12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1084 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1084  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.508699 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5095  hypothetical protein  51.55 
 
 		 194 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1428  hypothetical protein  30.65 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2573  hypothetical protein  31.02 
 
 		 204 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1409  hypothetical protein  31.02 
 
 		 221 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0134814  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1328  hypothetical protein  31.02 
 
 		 228 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.366652  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1262  hypothetical protein  30.48 
 
 		 204 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.630395  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0233  hypothetical protein  30.48 
 
 		 221 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.250352  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0505  hypothetical protein  30.48 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1064  hypothetical protein  30.48 
 
 		 228 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.592441  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02815  Prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  38.46 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0159322  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0041  2OG-Fe(II) oxygenase  37.25 
 
 		 214 aa  44.7  0.0009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>