160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0427 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0427  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 172 aa  349  1e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000575669  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0412  iron dependent repressor  99.42 
 
 		 172 aa  346  8e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351504  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0156  iron dependent repressor  44.44 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.179835  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0146  iron dependent repressor  40.37 
 
 		 172 aa  130  9e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1549  iron dependent repressor  34.59 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.168929  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.69 
 
 		 231 aa  77.8  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1664  DtxR family iron dependent repressor  35.25 
 
 		 163 aa  77.8  0.00000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1457  hypothetical protein  34.04 
 
 		 160 aa  77.4  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.504372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0776  iron dependent repressor  33.33 
 
 		 163 aa  77.4  0.00000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1053  DtxR family iron dependent repressor  39.29 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0541  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.79 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000508383  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0525  DtxR family iron dependent repressor  34.17 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00120371  normal  0.358538 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2011  manganese transport transcriptional regulator  34.81 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1132  DtxR family iron dependent repressor  32.61 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.179229 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3768  DtxR family iron dependent repressor  35.83 
 
 		 177 aa  71.2  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000422778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2721  iron dependent repressor  37.6 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.102703  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3776  iron dependent repressor  33.62 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259389  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3607  DtxR family iron dependent repressor  31.34 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1294  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.54 
 
 		 142 aa  67  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0246  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.966628 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1402  DtxR family iron dependent repressor  40.7 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000267968  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1620  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.07 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.303579  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0973  iron dependent repressor  30.88 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106771  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2813  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.34 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.957834 
 
 
-
 
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  30.51 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02690  iron dependent repressor  37.61 
 
 		 147 aa  63.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4272  manganese transport regulator MntR  31.36 
 
 		 171 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0114  iron-dependent transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.272637  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.3 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.641152 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3888  manganese transport regulator MntR  32.46 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3596  manganese transport regulator MntR  32.46 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4423  manganese transport regulator MntR  32.14 
 
 		 153 aa  62  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1619  DtxR family iron dependent repressor  31.25 
 
 		 153 aa  62  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123273 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1535  iron-dependent transcriptional repressor  28.68 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1082  iron dependent repressor  29.66 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0224083  hitchhiker  0.00000000150507 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1304  manganese transport regulator MntR  29.46 
 
 		 157 aa  60.8  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.581866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1581  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.03 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000557484  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2473  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.15 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0985085  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2802  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.44 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1915  manganese transport regulator MntR  28.69 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00170642  decreased coverage  0.00000058092 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1105  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.86 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000518249  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  31.62 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3941  DtxR family iron dependent repressor  31.25 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.02597 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1353  manganese transport regulator MntR  32.48 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.895463 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3626  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.25 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3611  DtxR family iron dependent repressor  34.55 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.321459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3949  DtxR family iron dependent repressor  34.55 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.592113  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4057  manganese transport transcriptional regulator  31.58 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4277  manganese transport transcriptional regulator  31.58 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4108  manganese transport transcriptional regulator  31.58 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3946  manganese transport transcriptional regulator  31.58 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3957  manganese transport transcriptional regulator  31.58 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4428  manganese transport transcriptional regulator  31.58 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4224  manganese transport transcriptional regulator  31.58 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4333  manganese transport transcriptional regulator  31.58 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4314  manganese transport transcriptional regulator  30.71 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2328  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.62 
 
 		 160 aa  57.4  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0920  manganese transport transcriptional regulator  30.71 
 
 		 142 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2346  manganese transport transcriptional regulator  31.25 
 
 		 142 aa  57  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1404  manganese transport transcriptional regulator  36.14 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1784  iron dependent repressor  31.72 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2897  manganese transport transcriptional regulator  31.2 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000708107  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0973  iron dependent repressor  30.65 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0171137 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0797  iron dependent repressor  31.03 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00784  DNA-binding transcriptional regulator of mntH  27.68 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2825  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.68 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00801  hypothetical protein  27.68 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0874  manganese transport regulator MntR  27.68 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0887  manganese transport regulator MntR  27.68 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.185812  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0107  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.73 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000388915  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0227  manganese transport transcriptional regulator  29.1 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2826  manganese transport regulator MntR  27.68 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0841  manganese transport regulator MntR  27.68 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2531  manganese transport regulator MntR  27.68 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0966  manganese transport regulator MntR  27.68 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0782983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0078  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.03 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.305356  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0903  manganese transport regulator MntR  27.68 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0966  manganese transport regulator MntR  27.68 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0987  manganese transport regulator MntR  27.68 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0875  manganese transport regulator MntR  27.68 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0933  manganese transport regulator MntR  27.68 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2677  manganese transport regulator MntR  28.69 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0464566  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1477  iron dependent repressor  41.18 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000154741  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0620  DtxR family iron dependent repressor  31.25 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000404291  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  34.44 
 
 		 228 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0572  DtxR family iron dependent repressor  30.84 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2426  manganese transport regulator MntR  28.18 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00918  manganese transport regulator MntR  30.7 
 
 		 155 aa  53.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0409262  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20030  Mn-dependent transcriptional regulator  29.66 
 
 		 144 aa  52.8  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.487475 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1583  transcriptional regulator LysR family  27.03 
 
 		 163 aa  52  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.104279  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  27.68 
 
 		 230 aa  52  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.45 
 
 		 232 aa  51.6  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2291  manganese transport regulator MntR  28.57 
 
 		 156 aa  51.6  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466027 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3457  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.12 
 
 		 126 aa  51.6  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300456  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  33.33 
 
 		 248 aa  51.2  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.05 
 
 		 235 aa  51.2  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0329  manganese transport regulator MntR  29.46 
 
 		 164 aa  51.2  0.000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.930858  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0301  manganese transport regulator MntR  29.46 
 
 		 164 aa  50.8  0.000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0279959  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  28.7 
 
 		 218 aa  50.1  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  29.31 
 
 		 227 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>