More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000403 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3416  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding  70.87 
 
 		 656 aa  982    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5715  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  58.1 
 
 		 642 aa  793    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.159052  normal  0.670212 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2308  AMP-dependent synthetase and ligase  59.05 
 
 		 657 aa  800    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0111013 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3136  AMP-dependent synthetase and ligase  71.56 
 
 		 654 aa  993    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.601879 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2610  AMP-dependent synthetase and ligase  71.56 
 
 		 655 aa  999    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3509  AMP-dependent synthetase and ligase  61.16 
 
 		 655 aa  832    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  58.45 
 
 		 643 aa  787    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.610668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4176  AMP-dependent synthetase and ligase  58.73 
 
 		 642 aa  790    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1569  AMP-dependent synthetase and ligase  57.92 
 
 		 642 aa  785    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0297  AMP-dependent synthetase and ligase  58.46 
 
 		 643 aa  809    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179639  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4572  AMP-dependent synthetase and ligase  59.1 
 
 		 643 aa  797    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1832  AMP-dependent synthetase and ligase  71.38 
 
 		 655 aa  996    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.551344  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1861  AMP-dependent synthetase and ligase  60 
 
 		 650 aa  813    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0661736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 		 650 aa  1349    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.702328  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0545  AMP-dependent synthetase and ligase  45.3 
 
 		 649 aa  575  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0623  AMP-dependent synthetase and ligase  44.63 
 
 		 647 aa  572  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.431706  normal  0.0874065 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2424  AMP-dependent synthetase and ligase  43.97 
 
 		 649 aa  565  1.0000000000000001e-159  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  45.08 
 
 		 633 aa  558  1e-158  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2282  AMP-dependent synthetase and ligase  43.22 
 
 		 631 aa  553  1e-156  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0136  AMP-dependent synthetase and ligase  45.38 
 
 		 646 aa  537  1e-151  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1543  AMP-dependent synthetase and ligase  44.41 
 
 		 651 aa  537  1e-151  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00460036  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0946  AMP-binding protein  38.36 
 
 		 630 aa  476  1e-133  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.418296  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0830  AMP-dependent synthetase and ligase  38.05 
 
 		 630 aa  478  1e-133  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_817  AMP-binding protein, long-chain fatty-acid-CoA ligase  37.74 
 
 		 630 aa  475  1e-132  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3365  AMP-dependent synthetase and ligase  38.82 
 
 		 661 aa  458  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.865924  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0249  AMP-dependent synthetase and ligase  38.8 
 
 		 655 aa  449  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.463318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1159  AMP-dependent synthetase and ligase  38.11 
 
 		 645 aa  446  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0461  AMP-dependent synthetase and ligase  37.01 
 
 		 644 aa  436  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.185625  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5287  AMP-dependent synthetase and ligase  36.67 
 
 		 648 aa  438  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0048  AMP-dependent synthetase and ligase  37.93 
 
 		 658 aa  438  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.760787 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0470  AMP-dependent synthetase and ligase  37.01 
 
 		 682 aa  436  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.282335  normal  0.146944 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0260  AMP-dependent synthetase and ligase  36.89 
 
 		 652 aa  432  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2279  long chain acyl-CoA synthetase  36.57 
 
 		 653 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0373  acyl-CoA synthetase  37.61 
 
 		 656 aa  432  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0214  AMP-dependent synthetase and ligase  36.57 
 
 		 654 aa  432  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0954  AMP-dependent synthetase and ligase  36.57 
 
 		 653 aa  432  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5006  AMP-dependent synthetase and ligase  36.76 
 
 		 651 aa  423  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.604122  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0604  AMP-dependent synthetase and ligase  36.42 
 
 		 648 aa  424  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0571131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0113  AMP-dependent synthetase and ligase  36.99 
 
 		 661 aa  423  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2217  AMP-dependent synthetase and ligase  37.73 
 
 		 653 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0787  AMP-dependent synthetase and ligase  36.62 
 
 		 648 aa  419  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.418663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3542  AMP-dependent synthetase and ligase  36.05 
 
 		 648 aa  412  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3607  AMP-dependent synthetase and ligase  36.32 
 
