More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1793 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  100 
 
 		 539 aa  1083    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  82.09 
 
 		 537 aa  885    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  74.86 
 
 		 538 aa  808    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  40 
 
 		 556 aa  340  2.9999999999999998e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  30.02 
 
 		 539 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  36.13 
 
 		 546 aa  280  3e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  36.01 
 
 		 549 aa  276  7e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  34.6 
 
 		 545 aa  270  7e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  34.31 
 
 		 584 aa  258  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  32.72 
 
 		 564 aa  254  4.0000000000000004e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  32.89 
 
 		 543 aa  251  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  34.53 
 
 		 541 aa  248  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  32.7 
 
 		 543 aa  246  4.9999999999999997e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  35.94 
 
 		 548 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  31.38 
 
 		 583 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  29.14 
 
 		 557 aa  234  4.0000000000000004e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  33.52 
 
 		 532 aa  233  8.000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  34.99 
 
 		 553 aa  232  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  30.44 
 
 		 520 aa  222  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  29.72 
 
 		 522 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  34 
 
 		 543 aa  219  7.999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  32.74 
 
 		 548 aa  218  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  33.27 
 
 		 556 aa  216  8e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  29.66 
 
 		 520 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34970  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  33.75 
 
 		 541 aa  215  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134464  normal  0.645084 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  29.18 
 
 		 522 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  33.7 
 
 		 537 aa  214  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2329  Amidohydrolase 3  33.21 
 
 		 530 aa  213  4.9999999999999996e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  29.8 
 
 		 522 aa  213  7e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  33.27 
 
 		 530 aa  213  7e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  31.83 
 
 		 601 aa  213  7.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  29.18 
 
 		 522 aa  212  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  29.8 
 
 		 522 aa  212  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  30.31 
 
 		 556 aa  212  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  29.5 
 
 		 522 aa  211  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  29.5 
 
 		 522 aa  211  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  29.42 
 
 		 522 aa  210  5e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  29.5 
 
 		 522 aa  210  5e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  30.49 
 
 		 539 aa  210  6e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1124  amidohydrolase 3  32.25 
 
 		 625 aa  209  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  32.54 
 
 		 549 aa  208  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30.22 
 
 		 575 aa  205  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30.04 
 
 		 575 aa  203  7e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  29.27 
 
 		 522 aa  201  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  32.62 
 
 		 539 aa  201  3e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  30.11 
 
 		 581 aa  197  6e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10562  hypothetical protein  31.45 
 
 		 537 aa  196  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.036236 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3865  Amidohydrolase 3  33.69 
 
 		 535 aa  193  9e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  33.15 
 
 		 540 aa  190  5e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  30.02 
 
 		 560 aa  190  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4036  amidohydrolase 3  28.36 
 
 		 601 aa  190  5e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  31.65 
 
 		 579 aa  190  5.999999999999999e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0100  hypothetical protein  27.95 
 
 		 604 aa  189  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  31.02 
 
 		 564 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  27.73 
 
 		 533 aa  188  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  30.43 
 
 		 603 aa  188  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22680  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  31.46 
 
 		 543 aa  188  2e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  27.06 
 
 		 574 aa  188  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0742  amidohydrolase 3  31.16 
 
 		 536 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838024  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  31.16 
 
 		 536 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  33.89 
 
 		 522 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0756  amidohydrolase 3  31.16 
 
 		 536 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398429  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  33.27 
 
 		 525 aa  186  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  30.61 
 
 		 562 aa  184  5.0000000000000004e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  29.09 
 
 		 543 aa  182  9.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  30.28 
 
 		 583 aa  182  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2185  Amidohydrolase 3  27.19 
 
 		 563 aa  182  1e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  32.4 
 
 		 536 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  31.72 
 
 		 565 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1885  Amidohydrolase 3  29.09 
 
 		 587 aa  180  5.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.5166  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  29.39 
 
 		 606 aa  178  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  31 
 
 		 564 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  28.15 
 
 		 527 aa  178  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  28.99 
 
 		 563 aa  177  4e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  28.31 
 
 		 546 aa  177  5e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  26.09 
 
 		 582 aa  176  8e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0760  amidohydrolase 3  27.59 
 
 		 592 aa  176  8e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  31.73 
 
 		 527 aa  176  9e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3250  amidohydrolase 3  30.6 
 
 		 542 aa  176  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383305  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2120  Amidohydrolase 3  33.02 
 
 		 536 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885752  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3404  Amidohydrolase 3  32.58 
 
 		 586 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000897209  hitchhiker  0.00001315 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  28.18 
 
 		 569 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6052  amidohydrolase 3  31.22 
 
 		 555 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.863749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3346  amidohydrolase family  28.4 
 
 		 568 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  30.59 
 
 		 583 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  30.65 
 
 		 543 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  30.59 
 
 		 583 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  28.78 
 
 		 560 aa  172  9e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0108  Amidohydrolase 3  31.99 
 
 		 547 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134206  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0160  Amidohydrolase 3  31.31 
 
 		 512 aa  172  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2408  Amidohydrolase 3  29.38 
 
 		 520 aa  172  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  29.66 
 
 		 544 aa  171  2e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  34.27 
 
 		 565 aa  171  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  30.2 
 
 		 620 aa  170  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  32.07 
 
 		 547 aa  169  8e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3987  amidohydrolase 3  28.21 
 
 		 563 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  29.44 
 
 		 548 aa  168  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4766  amidohydrolase 3  32.55 
 
 		 545 aa  168  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  27.96 
 
 		 544 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0134  amidohydrolase-like  31.93 
 
 		 547 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.900918  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>