81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0041 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0041  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 		 214 aa  449  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2243  2OG-Fe(II) oxygenase  62.83 
 
 		 226 aa  306  1.0000000000000001e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2643  2OG-Fe(II) oxygenase  51.18 
 
 		 220 aa  232  4.0000000000000004e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3563  SM-20 domain-containing protein  48.56 
 
 		 207 aa  207  7e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1587  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  47.12 
 
 		 207 aa  202  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938971  normal  0.613545 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1593  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  46.63 
 
 		 207 aa  202  4e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.209415 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1526  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  47.12 
 
 		 207 aa  202  4e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1613  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  47.6 
 
 		 207 aa  201  5e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2476  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  46.63 
 
 		 207 aa  198  6e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.343248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0963  2OG-Fe(II) oxygenase  45.19 
 
 		 224 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0704463  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1849  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  47.5 
 
 		 199 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1802  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  47.5 
 
 		 199 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.344329  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2041  2OG-Fe(II) oxygenase  46.19 
 
 		 207 aa  194  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.239725  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1810  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  47.5 
 
 		 199 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1631  2OG-Fe(II) oxygenase  46.5 
 
 		 199 aa  191  5e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1461  SM-20 domain-containing protein  44.71 
 
 		 207 aa  191  8e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.348442  normal  0.841755 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2536  2OG-Fe(II) oxygenase  47.52 
 
 		 230 aa  191  9e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375682  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4923  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  44.86 
 
 		 227 aa  184  7e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1422  2OG-Fe(II) oxygenase  48.72 
 
 		 230 aa  182  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000140265 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3690  2OG-Fe(II) oxygenase  39.52 
 
 		 217 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01768  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family protein  42.31 
 
 		 223 aa  179  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0242801  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1614  2OG-Fe(II) oxygenase  46.5 
 
 		 209 aa  179  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0452187  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2920  oxidoreductase  42.52 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0289  SM-20-related protein  45.63 
 
 		 205 aa  176  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.348615  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3085  2OG-Fe(II) oxygenase  43.43 
 
 		 210 aa  172  3.9999999999999995e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.850505  normal  0.241657 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3757  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  43.19 
 
 		 225 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003576  SM-20-related protein  43.56 
 
 		 197 aa  169  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02535  hypothetical protein  43.75 
 
 		 200 aa  168  5e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0453  2OG-Fe(II) oxygenase  44.33 
 
 		 217 aa  167  8e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1617  2OG-Fe(II) oxygenase  41.87 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1909  2OG-Fe(II) oxygenase  39.9 
 
 		 220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000270235 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5391  2OG-Fe(II) oxygenase  42.08 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020838 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5066  2OG-Fe(II) oxygenase  42.57 
 
 		 211 aa  154  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5159  2OG-Fe(II) oxygenase  42.57 
 
 		 207 aa  154  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.767361 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2032  2OG-Fe(II) oxygenase  42.05 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1890  2OG-Fe(II) oxygenase  48.08 
 
 		 211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227859  normal  0.306008 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5212  2OG-Fe(II) oxygenase  41.58 
 
 		 211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0306  2OG-Fe(II) oxygenase  42.57 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0982951 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4235  2OG-Fe(II) oxygenase  43.14 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5296  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  39.81 
 
 		 244 aa  148  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04050  putative proline hydroxylase  38.54 
 
 		 232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0255  2OG-Fe(II) oxygenase  40.31 
 
 		 251 aa  144  8.000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.791217 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0403  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  38.61 
 
 		 209 aa  142  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4854  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  40.78 
 
 		 233 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48380  2OG-Fe(II) oxygenase family  39.6 
 
 		 210 aa  134  9e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.583305  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4910  2OG-Fe(II) oxygenase  34.65 
 
 		 203 aa  134  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0434  hypothetical protein  43.21 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0458  hypothetical protein  42.59 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0970  proline hydroxylase  37.01 
 
 		 196 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00650089  normal  0.084866 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02845  Oxidoreductase  36.21 
 
 		 212 aa  108  5e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0643  2OG-Fe(II) oxygenase  34.02 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0712073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0562  oxygenase  31.53 
 
 		 252 aa  85.5  6e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0550  2OG-Fe(II) oxygenase  29.53 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.337301  normal  0.291375 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46896  predicted protein  32.14 
 
 		 321 aa  75.1  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38427  predicted protein  35.77 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2117  proline hydroxylase-like protein  42.31 
 
 		 126 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89355  predicted protein  34.12 
 
 		 338 aa  55.1  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2554  2OG-Fe(II) oxygenase  32.19 
 
 		 247 aa  53.1  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2547  proline hydroxylase-like protein  28.21 
 
 		 277 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.259291 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26414  predicted protein  29.87 
 
 		 262 aa  48.1  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0496773  normal  0.028016 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48235  predicted protein  30.56 
 
 		 326 aa  48.1  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.652945  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3876  hypothetical protein  30.69 
 
 		 309 aa  47.8  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.31832  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92186  predicted protein  32.56 
 
 		 324 aa  47.4  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1428  hypothetical protein  34.29 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1409  hypothetical protein  34.29 
 
 		 221 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0134814  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3733.1  proline hydroxylase  25.27 
 
 		 239 aa  45.8  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0233  hypothetical protein  34.29 
 
 		 221 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.250352  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1262  hypothetical protein  34.29 
 
 		 204 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.630395  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1328  hypothetical protein  34.29 
 
 		 228 aa  45.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.366652  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1813  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  32.32 
 
 		 254 aa  45.4  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.303504 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3466  2OG-Fe(II) oxygenase  27.03 
 
 		 306 aa  45.4  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.413684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2573  hypothetical protein  34.29 
 
 		 204 aa  45.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0640  hypothetical protein  28.4 
 
 		 271 aa  45.1  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0505  hypothetical protein  39.53 
 
 		 221 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1064  hypothetical protein  39.53 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.592441  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1084  hypothetical protein  37.25 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.508699 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0923  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  25.13 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0949  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  25.13 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0957  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  25.13 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5095  hypothetical protein  36.36 
 
 		 194 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1902  hypothetical protein  28.57 
 
 		 279 aa  42  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>