 		 648 aa  412  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.385801 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2441  AMP-dependent synthetase and ligase  36.9 
 
 		 636 aa  407  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3434  AMP-dependent synthetase and ligase  35.11 
 
 		 648 aa  409  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00276334 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2725  AMP-dependent synthetase and ligase  35.85 
 
 		 654 aa  404  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.171087 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2375  AMP-dependent synthetase and ligase  36.5 
 
 		 634 aa  402  9.999999999999999e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4012  AMP-dependent synthetase and ligase  35.47 
 
 		 657 aa  399  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5039  AMP-dependent synthetase and ligase  34.76 
 
 		 659 aa  399  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.578261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  34.72 
 
 		 607 aa  372  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0406  AMP-dependent synthetase and ligase  33.83 
 
 		 609 aa  355  1e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  33.77 
 
 		 611 aa  352  1e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2355  AMP-dependent synthetase and ligase  33.44 
 
 		 610 aa  349  9e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115359  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3503  AMP-dependent synthetase and ligase  34.77 
 
 		 618 aa  343  5e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129901  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4936  AMP-dependent synthetase and ligase  34.33 
 
 		 626 aa  338  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457065  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4099  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 623 aa  330  6e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3837  AMP-dependent synthetase and ligase  33.5 
 
 		 601 aa  327  5e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4067  AMP-dependent synthetase and ligase  31.96 
 
 		 603 aa  325  1e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.675218  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  28.3 
 
 		 633 aa  253  8.000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  27.38 
 
 		 603 aa  252  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  26.07 
 
 		 603 aa  249  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6512  AMP-dependent synthetase and ligase  29.95 
 
 		 635 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.583924 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  27.6 
 
 		 622 aa  243  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4907  AMP-dependent synthetase and ligase  29.04 
 
 		 635 aa  240  5e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3256  AMP-dependent synthetase and ligase  29.04 
 
 		 635 aa  240  5e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.653152 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  27.65 
 
 		 617 aa  238  4e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  27.24 
 
 		 605 aa  237  6e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  27.49 
 
 		 594 aa  236  7e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  28.96 
 
 		 599 aa  236  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  26.59 
 
 		 603 aa  233  6e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  25.57 
 
 		 607 aa  233  6e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2259  AMP-dependent synthetase and ligase  28.52 
 
 		 616 aa  231  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000572274  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4679  AMP-dependent synthetase and ligase  28.01 
 
 		 596 aa  231  4e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155196  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  28.64 
 
 		 649 aa  231  5e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  26.69 
 
 		 607 aa  229  8e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  28.76 
 
 		 592 aa  229  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  26.22 
 
 		 590 aa  227  6e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  26.12 
 
 		 596 aa  226  9e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  26.89 
 
 		 606 aa  226  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1523  AMP-dependent synthetase and ligase  26.36 
 
 		 599 aa  226  1e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  26.9 
 
 		 612 aa  226  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  27.05 
 
 		 606 aa  225  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1953  AMP-dependent synthetase and ligase  28.38 
 
 		 613 aa  224  4e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.163962 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  29.13 
 
 		 592 aa  224  4.9999999999999996e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  27.35 
 
 		 587 aa  223  9e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  26.4 
 
 		 633 aa  221  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28860  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  26.19 
 
 		 612 aa  221  3.9999999999999997e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  27.07 
 
 		 598 aa  220  5e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  25.93 
 
 		 602 aa  219  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001650  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.18 
 
 		 602 aa  219  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0061  AMP-dependent synthetase and ligase  26.68 
 
 		 598 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.783683  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  26.39 
 
 		 606 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5953  AMP-dependent synthetase and ligase  27.23 
 
 		 612 aa  217  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664785  normal  0.0418717 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  27.61 
 
 		 610 aa  217  5e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  27.63 
 
 		 597 aa  216  9e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3508  AMP-dependent synthetase and ligase  28.08 
 
 		 607 aa  216  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  24.76 
 
 		 610 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  26.01 
 
 		 592 aa  215  1.9999999999999998e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3293  AMP-dependent synthetase and ligase  26.24 
 
 		 597 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0962  AMP-dependent synthetase and ligase  26.13 
 
 		 604 aa  214  2.9999999999999995e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182465  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>