More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01378 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01378  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  592  1e-168  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004091  predicted hydrolase/acyltransferase  83.45 
 
 		 284 aa  495  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1571  hypothetical protein  58.01 
 
 		 284 aa  308  5.9999999999999995e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0811227  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0907  putative hydrolase  44.29 
 
 		 289 aa  248  1e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1624  alpha/beta hydrolase fold  34.85 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.142246  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01136  hydrolase, alpha/beta fold family protein  31.49 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2178  alpha/beta hydrolase fold  32.75 
 
 		 288 aa  142  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.100362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2255  alpha/beta hydrolase fold  32.75 
 
 		 288 aa  142  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.170585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1732  alpha/beta hydrolase fold  32.53 
 
 		 297 aa  142  6e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.259687  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2582  alpha/beta fold family hydrolase  31.83 
 
 		 288 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2805  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 		 315 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011133  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1863  alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 		 288 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.164632  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  32.75 
 
 		 288 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  32.53 
 
 		 288 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2387  alpha/beta hydrolase fold  32.04 
 
 		 288 aa  138  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0869571  normal  0.603358 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  32.75 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  32.76 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1935  alpha/beta fold family hydrolase  31.48 
 
 		 311 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2027  Alpha/beta hydrolase fold  31.6 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.56393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1760  alpha/beta hydrolase fold  31.69 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0231247  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2124  alpha/beta hydrolase fold  31.29 
 
 		 294 aa  133  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321379 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1187  putative lipase  32.87 
 
 		 308 aa  132  5e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45778  predicted protein  34.77 
 
 		 359 aa  130  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2109  alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 		 294 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139583  normal  0.535795 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2218  hydrolase, alpha/beta fold family  30.31 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.364835  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2189  alpha/beta hydrolase fold  30.67 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113055  hitchhiker  0.000974583 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2449  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 		 291 aa  122  7e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.21931  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  31.13 
 
 		 306 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2459  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.664427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2095  putative hydrolase  30.12 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3651  putative hydrolase  30 
 
 		 286 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  27.76 
 
 		 282 aa  119  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0509  hypothetical protein  27.76 
 
 		 282 aa  119  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43540  putative hydrolase  29.58 
 
 		 286 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4202  epoxide hydrolase  28.36 
 
 		 284 aa  119  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1703  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 		 284 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198775  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4164  alpha/beta fold family hydrolase  29.1 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3489  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 284 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03843  hydrolase  32.05 
 
 		 244 aa  112  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1408  hypothetical protein  29.24 
 
 		 283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3736  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 		 284 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10140  alpha/beta hydrolase  29 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0243415  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3992  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 		 284 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1592  hypothetical protein  28.92 
 
 		 255 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2470  alpha/beta hydrolase  30.71 
 
 		 289 aa  103  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.890486  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4707  alpha/beta hydrolase fold protein  28.73 
 
 		 289 aa  93.2  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  31.47 
 
 		 289 aa  92.4  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 		 289 aa  88.6  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2967  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 		 308 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.594676 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1173  alpha/beta hydrolase fold  37.58 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.95564  decreased coverage  0.000000135804 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2246  alpha/beta hydrolase fold protein  29.02 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1098  Alpha/beta hydrolase fold  33.03 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2699  alpha/beta hydrolase  36.51 
 
 		 299 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2119  alpha/beta hydrolase fold  36.24 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0124464 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5407  Alpha/beta hydrolase  36.24 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.632759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  26.54 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2567  alpha/beta fold family hydrolase  27.59 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2186  alpha/beta fold family hydrolase  30.23 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3148  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2101  alpha/beta hydrolase fold  36.24 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5976  alpha/beta hydrolase fold  36.24 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  26.92 
 
 		 2762 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2138  alpha/beta hydrolase fold  36.5 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2011  alpha/beta hydrolase fold  35.77 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219515 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3301  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  25.94 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2571  alpha/beta fold family hydrolase  36.22 
 
 		 349 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2704  alpha/beta fold family hydrolase  36.22 
 
 		 340 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2772  putative hydrolase protein  32.56 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1684  alpha/beta fold family hydrolase  36.22 
 
 		 300 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.163104  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1459  alpha/beta fold family hydrolase  36.22 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3131  alpha/beta fold family hydrolase  36.22 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2625  alpha/beta fold family hydrolase  36.22 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738195  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0978  alpha/beta hydrolase fold  36.29 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  35.48 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.444129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1074  alpha/beta hydrolase fold  30.7 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1900  alpha/beta fold family hydrolase  36.22 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1062  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00192187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  26.03 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  25.11 
 
 		 289 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0437  alpha/beta hydrolase fold protein  27.23 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.885291  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1153  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2554  alpha/beta hydrolase fold  29.82 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000366635  normal  0.152292 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1135  putative hydrolase protein  37.9 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1579  putative hydrolase  37.5 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144323  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4804  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3775  alpha/beta hydrolase fold protein  35.54 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3081  alpha/beta hydrolase fold protein  32.88 
 
 		 371 aa  69.3  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0542902  normal  0.696639 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  29.01 
 
 		 267 aa  67  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  32.37 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  34.58 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  30.62 
 
 		 3045 aa  65.9  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.482882 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5377  alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 		 298 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5466  alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 		 298 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0306241 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5753  alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766272  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4319  Alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 		 277 aa  65.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>