More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0454 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0454  ABC transporter related  100 
 
 		 286 aa  569  1e-161  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  51.05 
 
 		 290 aa  301  1e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  45.17 
 
 		 293 aa  265  8.999999999999999e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  44.14 
 
 		 293 aa  263  2e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  43.9 
 
 		 313 aa  224  1e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  41.24 
 
 		 293 aa  224  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1774  ABC transporter related protein  35.27 
 
 		 304 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1634  ABC transporter related  41.78 
 
 		 297 aa  209  3e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00180587  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  34.47 
 
 		 307 aa  193  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3702  ABC transporter, ATP-binding protein  37.33 
 
 		 297 aa  193  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000381067  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1615  ABC transporter, ATP-binding protein  37.67 
 
 		 297 aa  192  6e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.002407  hitchhiker  0.000000022556 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3610  ABC transporter, ATP-binding protein  37.67 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000012403  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1988  ABC transporter, ATP-binding protein  42.91 
 
 		 293 aa  190  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000119924  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3620  ABC transporter, ATP-binding protein  37.67 
 
 		 297 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627092  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3279  ABC transporter related  37.33 
 
 		 297 aa  190  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00236807  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  33.79 
 
 		 300 aa  190  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3388  ABC transporter ATP-binding protein  36.99 
 
 		 297 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.955224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3300  ABC transporter, ATP-binding protein  36.99 
 
 		 297 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000068812  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3653  ABC transporter ATP-binding protein  36.99 
 
 		 297 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.169658  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3604  ABC transporter, ATP-binding protein  36.99 
 
 		 297 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.12304e-23 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3351  ABC transporter, ATP-binding protein  36.99 
 
 		 297 aa  189  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182827  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0022  ABC transporter ATP-binding protein, CesC  36.46 
 
 		 291 aa  188  7e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  34.74 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0999  ABC transporter related protein  32.75 
 
 		 300 aa  185  6e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0080  ABC transporter related  32.65 
 
 		 305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5524  ABC transporter related protein  32.99 
 
 		 304 aa  182  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0655  ABC transporter, ATP-binding protein  38.51 
 
 		 295 aa  181  1e-44  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1839  ABC transporter related  34.63 
 
 		 339 aa  181  1e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5390  ABC transporter ATP-binding protein  32.4 
 
 		 307 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4499  ABC transporter-related protein  29.51 
 
 		 301 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.151592  normal  0.728129 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7394  ABC transporter ATP-binding protein  36 
 
 		 306 aa  179  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3755  ABC transporter related  31.36 
 
 		 306 aa  179  4.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0353  ABC transporter related  31.74 
 
 		 303 aa  179  5.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0251  ABC transporter related protein  31.36 
 
 		 297 aa  178  9e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  33.79 
 
 		 302 aa  177  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1987  ABC transporter, ATP-binding protein  40.47 
 
 		 314 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00134078  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2197  ABC transporter related  29.31 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5634  ABC transporter related  31.36 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4248  ABC transporter related protein  34.68 
 
 		 390 aa  176  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2985  ABC transporter related protein  32.15 
 
 		 327 aa  176  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1757  ABC transporter related  30.88 
 
 		 306 aa  176  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000332956  normal  0.307261 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2771  ABC transporter related  30.17 
 
 		 307 aa  175  6e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160437 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0537  ABC transporter related  30 
 
 		 306 aa  174  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36950  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  31.01 
 
 		 302 aa  174  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369481  normal  0.0795079 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2719  ABC transporter related  30.56 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5390  ABC transporter related protein  29.62 
 
 		 305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2559  ABC transporter related  30.85 
 
 		 309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2540  ABC transporter related  30.21 
 
 		 308 aa  172  5e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  0.404548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3997  ABC transporter related  30.8 
 
 		 313 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4071  ABC transporter related  30.8 
 
 		 313 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4011  ABC transporter related  30.8 
 
 		 313 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0155501  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl255  multidrug ABC transporter ATP-binding component  42.51 
 
 		 247 aa  172  7.999999999999999e-42  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000090688  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  29.86 
 
 		 308 aa  171  9e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4603  ABC transporter related protein  30.31 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1681  ABC transporter related protein  31.36 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283313 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22150  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  29.14 
 
 		 324 aa  170  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.228771 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.88 
 
 		 302 aa  169  6e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1665  ABC transporter related  29.27 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148623  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  30.31 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2171  ABC transporter related  33.56 
 
 		 299 aa  166  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11242  tetronasin ABC transporter ATP-binding protein  29.51 
 
 		 311 aa  166  5e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0309392  normal  0.0409812 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0101  ABC transporter related protein  30.31 
 
 		 299 aa  165  5.9999999999999996e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3201  ABC transporter-like protein  29.97 
 
 		 309 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  30.21 
 
 		 337 aa  166  5.9999999999999996e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751927  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25800  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  30 
 
 		 312 aa  165  5.9999999999999996e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2922  ABC transporter related protein  28.82 
 
 		 304 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2211  ABC transporter related  31.14 
 
 		 312 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  34 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2618  ABC transporter related  29.11 
 
 		 317 aa  163  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000477395  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1245  ABC transporter related protein  32.19 
 
 		 313 aa  161  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0256  heme exporter protein CcmA  32.64 
 
 		 291 aa  161  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.197051  normal  0.658869 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  38.53 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  30.96 
 
 		 356 aa  160  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6149  ABC transporter related  34.98 
 
 		 328 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  36.13 
 
 		 305 aa  160  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  30.2 
 
 		 305 aa  159  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  40.72 
 
 		 240 aa  159  5e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  37.66 
 
 		 308 aa  159  5e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  42.79 
 
 		 317 aa  159  5e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5638  ABC transporter related  38.21 
 
 		 301 aa  158  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.321953 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  29.83 
 
 		 340 aa  158  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  31.79 
 
 		 319 aa  157  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  33.07 
 
 		 305 aa  157  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0115  ABC transporter related  40.76 
 
 		 301 aa  157  1e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2206  ABC transporter related  28.77 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758752  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  36.53 
 
 		 328 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  41.74 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  39.91 
 
 		 235 aa  157  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2252  ABC transporter related  28.77 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.951966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  36.92 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  32.69 
 
 		 311 aa  156  4e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2585  ABC transporter related  28.57 
 
 		 302 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2711  ABC transporter related protein  31.64 
 
 		 305 aa  155  6e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358434  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  31.02 
 
 		 341 aa  155  7e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  33.72 
 
 		 327 aa  155  7e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  35.27 
 
 		 250 aa  155  7e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  36.36 
 
 		 236 aa  155  8e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  36.05 
 
 		 308 aa  155  8e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2782  ABC transporter related  27.87 
 
 		 302 aa  155  9e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.561462  decreased coverage  0.00015802 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1356  ABC transporter related  36.11 
 
 		 309 aa  155  9e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0445843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>