More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1534 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1534  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 249 aa  480  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0334786  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0913  transcriptional regulator, MerR family  45.28 
 
 		 260 aa  136  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.260144 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4036  transcriptional regulator, MerR family  64.76 
 
 		 262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000546536  normal  0.0325517 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4880  transcriptional regulator, MerR family  69.15 
 
 		 249 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8430  putative transcriptional regulator, MerR family  39.58 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0668  transcriptional regulator, MerR family  46.85 
 
 		 272 aa  95.9  6e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000812117  hitchhiker  0.0000325432 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3346  transcriptional regulator, MerR family  35.59 
 
 		 241 aa  89  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.152739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2417  putative transcriptional regulator, MerR family  39.29 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3594  transcriptional regulator, MerR family  35.82 
 
 		 278 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0868  transcriptional regulator, MerR family  35.48 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.915054 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1354  transcriptional regulator, MerR family  34.22 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5720  MerR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4378  transcriptional regulator, MerR family  45.36 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5341  MerR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.138898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5430  MerR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6059  transcriptional regulator, MerR family  31.16 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2640  transcriptional regulator, MerR family  29.45 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2419  regulatory protein, MerR  53.33 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.110485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2028  transcriptional regulator, MerR family  32.05 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000014266  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4382  regulatory protein, MerR  39.34 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0374  MerR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  hitchhiker  0.00531151 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4282  transcriptional regulator, MerR family  34.18 
 
 		 308 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2048  transcriptional regulator, MerR family  43.09 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.144756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8874  transcriptional regulator, MerR family  40.91 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2659  transcriptional regulator, MerR family  41.9 
 
 		 246 aa  75.1  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.587322  normal  0.281971 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 342 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 342 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 342 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2662  transcriptional regulator, MerR family  42.72 
 
 		 126 aa  73.6  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00193678  hitchhiker  0.00916479 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4873  MerR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686737  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0543  transcriptional regulator, MerR family  35.06 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2819  transcriptional regulator, MerR family protein  40.38 
 
 		 129 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1862  transcriptional regulator, MerR family  40.54 
 
 		 247 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0767866 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 342 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 342 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3990  transcriptional regulator, MerR family  34.02 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.340501  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1265  transcriptional regulator, MerR family  39.29 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 253 aa  67  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20960  predicted transcriptional regulator  33.67 
 
 		 310 aa  67  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.376744  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2144  MerR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000183728  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4229  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 343 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  40.86 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  40.86 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2015  putative transcriptional regulator, MerR family  47.06 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2173  regulatory protein, MerR  38.89 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 186 aa  64.7  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0047  MerR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  25.58 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  38.32 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0194  MerR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3862  precorrin-8X methylmutase  31.07 
 
 		 368 aa  63.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.268065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  49.25 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0714  putative transcriptional regulator, MerR family  38.78 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0470  putative transcriptional regulator, MerR family  38.05 
 
 		 133 aa  63.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0220  MerR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2831  MerR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1345  transcriptional regulator, MerR family  36.08 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1103  MerR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.394367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1117  MerR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2902  MerR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1604  MerR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2912  MerR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0392  MerR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0882  MerR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.656142 
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3299  MerR family transcriptional regulator  45.35 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  35.66 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  31.54 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0438  transcriptional regulator, MerR family  47.06 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1032  transcriptional regulator, MerR family  32.46 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.920994  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4002  MerR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0586  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.58 
 
 		 135 aa  62  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.775911 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  42.25 
 
 		 314 aa  62  0.000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  35.29 
 
 		 137 aa  62  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0530  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.58 
 
 		 135 aa  62  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 252 aa  62  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0894  MerR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 135 aa  62  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0660  MerR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 137 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2325  MerR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 135 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 648 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2999  regulatory protein, MerR  47.83 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.645753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2868  MerR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 129 aa  61.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000311414  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  32.81 
 
 		 254 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  44.12 
 
 		 135 aa  61.6  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3123  transcriptional regulator, MerR family  31.58 
 
 		 135 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.856714  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2788  MerR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 127 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.291885  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3026  transcriptional regulator, MerR family  33.91 
 
 		 137 aa  60.8  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  43.48 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  36.7 
 
 		 162 aa  61.2  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2665  MerR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 639 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  47.69 
 
 		 154 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35820  predicted transcriptional regulator  39.18 
 
 		 134 aa  60.5  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0422  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.58 
 
 		 135 aa  60.8  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2967  MerR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 127 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0566  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.58 
 
 		 135 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0526  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.58 
 
 		 135 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>