13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02815 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02815  Prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  100 
 
 
175 aa  369  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0159322  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1428  hypothetical protein  28.42 
 
 
201 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1262  hypothetical protein  33.87 
 
 
204 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.630395  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0233  hypothetical protein  40.86 
 
 
221 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.250352  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1409  hypothetical protein  40.86 
 
 
221 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0134814  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2573  hypothetical protein  40.86 
 
 
204 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0505  hypothetical protein  40.86 
 
 
221 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1328  hypothetical protein  40.86 
 
 
228 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.366652  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1064  hypothetical protein  40.86 
 
 
228 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.592441  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1084  hypothetical protein  38.46 
 
 
197 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.508699 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5095  hypothetical protein  38.46 
 
 
194 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38958  predicted protein  27.38 
 
 
502 aa  45.1  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.235143  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87206  predicted protein  28.57 
 
 
544 aa  45.1  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0411926  normal  0.0642401 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>