More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0946 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0946  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  100 
 
 		 388 aa  791    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000933718  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0924  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  99.23 
 
 		 388 aa  787    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000324435  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1333  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  55.16 
 
 		 386 aa  428  1e-119  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000335599  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0531  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  55.16 
 
 		 390 aa  423  1e-117  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.077204  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0684  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  53.55 
 
 		 393 aa  416  9.999999999999999e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3806  ornithine decarboxylase  47.61 
 
 		 377 aa  313  1.9999999999999998e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.16357  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3419  ornithine decarboxylase  45.45 
 
 		 380 aa  302  6.000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.268803  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3390  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  45.45 
 
 		 377 aa  301  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151925 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1080  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  46.56 
 
 		 376 aa  301  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.143277 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4547  ornithine decarboxylase  45.38 
 
 		 380 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.727864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3689  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  45.18 
 
 		 377 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192406  normal  0.735507 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1157  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  45.3 
 
 		 376 aa  297  2e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0214354 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0924  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  44.63 
 
 		 380 aa  297  3e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.215223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0938  Ornithine decarboxylase  44.81 
 
 		 380 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2772  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  46.56 
 
 		 377 aa  293  4e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2715  ornithine decarboxylase  46.35 
 
 		 377 aa  292  7e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4655  ornithine decarboxylase  43.31 
 
 		 388 aa  291  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.203932 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0856  ornithine decarboxylase  44.08 
 
 		 380 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.310254 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4245  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  46.22 
 
 		 377 aa  290  4e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1349  ornithine decarboxylase  44.89 
 
 		 380 aa  289  7e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758302  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2006  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  43.16 
 
 		 388 aa  289  7e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.447532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1090  pyridoxal-dependent decarboxylase  43.98 
 
 		 377 aa  287  2e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.41465  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2140  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  43.8 
 
 		 376 aa  287  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4837  ornithine decarboxylase  43.25 
 
 		 380 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0100  ornithine/DAP/arginine decarboxylase family decarboxylase 2  45.94 
 
 		 377 aa  285  1.0000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.938006  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0092  ornithine/DAP/arginine decarboxylase family decarboxylase 2  45.94 
 
 		 377 aa  285  1.0000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2320  Ornithine decarboxylase  43.16 
 
 		 388 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.724632  normal  0.55371 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2045  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  43.16 
 
 		 388 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.151029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3234  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  43.01 
 
 		 433 aa  283  3.0000000000000004e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.17502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0576  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  42.82 
 
 		 392 aa  282  8.000000000000001e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0446  ornithine decarboxylase  44.12 
 
 		 390 aa  279  8e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0877313 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1649  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  43.16 
 
 		 388 aa  278  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.648031  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3110  ornithine decarboxylase  40.88 
 
 		 390 aa  276  6e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1510  Ornithine decarboxylase  40.27 
 
 		 400 aa  274  2.0000000000000002e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000015857  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2175  ornithine decarboxylase  41.03 
 
 		 388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.174065 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1964  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  38.59 
 
 		 391 aa  273  3e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12320  Ornithine decarboxylase  41.46 
 
 		 387 aa  272  7e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4247  ornithine decarboxylase  40.71 
 
 		 387 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0801  ornithine decarboxylase  39.06 
 
 		 387 aa  270  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748721 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5043  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  42.01 
 
 		 403 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1693  ornithine decarboxylase  44.11 
 
 		 421 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4314  ornithine decarboxylase  40.16 
 
 		 387 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0146694 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1109  pyridoxal-dependent family decarboxylase  39.35 
 
 		 389 aa  268  8.999999999999999e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0864  ornithine decarboxylase  40.16 
 
 		 371 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0894  ornithine decarboxylase  39.06 
 
 		 387 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.199626 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0801  ornithine decarboxylase  40.16 
 
 		 387 aa  267  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.430321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0908  ornithine decarboxylase  40.16 
 
 		 387 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226551 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0801  ornithine decarboxylase  40.17 
 
 		 389 aa  267  2e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4572  pyridoxal-dependent decarboxylase, pyridoxal binding domain protein  40.33 
 
 		 359 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2177  ornithine decarboxylase  40.66 
 
