More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0154 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0154  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 410 aa  828    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0144  recombination factor protein RarA  62.1 
 
 		 378 aa  479  1e-134  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0429  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  47.17 
 
 		 599 aa  375  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000753896  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0414  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  46.19 
 
 		 599 aa  367  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174137  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  41.83 
 
 		 432 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  42.4 
 
 		 457 aa  327  3e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0141  ATPase central domain-containing protein  43.6 
 
 		 416 aa  326  5e-88  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  41.41 
 
 		 447 aa  326  5e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  42.45 
 
 		 440 aa  323  4e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  42.17 
 
 		 450 aa  319  5e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  44.42 
 
 		 431 aa  318  1e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  43.84 
 
 		 441 aa  317  2e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  40.81 
 
 		 447 aa  316  5e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  41.01 
 
 		 448 aa  316  5e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  40.89 
 
 		 435 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  41.39 
 
 		 441 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1618  recombination factor protein RarA  43.79 
 
 		 445 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  41.8 
 
 		 434 aa  311  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05640  putative ATPase, AAA family protein  41.75 
 
 		 425 aa  311  2e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  41.65 
 
 		 434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  40.05 
 
 		 446 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1440  recombination factor protein RarA  39.9 
 
 		 426 aa  305  7e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  41.25 
 
 		 437 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  41.49 
 
 		 437 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  41.25 
 
 		 437 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  40.62 
 
 		 440 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  40.91 
 
 		 443 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  39.18 
 
 		 453 aa  302  6.000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1498  AAA ATPase central domain protein  41.25 
 
 		 435 aa  302  8.000000000000001e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  40.25 
 
 		 429 aa  300  2e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  40.8 
 
 		 435 aa  300  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  39.61 
 
 		 441 aa  298  1e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0836  recombination factor protein RarA  39.71 
 
 		 449 aa  298  1e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5733  AAA ATPase central domain protein  40.58 
 
 		 423 aa  296  6e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855875  normal  0.0926038 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0410  recombination factor protein RarA  39.38 
 
 		 425 aa  295  1e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.108672  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  39.15 
 
 		 439 aa  294  2e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  39.44 
 
 		 457 aa  293  3e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0832  recombination factor protein RarA  40.77 
 
 		 454 aa  293  3e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  40.15 
 
 		 432 aa  292  7e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  38.46 
 
 		 457 aa  292  9e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  38.97 
 
 		 457 aa  291  1e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1192  recombination factor protein RarA  38.46 
 
 		 445 aa  290  3e-77  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2231  recombination factor protein RarA  39.86 
 
 		 443 aa  290  4e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00515157  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  40 
 
 		 435 aa  290  4e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1287  recombination factor protein RarA  39.86 
 
 		 430 aa  290  5.0000000000000004e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0726  recombination factor protein RarA  38.1 
 
 		 439 aa  288  9e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.658884  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0165  AAA ATPase central domain protein  39.29 
 
 		 419 aa  288  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2132  AAA ATPase central domain protein  39.28 
 
 		 463 aa  288  1e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000588224  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0184  AAA ATPase central domain protein  40.52 
 
 		 426 aa  288  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1464  recombination factor protein RarA  39.19 
 
 		 438 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.519548  normal  0.727455 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1125  AAA ATPase central domain protein  41.19 
 
 		 408 aa  286  4e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00180693  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  36.77 
 
 		 447 aa  286  7e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0336  hypothetical protein  40.59 
 
 		 431 aa  285  8e-76  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.673936 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2481  recombination factor protein RarA  40.43 
 
 		 443 aa  285  8e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000627884  hitchhiker  0.00000452551 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0420  AAA ATPase central domain protein  38.01 
 
 		 423 aa  285  9e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  40.58 
 
 		 432 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07770  Recombination protein MgsA  39.61 
 
 		 446 aa  284  2.0000000000000002e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.138045 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1650  recombination factor protein RarA  37.89 
 
 		 440 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2484  recombination factor protein RarA  38.74 
 
 		 435 aa  283  5.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2129  recombination factor protein RarA  39.47 
 
 		 443 aa  281  1e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000081607  normal  0.0213472 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1519  recombination factor protein RarA  38.13 
 
 		 447 aa  281  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.615755  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2308  recombination factor protein RarA  38 
 
 		 445 aa  281  2e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1573  recombination factor protein RarA  37.9 
 
 		 446 aa  281  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.319389  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0288  recombination factor protein RarA  38.88 
 
 		 443 aa  281  2e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1323  recombination factor protein RarA  40.14 
 
 		 411 aa  280  3e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0587994  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2193  recombination factor protein RarA  39.47 
 
 		 443 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000160471  normal  0.268912 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2052  recombination factor protein RarA  38 
 
 		 443 aa  280  3e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00508723  hitchhiker  0.000142667 
 
 
-
 
NC_002950  PG1103  recombination factor protein RarA  38.52 
 
 		 434 aa  280  4e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2022  recombination factor protein RarA  38.48 
 
 		 443 aa  280  4e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000134258  hitchhiker  0.0000234257 
 
 
-
 
NC_004310  BR1206  recombination factor protein RarA  38.52 
 
 		 437 aa  280  4e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2713  recombination factor protein RarA  38.26 
 
 		 442 aa  280  4e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0027  AAA ATPase central domain protein  37.81 
 
 		 459 aa  280  4e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.797145 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3365  recombination factor protein RarA  38.26 
 
 		 442 aa  280  4e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.263258 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2011  recombination factor protein RarA  38 
 
 		 443 aa  280  4e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00309542  hitchhiker  0.000363492 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1169  recombination factor protein RarA  38.52 
 
 		 437 aa  280  4e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0725259  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1668  AAA ATPase central domain protein  38.07 
 
 		 463 aa  279  5e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0287351  normal  0.641434 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  38 
 
 		 447 aa  279  5e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3176  recombination factor protein RarA  38.44 
 
 		 435 aa  280  5e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  37.68 
 
 		 731 aa  280  5e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00871  recombination factor protein RarA  40.3 
 
 		 428 aa  279  5e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00891  recombination factor protein RarA  39.02 
 
 		 429 aa  279  6e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1365  recombination factor protein RarA  38.72 
 
 		 438 aa  279  7e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2506  recombination factor protein RarA  39.41 
 
 		 437 aa  279  8e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0774  recombination factor protein RarA  40.72 
 
 		 444 aa  279  8e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0591315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  37.68 
 
 		 437 aa  279  8e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  39.45 
 
 		 458 aa  278  2e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1103  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  38.26 
 
 		 726 aa  277  3e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000432194  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0350  recombination factor protein RarA  38.37 
 
 		 440 aa  277  3e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2213  recombination factor protein RarA  39.23 
 
 		 443 aa  277  3e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000293647  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1965  recombination factor protein RarA  37.53 
 
 		 443 aa  277  3e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00069227  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1983  recombination factor protein RarA  38.52 
 
 		 438 aa  277  3e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2321  recombination factor protein RarA  39 
 
 		 443 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000013456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3416  recombination factor protein RarA  37.26 
 
 		 442 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.384623  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  35.45 
 
 		 461 aa  276  4e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3636  recombination factor protein RarA  36.76 
 
 		 443 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522644  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2158  recombination factor protein RarA  39 
 
 		 443 aa  276  5e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00790556  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0855  recombination factor protein RarA  38.19 
 
 		 451 aa  276  5e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  34.48 
 
 		 463 aa  276  6e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0547  AAA ATPase central domain protein  40.15 
 
 		 421 aa  276  6e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3209  recombination factor protein RarA  38.55 
 
 		 432 aa  276  7e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411759  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>