More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4295 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5666  amidohydrolase 3  82.55 
 
 		 554 aa  932    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498872  normal  0.0259745 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4295  amidohydrolase 3  100 
 
 		 557 aa  1147    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6052  amidohydrolase 3  56.58 
 
 		 555 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.863749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4359  Amidohydrolase 3  54.71 
 
 		 552 aa  599  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.747715 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7627  amidohydrolase-like  54.95 
 
 		 555 aa  598  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.137819 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0134  amidohydrolase-like  53.79 
 
 		 547 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.900918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0108  Amidohydrolase 3  52.89 
 
 		 547 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134206  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5757  amidohydrolase:amidohydrolase-like  52.09 
 
 		 547 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1985  amidohydrolase 3  51.53 
 
 		 554 aa  554  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3250  amidohydrolase 3  51.74 
 
 		 542 aa  549  1e-155  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383305  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4766  amidohydrolase 3  50.64 
 
 		 545 aa  525  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4287  amidohydrolase 3  50.73 
 
 		 544 aa  523  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.275898  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0099  hypothetical protein  31.22 
 
 		 577 aa  252  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.119429  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  33.39 
 
 		 584 aa  234  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2000  twin-arginine translocation pathway signal  29.43 
 
 		 638 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2185  Amidohydrolase 3  28.67 
 
 		 563 aa  208  2e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0742  amidohydrolase 3  31.45 
 
 		 536 aa  205  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838024  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  31.45 
 
 		 536 aa  205  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0756  amidohydrolase 3  31.45 
 
 		 536 aa  205  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398429  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.98 
 
 		 575 aa  204  3e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.8 
 
 		 575 aa  202  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1124  amidohydrolase 3  30.53 
 
 		 625 aa  197  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  29.85 
 
 		 583 aa  188  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2078  hypothetical protein  27.74 
 
 		 576 aa  187  4e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  29.6 
 
 		 581 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2836  amidohydrolase 3  26.55 
 
 		 597 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214714 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10562  hypothetical protein  29.42 
 
 		 537 aa  180  5.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.036236 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3889  Amidohydrolase 3  37.9 
 
 		 624 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  28.62 
 
 		 601 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  27.06 
 
 		 564 aa  174  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  26.37 
 
 		 539 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004324  metal-dependent hydrolase  27.87 
 
 		 581 aa  167  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4036  amidohydrolase 3  26.84 
 
 		 601 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  28.44 
 
 		 548 aa  163  7e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0100  hypothetical protein  26.92 
 
 		 604 aa  163  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3462  amidohydrolase 3  28.57 
 
 		 650 aa  162  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1541  putative amidohydrolase 3  28.18 
 
 		 648 aa  161  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.260198  normal  0.229672 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1885  Amidohydrolase 3  27.02 
 
 		 587 aa  156  9e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.5166  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  29.75 
 
 		 556 aa  156  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  28.96 
 
 		 538 aa  151  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2075  putative lipoprotein  27.4 
 
 		 585 aa  149  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.860152  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  28.44 
 
 		 553 aa  145  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  29.82 
 
 		 549 aa  145  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  25.36 
 
 		 520 aa  142  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  28.42 
 
 		 543 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34970  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  27.7 
 
 		 541 aa  141  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134464  normal  0.645084 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  29.77 
 
 		 525 aa  138  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  28.81 
 
 		 540 aa  137  4e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0760  amidohydrolase 3  24.82 
 
 		 592 aa  136  9e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  26.36 
 
 		 606 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  24.01 
 
 		 539 aa  135  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  26.33 
 
 		 560 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  28.78 
 
 		 539 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  26.72 
 
 		 562 aa  133  6.999999999999999e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1737  Amidohydrolase 3  24.57 
 
 		 618 aa  133  7.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.493619  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  30.25 
 
 		 556 aa  133  7.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  26.12 
 
 		 560 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  24.3 
 
 		 574 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1072  Amidohydrolase 3  23.65 
 
 		 505 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.185661  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  25.35 
 
 		 569 aa  130  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0253  amidohydrolase 3  27.74 
 
 		 551 aa  130  7.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  28.9 
 
 		 539 aa  130  8.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  27.08 
 
 		 573 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  26.35 
 
 		 576 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  27.6 
 
 		 542 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4231  Amidohydrolase 3  26.37 
 
 		 626 aa  127  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  28.24 
 
 		 620 aa  127  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  27.4 
 
 		 542 aa  126  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  27.18 
 
 		 548 aa  125  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  26.21 
 
 		 549 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  29.5 
 
 		 530 aa  123  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  28.6 
 
 		 537 aa  123  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  23.71 
 
 		 533 aa  121  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22680  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  29.23 
 
 		 543 aa  120  6e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  26.26 
 
 		 560 aa  120  7.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  26.64 
 
 		 603 aa  120  7.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  26.11 
 
 		 545 aa  120  7.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3404  Amidohydrolase 3  26.38 
 
 		 586 aa  120  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000897209  hitchhiker  0.00001315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  26.47 
 
 		 583 aa  120  9e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  26.47 
 
 		 583 aa  120  9e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  23.43 
 
 		 526 aa  119  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  25.84 
 
 		 556 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  26.39 
 
 		 546 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  26.68 
 
 		 543 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  24.18 
 
 		 582 aa  118  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  25.98 
 
 		 560 aa  118  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  24.29 
 
 		 540 aa  117  3.9999999999999997e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  28.67 
 
 		 569 aa  117  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  26.01 
 
 		 543 aa  116  8.999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  26.06 
 
 		 583 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2885  amidohydrolase 3  27.7 
 
 		 569 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00571861  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  27.39 
 
 		 537 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  26.12 
 
 		 527 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  26 
 
 		 616 aa  115  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  26.71 
 
 		 576 aa  112  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  27.2 
 
 		 564 aa  113  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1631  Amidohydrolase 3  27.75 
 
 		 537 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0506733 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  25.04 
 
 		 527 aa  112  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  26.58 
 
 		 569 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  26.21 
 
 		 589 aa  111  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.185447 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>