 		 390 aa  265  1e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.024937  normal  0.209204 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1375  ornithine decarboxylase  41.26 
 
 		 398 aa  264  2e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.291612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0037  ornithine decarboxylase  38.77 
 
 		 391 aa  263  4e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4136  decarboxylase, pyridoxal-dependent  39.89 
 
 		 391 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0077  ornithine decarboxylase  39.02 
 
 		 391 aa  262  8e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0410  ornithine decarboxylase  40 
 
 		 391 aa  261  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0029  ornithine decarboxylase  38.87 
 
 		 391 aa  261  2e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2057  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  41.21 
 
 		 376 aa  260  3e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0541  diaminopimelate decarboxylase  39.18 
 
 		 391 aa  260  3e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0699456  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3682  ornithine decarboxylase  39.62 
 
 		 391 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00110632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3507  ornithine decarboxylase  39.62 
 
 		 391 aa  259  7e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00021864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0465  diaminopimelate decarboxylase  39.18 
 
 		 391 aa  258  9e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000104832  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0486  diaminopimelate decarboxylase  39.18 
 
 		 391 aa  258  9e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000602971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3854  diaminopimelate decarboxylase  39.18 
 
 		 391 aa  258  9e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000739123  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0489  Diaminopimelate decarboxylase  39.18 
 
 		 391 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000118387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5135  ornithine decarboxylase  39.89 
 
 		 387 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0445  ornithine decarboxylase  39.34 
 
 		 391 aa  258  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00713541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58630  ornithine decarboxylase  39.62 
 
 		 387 aa  256  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3075  diaminopimelate decarboxylase  39.45 
 
 		 391 aa  256  4e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000605202  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2180  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  42.7 
 
 		 376 aa  251  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0693915  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3392  ornithine decarboxylase  37.76 
 
 		 391 aa  251  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000026968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3405  diaminopimelate decarboxylase  39.18 
 
 		 391 aa  251  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1416  ornithine decarboxylase  38.54 
 
 		 392 aa  248  1e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24620  ornithine decarboxylase  38.07 
 
 		 389 aa  247  3e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5654  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  38.54 
 
 		 397 aa  243  6e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0274  ornithine decarboxylase  33.51 
 
 		 398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000805907  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03846  ornithine decarboxylase (Eurofung)  32.96 
 
 		 434 aa  192  8e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000212473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0879  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.35 
 
 		 379 aa  190  4e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2447  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.6 
 
 		 404 aa  187  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1046  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.06 
 
 		 397 aa  187  3e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.627883  normal  0.114267 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3803  Ornithine decarboxylase  30.36 
 
 		 392 aa  177  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.390604  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0693  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.99 
 
 		 379 aa  176  5e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12642  ornithine decarboxylase 2  30.75 
 
 		 390 aa  163  5.0000000000000005e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90612  ornithine decarboxylase  29.66 
 
 		 458 aa  160  4e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.253647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31322  Ornithine decarboxylase  29.5 
 
 		 547 aa  159  6e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0025491  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2027  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.33 
 
 		 406 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2321  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.69 
 
 		 387 aa  156  7e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.671563  normal  0.250047 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0258  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  34.9 
 
 		 420 aa  155  9e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2895  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  35.38 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000922142 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04890  ornithine decarboxylase, putative  28.33 
 
 		 527 aa  150  3e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.447794  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4145  diaminopimelate decarboxylase  28.73 
 
 		 417 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4055  diaminopimelate decarboxylase  28.46 
 
 		 417 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4193  diaminopimelate decarboxylase  29.04 
 
 		 427 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4070  diaminopimelate decarboxylase  29 
 
 		 427 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4218  diaminopimelate decarboxylase  28.77 
 
 		 427 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15741  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0377  ornithine decarboxylase  32.49 
 
 		 417 aa  143  4e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.412388  normal  0.928081 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3089  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.56 
 
 		 381 aa  143  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.334962 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0353  diaminopimelate decarboxylase  29.6 
 
 		 422 aa  142  9e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1199  diaminopimelate decarboxylase  29.84 
 
 		 418 aa  139  6e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0292186  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0214  diaminopimelate decarboxylase  27.07 
 
 		 401 aa  138  2e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4030  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  28.95 
 
 		 413 aa  138  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.157056  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>