128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2554 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2554  methyltransferase type 12  100 
 
 		 215 aa  440  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239321  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2405  methyltransferase-related protein  52.17 
 
 		 222 aa  238  6.999999999999999e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0420  methyltransferase type 12  56.73 
 
 		 230 aa  237  1e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.662097  hitchhiker  0.00821739 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2134  methyltransferase type 11  51.92 
 
 		 212 aa  233  2.0000000000000002e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.453927 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001914  putative methyltransferase associated with DUF414  48.33 
 
 		 212 aa  222  3e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00577  hypothetical protein  48.56 
 
 		 212 aa  221  4.9999999999999996e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0643  methyltransferase type 12  51.44 
 
 		 257 aa  214  5.9999999999999996e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0965  methyltransferase type 11  50.48 
 
 		 217 aa  212  3.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00498957  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1082  methyltransferase type 12  50.72 
 
 		 215 aa  211  9e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.578159  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2158  methyltransferase type 12  48.57 
 
 		 223 aa  210  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00013  methyltransferase-related protein  46.01 
 
 		 233 aa  204  6e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0230  hypothetical protein  43.27 
 
 		 214 aa  201  9e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.818653  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0514  methyltransferase domain-containing protein  46.86 
 
 		 225 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1601  thymidylate kinase  44.65 
 
 		 215 aa  199  3.9999999999999996e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0530437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0301  methyltransferase type 11  46.19 
 
 		 214 aa  193  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3951  methyltransferase type 11  43.27 
 
 		 211 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1150  methyltransferase type 12  44.5 
 
 		 222 aa  188  7e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0329  methyltransferase type 11  45.67 
 
 		 212 aa  186  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0201  methyltransferase type 11  43.6 
 
 		 217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0201  Methyltransferase type 11  42.18 
 
 		 216 aa  181  6e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.63845 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4267  methyltransferase type 11  42.65 
 
 		 223 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4134  methyltransferase type 12  42.51 
 
 		 213 aa  177  8e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3944  methyltransferase type 11  44.93 
 
 		 212 aa  176  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0899  Methyltransferase type 11  43.87 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0259  methyltransferase type 12  45.67 
 
 		 211 aa  175  4e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.562572 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4550  methyltransferase domain-containing protein  44.17 
 
 		 212 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3583  methyltransferase type 12  41.83 
 
 		 211 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0258  methyltransferase type 12  43 
 
 		 211 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3819  methyltransferase type 11  44.71 
 
 		 212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3746  methyltransferase type 12  44.23 
 
 		 212 aa  171  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3445  methyltransferase domain-containing protein  49.71 
 
 		 213 aa  168  7e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3946  hypothetical protein  36.41 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06720  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  34.52 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3717  hypothetical protein  37.62 
 
 		 222 aa  148  6e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00803491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0099  hypothetical protein  35.85 
 
 		 222 aa  141  8e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3908  hypothetical protein  35.07 
 
 		 212 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00391987  normal  0.262705 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0056  hypothetical protein  33.01 
 
 		 220 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.425414  normal  0.0220256 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4293  hypothetical protein  34.3 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00170008  unclonable  0.00000000000496851 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4727  hypothetical protein  36.02 
 
 		 212 aa  136  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4000  hypothetical protein  35.07 
 
 		 212 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4113  hypothetical protein  35.38 
 
 		 212 aa  135  5e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4348  hypothetical protein  35.07 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000231362  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4490  hypothetical protein  35.07 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393698 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0050  hypothetical protein  34.6 
 
 		 212 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00137393  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0093  hypothetical protein  32.21 
 
 		 232 aa  129  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0397586  decreased coverage  0.00000860939 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0109  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4- ben zoquinolmethylase  31.13 
 
 		 214 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3910  hypothetical protein  34.6 
 
 		 212 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0090  hypothetical protein  32.21 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.185327 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3623  hypothetical protein  31.13 
 
 		 223 aa  121  7e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0347369  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0892  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  27.49 
 
 		 214 aa  102  5e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3431  methyltransferase type 11  28.66 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1324  methyltransferase type 11  30.04 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.386033  hitchhiker  0.000000000822833 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  24.49 
 
 		 273 aa  51.2  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0957  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.64 
 
 		 235 aa  50.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1190  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.52 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3270  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.15 
 
 		 241 aa  49.7  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0514123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2150  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.28 
 
 		 236 aa  48.5  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0398  histidine triad (HIT) protein  31 
 
 		 284 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1507  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.78 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0208491 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2186  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.47 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0852291  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  26.19 
 
 		 330 aa  47.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  23.95 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  28.35 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2620  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.25 
 
 		 242 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0890164  normal  0.121795 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2861  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  26.47 
 
 		 240 aa  46.6  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0308666  decreased coverage  0.000000000135895 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2412  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.25 
 
 		 242 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114708  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1957  methyltransferase type 11  26.26 
 
 		 263 aa  46.6  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2461  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.25 
 
 		 242 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  normal  0.0528077 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2516  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.25 
 
 		 242 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158942  normal  0.172126 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2503  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.25 
 
 		 242 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1243  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.9 
 
 		 329 aa  45.8  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1948  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.12 
 
 		 262 aa  46.2  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.767246  normal  0.0132888 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  28.23 
 
 		 333 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.47 
 
 		 232 aa  45.8  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  25.21 
 
 		 306 aa  45.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  22.51 
 
 		 286 aa  45.8  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  23.32 
 
 		 291 aa  45.8  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  21.27 
 
 		 267 aa  45.4  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2066  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.27 
 
 		 236 aa  45.1  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.10278  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1730  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.92 
 
 		 237 aa  45.1  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224217 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  22.73 
 
 		 332 aa  44.3  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.39 
 
 		 345 aa  44.3  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1298  Methyltransferase type 11  28.28 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0939  Methyltransferase type 12  25.69 
 
 		 232 aa  45.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02158  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.88 
 
 		 240 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1427  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.88 
 
 		 240 aa  43.5  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000505917  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7539  hypothetical protein  31.97 
 
 		 258 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3366  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.88 
 
 		 240 aa  43.5  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6087  Methyltransferase type 12  24.73 
 
 		 263 aa  43.5  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02117  hypothetical protein  32.88 
 
 		 240 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.51 
 
 		 242 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.167435  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.88 
 
 		 240 aa  43.5  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2527  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.88 
 
 		 240 aa  43.5  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  23.38 
 
 		 346 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1311  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.51 
 
 		 242 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.310574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2847  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.51 
 
 		 242 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.170371  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1419  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.88 
 
 		 240 aa  43.5  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000287901 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5454  methyltransferase type 11  26.54 
 
 		 317 aa  43.5  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.80361 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2607  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.88 
 
 		 240 aa  43.5  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1630  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.27 
 
 		 232 aa  43.1  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>