More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6512 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4907  AMP-dependent synthetase and ligase  95.12 
 
 		 635 aa  1243    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6512  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 635 aa  1307    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.583924 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3256  AMP-dependent synthetase and ligase  95.12 
 
 		 635 aa  1243    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.653152 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  35.41 
 
 		 607 aa  357  5e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0623  AMP-dependent synthetase and ligase  32.84 
 
 		 647 aa  310  5e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.431706  normal  0.0874065 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4936  AMP-dependent synthetase and ligase  33.06 
 
 		 626 aa  308  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457065  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0545  AMP-dependent synthetase and ligase  33.11 
 
 		 649 aa  303  7.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4099  AMP-dependent synthetase and ligase  34.2 
 
 		 623 aa  296  8e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3503  AMP-dependent synthetase and ligase  31.24 
 
 		 618 aa  293  6e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129901  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2424  AMP-dependent synthetase and ligase  32.69 
 
 		 649 aa  291  3e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  33.22 
 
 		 603 aa  287  4e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2355  AMP-dependent synthetase and ligase  31.36 
 
 		 610 aa  286  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115359  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  32.45 
 
 		 603 aa  281  3e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1543  AMP-dependent synthetase and ligase  32.41 
 
 		 651 aa  276  1.0000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00460036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  32.08 
 
 		 633 aa  274  3e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1569  AMP-dependent synthetase and ligase  31.51 
 
 		 642 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4572  AMP-dependent synthetase and ligase  31.65 
 
 		 643 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0406  AMP-dependent synthetase and ligase  30.51 
 
 		 609 aa  270  4e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2282  AMP-dependent synthetase and ligase  30.96 
 
 		 631 aa  268  2e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  31.68 
 
 		 610 aa  268  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  31.86 
 
 		 602 aa  268  2.9999999999999995e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5715  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  31.51 
 
 		 642 aa  267  4e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.159052  normal  0.670212 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1953  AMP-dependent synthetase and ligase  31.54 
 
 		 613 aa  267  5.999999999999999e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.163962 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  31.67 
 
 		 594 aa  266  8e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  31.65 
 
 		 633 aa  266  1e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2941  AMP-dependent synthetase and ligase  32.05 
 
 		 773 aa  265  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.227779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0136  AMP-dependent synthetase and ligase  30.51 
 
 		 646 aa  263  6e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  30.02 
 
 		 603 aa  263  6e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  30.71 
 
 		 643 aa  263  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.610668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  28.31 
 
 		 607 aa  263  1e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3617  AMP-dependent synthetase and ligase  31.88 
 
 		 608 aa  262  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0692269  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4679  AMP-dependent synthetase and ligase  30.63 
 
 		 596 aa  262  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155196  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4067  AMP-dependent synthetase and ligase  30.86 
 
 		 603 aa  261  3e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.675218  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3365  AMP-dependent synthetase and ligase  30.02 
 
 		 661 aa  261  3e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.865924  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  30.5 
 
 		 617 aa  259  7e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0297  AMP-dependent synthetase and ligase  31.66 
 
 		 643 aa  258  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179639  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  29.1 
 
 		 611 aa  258  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3837  AMP-dependent synthetase and ligase  31.16 
 
 		 601 aa  257  5e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2308  AMP-dependent synthetase and ligase  31.56 
 
 		 657 aa  256  8e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0111013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5953  AMP-dependent synthetase and ligase  28.95 
 
 		 612 aa  256  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664785  normal  0.0418717 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  31.58 
 
 		 601 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  30.69 
 
 		 649 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0249  AMP-dependent synthetase and ligase  29.08 
 
 		 655 aa  254  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.463318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  31.19 
 
 		 598 aa  254  4.0000000000000004e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2217  AMP-dependent synthetase and ligase  30.67 
 
 		 653 aa  254  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0604  AMP-dependent synthetase and ligase  29.4 
 
 		 648 aa  253  8.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0571131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0260  AMP-dependent synthetase and ligase  29.55 
 
 		 652 aa  252  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  31.2 
 
 		 606 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12215  long-chain fatty-acid-CoA ligase fadD15  29.92 
 
 		 600 aa  252  1e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3293  AMP-dependent synthetase and ligase  31.55 
 
