More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3780 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  100 
 
 		 866 aa  1764    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0203  pentapeptide repeat protein  40.4 
 
 		 886 aa  615  9.999999999999999e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713128  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  39.37 
 
 		 881 aa  582  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  39.2 
 
 		 846 aa  570  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  39.21 
 
 		 844 aa  567  1e-160  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  37.75 
 
 		 825 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  37.75 
 
 		 825 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  37.63 
 
 		 862 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  37.75 
 
 		 825 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  37.75 
 
 		 825 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  37.75 
 
 		 825 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  37.63 
 
 		 825 aa  465  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  37.5 
 
 		 872 aa  461  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  34.56 
 
 		 870 aa  376  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  27.01 
 
 		 949 aa  283  8.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  24.07 
 
 		 976 aa  243  1e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  32.08 
 
 		 309 aa  123  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  28.3 
 
 		 381 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  31.07 
 
 		 449 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  29.63 
 
 		 576 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  29.64 
 
 		 349 aa  112  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  26.79 
 
 		 348 aa  106  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  32.23 
 
 		 311 aa  104  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  30.48 
 
 		 440 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2958  pentapeptide repeat-containing protein  23.5 
 
 		 739 aa  103  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0161296 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3557  pentapeptide repeat-containing protein  23.5 
 
 		 739 aa  103  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3428  pentapeptide repeat-containing protein  23.5 
 
 		 739 aa  103  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  27.65 
 
 		 333 aa  101  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  30.39 
 
 		 521 aa  100  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  31.14 
 
 		 343 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  31.14 
 
 		 343 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  30.86 
 
 		 880 aa  99.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  30.86 
 
 		 880 aa  99.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  30.86 
 
 		 880 aa  99.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  30.86 
 
 		 880 aa  99.8  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0204  pentapeptide repeat protein  27.85 
 
 		 358 aa  99  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  29.51 
 
 		 285 aa  98.6  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  30.56 
 
 		 880 aa  97.8  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  26.68 
 
 		 862 aa  97.1  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  28.21 
 
 		 389 aa  97.4  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  28.89 
 
 		 370 aa  96.3  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  29.48 
 
 		 877 aa  96.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  28.57 
 
 		 517 aa  95.1  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  32.24 
 
 		 493 aa  94.4  8e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  29.62 
 
 		 872 aa  94.4  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  26.65 
 
 		 320 aa  93.6  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  30.86 
 
 		 267 aa  93.2  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  28.8 
 
 		 351 aa  92.4  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  24.3 
 
 		 448 aa  92.4  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  28.67 
 
 		 340 aa  91.7  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  29.97 
 
 		 319 aa  91.7  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  30.23 
 
 		 332 aa  90.5  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  26.94 
 
 		 360 aa  90.5  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0344  pentapeptide repeat-containing protein  27.27 
 
 		 360 aa  90.5  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  29.97 
 
 		 412 aa  90.1  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2442  pentapeptide repeat protein  26.3 
 
 		 356 aa  89.4  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0253  pentapeptide repeat-containing protein  27.03 
 
 		 360 aa  89.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4190  pentapeptide repeat-containing protein  26.42 
 
 		 356 aa  89  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  27.25 
 
 		 1191 aa  88.6  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  30.09 
 
 		 291 aa  87.8  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1899  hypothetical protein  26.69 
 
 		 360 aa  87.8  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  27.95 
 
 		 286 aa  87.8  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1197  hypothetical protein  26.69 
 
 		 360 aa  87.8  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0910  hypothetical protein  26.69 
 
 		 360 aa  87.8  7e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  30.5 
 
 		 295 aa  87.8  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  30.09 
 
 		 291 aa  87.8  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  28.94 
 
 		 515 aa  87.8  9e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  27.24 
 
 		 336 aa  87.4  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  29.46 
 
 		 234 aa  87  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  27.24 
 
 		 336 aa  87.4  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  31.12 
 
 		 264 aa  87  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  29.24 
 
 		 355 aa  86.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  26.57 
 
 		 401 aa  86.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  26.57 
 
 		 401 aa  86.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0798  hypothetical protein  21.31 
 
 		 738 aa  85.5  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  28.74 
 
 		 447 aa  85.5  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  29.23 
 
 		 483 aa  85.5  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1892  hypothetical protein  20.8 
 
 		 716 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.97 
 
 		 14916 aa  84  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  30.77 
 
 		 727 aa  82.8  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1211  pentapeptide repeat-containing protein  28.86 
 
 		 419 aa  82.8  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.645913 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  32.54 
 
 		 485 aa  82  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  30.04 
 
 		 386 aa  82  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3134  pentapeptide repeat protein  32.05 
 
 		 222 aa  81.6  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2985  pentapeptide repeat protein  32.05 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  23.72 
 
 		 359 aa  81.3  0.00000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0707  pentapeptide repeat protein  31.52 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  26.2 
 
 		 450 aa  80.9  0.00000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3704  pentapeptide repeat protein  30.21 
 
 		 233 aa  80.5  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0440  pentapeptide repeat-containing protein  25.61 
 
 		 601 aa  80.5  0.0000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.203481  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  33.56 
 
 		 222 aa  80.9  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3757  pentapeptide repeat protein  30.21 
 
 		 233 aa  80.5  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  26.49 
 
 		 408 aa  79.7  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2083  hypothetical protein  20.73 
 
 		 738 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417715  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1034  hypothetical protein  20.73 
 
 		 738 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2008  hypothetical protein  20.73 
 
 		 738 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  29.24 
 
 		 309 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0739  hypothetical protein  20.73 
 
 		 738 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0870  pentapeptide repeat-containing protein  24.41 
 
 		 635 aa  79.3  0.0000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0861  pentapeptide repeat-containing protein  28.53 
 
 		 354 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0186818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>