More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1169 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1169  membrane-fusion protein  100 
 
 		 377 aa  763    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0146013  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003046  membrane-fusion protein  65.78 
 
 		 377 aa  506  9.999999999999999e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02838  hypothetical protein  66.93 
 
 		 378 aa  503  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1440  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.58 
 
 		 374 aa  194  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2283  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.04 
 
 		 361 aa  150  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00902179 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3518  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.82 
 
 		 379 aa  133  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224234  normal  0.212959 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01120  membrane fusion efflux protein  27.85 
 
 		 373 aa  132  6.999999999999999e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1670  RND family efflux transporter MFP subunit  24.45 
 
 		 371 aa  120  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  28.57 
 
 		 408 aa  114  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1666  RND family efflux transporter MFP subunit  27.12 
 
 		 368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  28.31 
 
 		 408 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  26.22 
 
 		 400 aa  103  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  27.14 
 
 		 380 aa  98.6  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1259  RND family efflux transporter MFP subunit  25.77 
 
 		 415 aa  97.4  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.73 
 
 		 414 aa  95.9  9e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.39 
 
 		 453 aa  95.5  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2466  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.59 
 
 		 396 aa  93.2  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0725  HlyD family secretion protein  26.65 
 
 		 397 aa  93.2  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897812  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1685  RND family efflux transporter MFP subunit  27.99 
 
 		 387 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3559  RND family efflux transporter MFP subunit  25.82 
 
 		 396 aa  92  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0492868  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.63 
 
 		 428 aa  92  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  26.39 
 
 		 384 aa  92  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1666  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 418 aa  91.3  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1970  secretion protein HlyD  26.7 
 
 		 390 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0699832  normal  0.38447 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0365  membrane-fusion protein  25.45 
 
 		 394 aa  88.6  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1204  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.89 
 
 		 471 aa  87.4  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3415  secretion protein HlyD  26.41 
 
 		 397 aa  86.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.89814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4953  RND family efflux transporter MFP subunit  26.41 
 
 		 397 aa  86.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.162755  normal  0.0662922 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5333  RND family efflux transporter MFP subunit  26.41 
 
 		 397 aa  86.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.037024 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0096  putative macrolide-specific efflux protein MacA  27.98 
 
 		 399 aa  85.9  0.000000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0307  RND family efflux transporter MFP subunit  26.82 
 
 		 413 aa  85.9  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0899354  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0319  RND family efflux transporter MFP subunit  24.23 
 
 		 417 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.91 
 
 		 453 aa  85.1  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3781  RND family efflux transporter MFP subunit  26.87 
 
 		 407 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1637  RND family efflux transporter MFP subunit  27.71 
 
 		 465 aa  85.1  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33770  hypothetical protein  25.27 
 
 		 391 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127582  hitchhiker  0.00383681 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2617  secretion protein HlyD  26.84 
 
 		 385 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000106145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1334  secretion protein HlyD  27.02 
 
 		 410 aa  84  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  27.55 
 
 		 429 aa  84  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  24.08 
 
 		 370 aa  83.6  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  24.08 
 
 		 370 aa  83.6  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2871  hypothetical protein  25.27 
 
 		 391 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  24.08 
 
 		 370 aa  83.6  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.13 
 
 		 383 aa  83.2  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2865  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.37 
 
 		 478 aa  82  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0716848 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3168  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.92 
 
 		 430 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479459  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0820  HlyD family secretion protein  24.12 
 
 		 405 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.34 
 
 		 409 aa  82  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4850  RND family efflux transporter MFP subunit  23.55 
 
 		 385 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0635  macrolide-specific efflux protein macA  22.44 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0167041  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  26.39 
 
 		 426 aa  80.5  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  24.12 
 
 		 409 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000285815  normal  0.0164702 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1634  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.13 
 
 		 417 aa  79.7  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2452  RND family efflux transporter MFP subunit  24.41 
 
 		 428 aa  79  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.591296 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0800  RND family efflux transporter MFP subunit  24.61 
 
 		 416 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000642362  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3548  RND family efflux transporter MFP subunit  25.68 
 
 		 442 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2825  Fis family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 466 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506795  normal  0.45265 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1857  secretion protein HlyD  25.62 
 
 		 390 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.22 
 
 		 448 aa  78.6  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3038  secretion protein HlyD  23.97 
 
 		 403 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.5 
 
 		 466 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2160  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.2 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.337788  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1423  RND family efflux transporter MFP subunit  23.99 
 
 		 401 aa  77.4  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0573  macrolide secretion protein MacA  21.68 
 
 		 455 aa  77.4  0.0000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.00000000000123833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1414  secretion protein HlyD  24.42 
 
 		 430 aa  77  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2754  RND efflux transporter  23.99 
 
 		 401 aa  77.4  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000226253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1892  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.94 
 
 		 430 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.28 
 
 		 410 aa  77  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.61066  normal  0.83964 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3233  RND family efflux transporter MFP subunit  24.43 
 
 		 405 aa  77  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000196171  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1080  MacA  20.52 
 
 		 394 aa  76.6  0.0000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0987  secretion protein HlyD  26.1 
 
 		 419 aa  76.6  0.0000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2972  secretion protein HlyD  23.65 
 
 		 429 aa  76.3  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1312  RND efflux transporter  23.99 
 
 		 401 aa  76.3  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000130358  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2831  syringolide efflux protein SyfC  25.63 
 
 		 383 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.580145  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004022  membrane-fusion protein  28.44 
 
 		 369 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000160707  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0942  macrolide transporter subunit MacA  25 
 
 		 372 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1039  macrolide transporter subunit MacA  25 
 
 		 372 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0322  RND family efflux transporter MFP subunit  23.84 
 
 		 353 aa  75.9  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619651 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001980  probable RND efflux membrane fusion protein  24.23 
 
 		 367 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.979341  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2186  macrolide efflux protein MacA  23.47 
 
 		 428 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0836  macrolide efflux protein MacA  23.47 
 
 		 435 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0404665  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1101  RND family efflux transporter MFP subunit  24.54 
 
 		 414 aa  74.7  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402678  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0709  macrolide-specific efflux protein macA  21.77 
 
 		 390 aa  74.3  0.000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3533  RND family efflux transporter MFP subunit  24.55 
 
 		 409 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.722317 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0563  secretion protein HlyD  21.46 
 
 		 456 aa  74.3  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0927  macrolide efflux protein MacA  22.98 
 
 		 399 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2220  RND family efflux transporter MFP subunit  24.5 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3561  secretion protein HlyD  25.81 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.398677 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0976  macrolide transporter subunit MacA  24.74 
 
 		 372 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4209  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.61 
 
 		 392 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.35 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000019827  hitchhiker  0.00000000236896 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  24.61 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1706  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.94 
 
 		 430 aa  73.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6610  RND family efflux transporter MFP subunit  22.34 
 
 		 394 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.260284  normal  0.566522 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0472  secretion protein HlyD  25.27 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000402153  normal  0.138011 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3536  RND family efflux transporter MFP subunit  24.35 
 
 		 416 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.5 
 
 		 419 aa  73.2  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321445  normal  0.921537 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  24.61 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  24.61 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  24.61 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>