More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0501 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0501  GAF sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 571 aa  1121    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3523  Histidine kinase  57.78 
 
 		 591 aa  585  1e-166  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0630905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3046  GAF:ATP-binding region, ATPase-like  56.37 
 
 		 572 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1654  GAF sensor signal transduction histidine kinase  57.9 
 
 		 567 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4838  Signal transduction histidine kinase-like protein  55.99 
 
 		 566 aa  560  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1969  GAF sensor signal transduction histidine kinase  47.25 
 
 		 568 aa  462  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.197678  normal  0.851655 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1907  GAF sensor signal transduction histidine kinase  48.2 
 
 		 566 aa  446  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1578  ATPase domain-containing protein  47.58 
 
 		 573 aa  441  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1529  GAF sensor signal transduction histidine kinase  47.84 
 
 		 573 aa  435  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.916601  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1560  putative signal transduction histidine kinase  47.42 
 
 		 588 aa  403  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.298915  normal  0.578819 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0994  GAF domain-containing protein  44.98 
 
 		 577 aa  403  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3251  putative signal transduction histidine kinase  44.04 
 
 		 592 aa  393  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2005  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.46 
 
 		 595 aa  395  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0401989  hitchhiker  0.00207123 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.52 
 
 		 578 aa  388  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2135  putative signal transduction histidine kinase  43.21 
 
 		 565 aa  381  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0347228  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.32 
 
 		 580 aa  378  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0191  GAF sensor signal transduction histidine kinase  46.52 
 
 		 544 aa  375  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.303575  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13153  two component system sensor histidine kinase devS  41.25 
 
 		 578 aa  352  8.999999999999999e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0946  GAF domain-containing protein  43.73 
 
 		 536 aa  350  4e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0197994  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1077  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.86 
 
 		 566 aa  349  9e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1093  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.86 
 
 		 566 aa  349  9e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1104  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.86 
 
 		 566 aa  349  9e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1395  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 559 aa  347  3e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735957  normal  0.354354 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4125  putative signal transduction histidine kinase  41.04 
 
 		 568 aa  344  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4200  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.04 
 
 		 568 aa  344  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112122  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4356  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.87 
 
 		 568 aa  340  4e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.641048  normal  0.232825 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1486  putative signal transduction histidine kinase  43.29 
 
 		 579 aa  339  9.999999999999999e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0200919  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3460  putative signal transduction histidine kinase  40.97 
 
 		 556 aa  337  2.9999999999999997e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3844  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.92 
 
 		 575 aa  336  5.999999999999999e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00743108  normal  0.0464921 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4737  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.2 
 
 		 535 aa  334  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12064  histidine kinase response regulator  40.77 
 
 		 573 aa  318  1e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 		 631 aa  318  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2137  GAF domain protein  39.85 
 
 		 549 aa  315  1.9999999999999998e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.565017  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4819  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.96 
 
 		 543 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.563449  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1413  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 		 568 aa  293  7e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22860  histidine kinase with GAF domain protein  37.28 
 
 		 543 aa  293  8e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.854581  normal  0.459297 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6099  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.07 
 
 		 525 aa  288  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1700  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 		 535 aa  275  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180519 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3326  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 		 571 aa  272  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.742829 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 		 590 aa  270  5.9999999999999995e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0109809  hitchhiker  0.000893685 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1613  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 		 550 aa  212  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23240  histidine kinase with GAF domain protein  32.92 
 
 		 635 aa  195  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.677284 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11340  histidine kinase with GAF domain  35.22 
 
 		 391 aa  187  4e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610406 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1658  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 409 aa  186  9e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0274237 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0516  putative signal transduction histidine kinase  54.64 
 
 		 392 aa  181  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.587002  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0157  putative phytochrome sensor protein  36.79 
 
 		 401 aa  168  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01090  histidine kinase with GAF domain protein  34.86 
 
 		 385 aa  167  5e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  51.48 
 
 		 456 aa  164  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 372 aa  151  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.642474  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4147  GAF sensor signal transduction histidine kinase  45.2 
 
 		 381 aa  147  5e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  43.6 
 
 		 373 aa  137  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  46.02 
 
 		 386 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.86 
 
 		 421 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  35.76 
 
 		 828 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  34.58 
 
 		 851 aa  125  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.61 
 
 		 725 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.95 
 
 		 665 aa  125  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5201  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.11 
 
 		 393 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849708 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2289  sensor histidine kinase  28.02 
 
 		 372 aa  108  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.25894e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2045  sensor histidine kinase  28.02 
 
 		 372 aa  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2047  sensor histidine kinase  28.02 
 
 		 372 aa  107  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.362734  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2086  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 		 372 aa  107  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443237  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2108  sensor histidine kinase  28.02 
 
 		 372 aa  107  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2264  sensor histidine kinase  28.02 
 
 		 365 aa  107  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.361221  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18330  histidine kinase  37.26 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2292  sensor histidine kinase  28.02 
 
 		 365 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1421  ATPase domain-containing protein  38.03 
 
 		 484 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.595659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0508  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 673 aa  103  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663118  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02360  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with NarP (NarL)  32.03 
 
 		 566 aa  103  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.161159  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3690  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  32.03 
 
 		 566 aa  103  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02322  hypothetical protein  32.03 
 
 		 566 aa  103  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.147876  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1208  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  32.03 
 
 		 566 aa  103  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2598  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  32.03 
 
 		 566 aa  103  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3746  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.79 
 
 		 373 aa  103  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.200726  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2374  sensor histidine kinase  27.24 
 
 		 372 aa  103  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0968027  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2748  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  32.03 
 
 		 566 aa  102  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.560652  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1201  histidine kinase  32.03 
 
 		 566 aa  102  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2838  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  32.03 
 
 		 566 aa  101  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2615  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  31.67 
 
 		 566 aa  101  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.538567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2244  sensor histidine kinase  28.02 
 
 		 372 aa  101  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3023  response regulator  31.46 
 
 		 597 aa  100  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000011368  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1385  sensor histidine kinase  26.67 
 
 		 377 aa  100  8e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00939681  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4655  putative PAS/PAC sensor protein  34.93 
 
 		 535 aa  100  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2522  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.43 
 
 		 380 aa  99.8  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1389  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.5 
 
 		 598 aa  99.4  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0922186  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3079  sensor histidine kinase  27.24 
 
 		 372 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000507367 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 		 352 aa  99.8  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2123  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.66 
 
 		 593 aa  99.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1849  nitrate/nitrite sensor protein NarX  31.08 
 
 		 603 aa  99.4  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2232  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.66 
 
 		 593 aa  99.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4209  putative PAS/PAC sensor protein  31.43 
 
 		 795 aa  100  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01200  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with NarL  30.12 
 
 		 598 aa  97.8  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.690529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2424  histidine kinase  30.12 
 
 		 598 aa  97.8  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0527369  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01210  hypothetical protein  30.12 
 
 		 598 aa  97.8  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.678292  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1372  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.12 
 
 		 598 aa  97.8  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.497152  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1705  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.12 
 
 		 598 aa  97.8  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.55706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2401  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.12 
 
 		 598 aa  97.8  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1331  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.12 
 
 		 598 aa  97.4  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.150699  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1918  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.12 
 
 		 598 aa  97.4  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0184147  normal  0.168413 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5541  sensor histidine kinase, putative  23.61 
 
 		 523 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>