 		 597 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0113  AMP-dependent synthetase and ligase  30.46 
 
 		 661 aa  252  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4176  AMP-dependent synthetase and ligase  30.92 
 
 		 642 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2259  AMP-dependent synthetase and ligase  29.52 
 
 		 616 aa  251  3e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000572274  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  29.34 
 
 		 610 aa  250  5e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3549  AMP-dependent synthetase and ligase  30.46 
 
 		 602 aa  250  6e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821705  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2441  AMP-dependent synthetase and ligase  30.54 
 
 		 636 aa  249  9e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3542  AMP-dependent synthetase and ligase  29.05 
 
 		 648 aa  249  9e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  28.52 
 
 		 610 aa  249  1e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3508  AMP-dependent synthetase and ligase  32.11 
 
 		 607 aa  248  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.95 
 
 		 650 aa  248  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.702328  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3434  AMP-dependent synthetase and ligase  29.65 
 
 		 648 aa  248  3e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00276334 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  29.11 
 
 		 605 aa  248  3e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  31.39 
 
 		 597 aa  248  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  31.48 
 
 		 606 aa  248  3e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3344  AMP-dependent synthetase and ligase  31.39 
 
 		 597 aa  248  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.260522  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0214  AMP-dependent synthetase and ligase  28.75 
 
 		 654 aa  247  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2725  AMP-dependent synthetase and ligase  29.28 
 
 		 654 aa  247  4.9999999999999997e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.171087 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1832  AMP-dependent synthetase and ligase  29.06 
 
 		 655 aa  247  6e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.551344  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  30.94 
 
 		 604 aa  247  6e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0048  AMP-dependent synthetase and ligase  30.26 
 
 		 658 aa  246  6.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.760787 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  30.94 
 
 		 604 aa  246  8e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1388  AMP-dependent synthetase and ligase  29.06 
 
 		 602 aa  246  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  31.05 
 
 		 606 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28860  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  30.39 
 
 		 612 aa  245  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2937  AMP-dependent synthetase and ligase  30.65 
 
 		 610 aa  245  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1861  AMP-dependent synthetase and ligase  30.26 
 
 		 650 aa  245  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0661736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  30.77 
 
 		 604 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  29.84 
 
 		 595 aa  243  7e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0191  AMP-dependent synthetase and ligase  29.3 
 
 		 605 aa  243  7.999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353972  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6067  AMP-dependent synthetase and ligase  29.68 
 
 		 615 aa  243  9e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1159  AMP-dependent synthetase and ligase  28.85 
 
 		 645 aa  242  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2680  AMP-dependent synthetase and ligase  31.62 
 
 		 601 aa  242  1e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487535  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 		 622 aa  242  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3607  AMP-dependent synthetase and ligase  28.78 
 
 		 648 aa  242  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.385801 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  28.9 
 
 		 609 aa  242  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3241  AMP-dependent synthetase and ligase  30.87 
 
 		 599 aa  241  4e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00258779  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  30.68 
 
 		 612 aa  240  5e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1820  AMP-dependent synthetase and ligase  30.57 
 
 		 604 aa  240  5e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.591607 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  30.54 
 
 		 607 aa  240  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2279  long chain acyl-CoA synthetase  29.85 
 
 		 653 aa  239  9e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0954  AMP-dependent synthetase and ligase  29.85 
 
 		 653 aa  239  9e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  29.23 
 
 		 599 aa  239  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  27.57 
 
 		 610 aa  238  2e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3113  AMP-dependent synthetase and ligase  31.54 
 
 		 600 aa  238  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1129  AMP-dependent synthetase and ligase  31.7 
 
 		 597 aa  236  7e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.784239 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2949  AMP-dependent synthetase and ligase  29.59 
 
 		 591 aa  236  8e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.179874  normal  0.0506355 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  27.89 
 
 		 610 aa  236  9e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2411  AMP-dependent synthetase and ligase  29.72 
 
 		 612 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0461  AMP-dependent synthetase and ligase  27.55 
 
 		 644 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.185625  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0470  AMP-dependent synthetase and ligase  27.55 
 
 		 682 aa  235  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.282335  normal  0.146944 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>