260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1792 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1792  major facilitator superfamily protein  100 
 
 
403 aa  759    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5400  major facilitator superfamily permease  63.93 
 
 
395 aa  352  8e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0542867  normal  0.864795 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  45.23 
 
 
417 aa  291  1e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  50.55 
 
 
388 aa  280  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 
387 aa  227  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  43.68 
 
 
381 aa  223  4e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  40.81 
 
 
384 aa  223  7e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  37.27 
 
 
385 aa  220  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  41.1 
 
 
419 aa  220  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0367  putative transporter  43.43 
 
 
462 aa  211  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  39.02 
 
 
400 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  37.97 
 
 
398 aa  203  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  34.7 
 
 
386 aa  202  9e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  32.38 
 
 
405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  38.92 
 
 
378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  38.36 
 
 
407 aa  201  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  38.87 
 
 
383 aa  196  6e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  43.14 
 
 
393 aa  192  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  38.58 
 
 
369 aa  192  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  35.09 
 
 
402 aa  192  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  38.58 
 
 
403 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  33.06 
 
 
388 aa  186  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3084  major facilitator superfamily MFS_1  36.91 
 
 
415 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11728  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  36.88 
 
 
384 aa  184  3e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  38.3 
 
 
403 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  40.44 
 
 
441 aa  183  6e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1953  major facilitator superfamily MFS_1  37.47 
 
 
411 aa  183  6e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  43.75 
 
 
391 aa  181  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  28.77 
 
 
386 aa  181  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  38.07 
 
 
398 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3238  major facilitator transporter  40.74 
 
 
373 aa  178  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0408  major facilitator transporter  37.63 
 
 
443 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  37.4 
 
 
405 aa  173  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  32.72 
 
 
387 aa  172  9e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  37.34 
 
 
396 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  40 
 
 
400 aa  169  9e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  34.97 
 
 
396 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04660  Major Facilitator Superfamily transporter  36.51 
 
 
393 aa  168  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  39.22 
 
 
387 aa  168  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
389 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  34.38 
 
 
377 aa  167  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0193  major facilitator transporter  37.34 
 
 
404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  34.15 
 
 
389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  36.59 
 
 
385 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0206  major facilitator transporter  37.34 
 
 
404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  38.22 
 
 
379 aa  165  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0585  putative transport transmembrane protein  38.14 
 
 
408 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  34.72 
 
 
397 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0187  major facilitator transporter  38.12 
 
 
439 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000715717 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 
390 aa  164  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  35.97 
 
 
391 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  35.18 
 
 
386 aa  163  5.0000000000000005e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3074  major facilitator superfamily protein  33.98 
 
 
413 aa  163  6e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  33.79 
 
 
397 aa  162  9e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  37.04 
 
 
403 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  37.06 
 
 
391 aa  161  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  34.83 
 
 
386 aa  160  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  35.53 
 
 
383 aa  160  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  36.13 
 
 
403 aa  160  5e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3382  major facilitator transporter  38.44 
 
 
409 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  34.74 
 
 
383 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  34.37 
 
 
397 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  35.21 
 
 
396 aa  156  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3157  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  36.27 
 
 
451 aa  155  9e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  35.85 
 
 
373 aa  155  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  34.12 
 
 
392 aa  155  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3213  major facilitator superfamily MFS_1  41.75 
 
 
390 aa  154  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00200336  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2626  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  39.12 
 
 
392 aa  153  5e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.686935  hitchhiker  0.0081174 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  36.49 
 
 
383 aa  152  8e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0279  major facilitator transporter  37.05 
 
 
405 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.928738  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 
387 aa  151  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36380  sugar phosphate permease  33.83 
 
 
447 aa  151  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  37.22 
 
 
383 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0261  major facilitator transporter  36.79 
 
 
405 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.989591 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3571  major facilitator superfamily MFS_1  38.27 
 
 
408 aa  150  6e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000688855  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4953  major facilitator superfamily MFS_1  32.21 
 
 
465 aa  149  8e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1471  major facilitator superfamily transporter  35.19 
 
 
392 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490092  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1030  major facilitator transporter  32.24 
 
 
411 aa  146  5e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4261  major facilitator superfamily MFS_1  31.59 
 
 
427 aa  146  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.426527  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2841  major facilitator transporter  34.95 
 
 
384 aa  146  7.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.968636  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1443  major facilitator transporter  34.95 
 
 
384 aa  146  7.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00314587  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2762  major facilitator transporter  34.95 
 
 
384 aa  146  7.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00913666  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2902  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  36.12 
 
 
402 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3406  putative amino acid ABC transporter, permease protein  36.12 
 
 
402 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.126603  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1638  putative amino acid ABC transporter, permease protein  36.12 
 
 
402 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.501244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2963  putative amino acid ABC transporter, permease protein  36.12 
 
 
402 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.798243  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3782  major facilitator transporter  35.19 
 
 
383 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3830  putative amino acid ABC transporter, permease protein  35.85 
 
 
402 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.852722  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3911  putative amino acid ABC transporter, permease protein  35.85 
 
 
402 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0050  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  35.85 
 
 
372 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31500  fucose permease  34.7 
 
 
404 aa  143  4e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3060  major facilitator superfamily MFS_1  34.58 
 
 
402 aa  144  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.154269  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  31.4 
 
 
404 aa  143  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  37.01 
 
 
384 aa  143  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1070  putative transporter  33.87 
 
 
378 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.44302  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0062  putative transporter  33.87 
 
 
378 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0357  putative transporter  33.87 
 
 
378 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39371  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1647  major facilitator family transporter  33.87 
 
 
378 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1229  putative transporter  33.87 
 
 
378 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  36.22 
 
 
377 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>