.71 
 
 		 354 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1378  recombinase A  33.71 
 
 		 354 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0217782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1732  recombinase A  34.21 
 
 		 352 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0649106  normal  0.0921204 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  35.04 
 
 		 357 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2553  recA protein  33.23 
 
 		 352 aa  142  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.159054  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1619  recA protein  34.43 
 
 		 352 aa  141  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177143  hitchhiker  0.0000000069085 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17530  recombinase A  35.98 
 
 		 346 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1606  hypothetical protein  37.5 
 
 		 337 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.533727  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1050  recombinase A  33.72 
 
 		 355 aa  141  1.9999999999999998e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  33.66 
 
 		 355 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  32.08 
 
 		 342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  34.22 
 
 		 352 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0938  recombinase A  36.23 
 
 		 356 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126109  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2002  recombinase A  35.71 
 
 		 345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177298  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  34.81 
 
 		 346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  35.74 
 
 		 348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1981  recombinase A  33.84 
 
 		 349 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686398 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  34.9 
 
 		 345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  34.9 
 
 		 345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  31.44 
 
 		 361 aa  140  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1488  recombination protein RecA  37.08 
 
 		 337 aa  140  3e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3732  recA protein  31.94 
 
 		 358 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000212043 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  35.74 
 
 		 365 aa  140  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0960  recombinase A  36.23 
 
 		 356 aa  140  3e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00998532  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0988  recombinase A  34.85 
 
 		 343 aa  140  4.999999999999999e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  32.76 
 
 		 347 aa  140  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  32.79 
 
 		 356 aa  140  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0530  recA protein  32.26 
 
 		 327 aa  140  4.999999999999999e-32  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3295  recombinase A  35.27 
 
 		 358 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303399  normal  0.877549 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0881  recombinase A  34.85 
 
 		 343 aa  140  4.999999999999999e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.115374  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1460  recombinase A  31.01 
 
 		 351 aa  140  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00992179  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0081  recombinase A  35.02 
 
 		 368 aa  139  4.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.449837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>