More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0090 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0090  type II secretion system protein E  100 
 
 
566 aa  1135  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0090  type II secretion system protein E  95.94 
 
 
567 aa  1059  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  7.79667e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  60.11 
 
 
563 aa  646  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  56.51 
 
 
569 aa  597  1e-169  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  46.47 
 
 
871 aa  472  1e-132  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  46.18 
 
 
558 aa  466  1e-130  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  43.84 
 
 
558 aa  443  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  42.83 
 
 
556 aa  443  1e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  43.19 
 
 
555 aa  432  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  44.84 
 
 
553 aa  433  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  42.19 
 
 
568 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.68 
 
 
568 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.06 
 
 
568 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  43 
 
 
570 aa  434  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  6.26903e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.06 
 
 
568 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  42.32 
 
 
553 aa  431  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  43.62 
 
 
559 aa  432  1e-119  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  42.22 
 
 
564 aa  424  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  42.29 
 
 
553 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  41.92 
 
 
557 aa  425  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  43.04 
 
 
561 aa  422  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  41.64 
 
 
554 aa  423  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  42 
 
 
557 aa  420  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.9 
 
 
571 aa  420  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  42.33 
 
 
787 aa  421  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  39.79 
 
 
564 aa  419  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.04 
 
 
568 aa  418  1e-115  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  41.8 
 
 
563 aa  416  1e-115  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  40.74 
 
 
568 aa  414  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  41.3 
 
 
568 aa  414  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  41.52 
 
 
553 aa  414  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  42.73 
 
 
561 aa  413  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  40.53 
 
 
577 aa  412  1e-114  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  40.67 
 
 
572 aa  410  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.3 
 
 
568 aa  409  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  40.52 
 
 
575 aa  409  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.55 
 
 
568 aa  406  1e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  40.11 
 
 
891 aa  404  1e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  40.76 
 
 
571 aa  403  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  40.21 
 
 
591 aa  405  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  41.13 
 
 
578 aa  404  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  41.1 
 
 
561 aa  402  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  39.82 
 
 
561 aa  400  1e-110  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  39.89 
 
 
558 aa  401  1e-110  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.34 
 
 
568 aa  401  1e-110  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  38.68 
 
 
566 aa  400  1e-110  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.17 
 
 
568 aa  399  1e-110  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  38.75 
 
 
599 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  42.97 
 
 
577 aa  396  1e-109  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  39.19 
 
 
885 aa  397  1e-109  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  39.86 
 
 
585 aa  399  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  39.65 
 
 
888 aa  393  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  38.82 
 
 
577 aa  395  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  40.59 
 
 
573 aa  394  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  40.49 
 
 
603 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  38.79 
 
 
599 aa  395  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  38.62 
 
 
599 aa  395  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  40.11 
 
 
580 aa  394  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0246  type II secretion system protein E  42.83 
 
 
560 aa  394  1e-108  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00126346  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  49.88 
 
 
499 aa  390  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3426  general secretory pathway protein E  48.55 
 
 
497 aa  390  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1022  type II secretion system protein E  41.7 
 
 
554 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  39.03 
 
 
571 aa  390  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3246  general secretory pathway protein GspE  48.55 
 
 
497 aa  390  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.827332 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  38.36 
 
 
610 aa  387  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02787  hypothetical protein  48.55 
 
 
497 aa  388  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  3.9107e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3137  general secretory pathway protein E  50 
 
 
497 aa  388  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02837  hypothetical type II secretion protein GspE  48.55 
 
 
497 aa  388  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  2.37275e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1571  type II secretion system protein E  39.68 
 
 
587 aa  385  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00763489  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.37 
 
 
571 aa  385  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  38.92 
 
 
567 aa  388  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2648  type II secretion system protein E  38.51 
 
 
579 aa  386  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0969268  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2969  type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  39.04 
 
 
841 aa  385  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.515104  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3438  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.28 
 
 
569 aa  383  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.141365  normal  0.083139 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29490  putative type II secretion protein  39.02 
 
 
575 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  49.75 
 
 
503 aa  384  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16170  type II secretion system protein E, GspE  39.54 
 
 
569 aa  384  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1300  general secretory pathway protein E  49.26 
 
 
498 aa  384  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.86 
 
 
563 aa  385  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2090  type II secretion system protein E  39.33 
 
 
573 aa  379  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3428  general secretory pathway protein E  49.74 
 
 
471 aa  381  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00010017 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0419  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.79 
 
 
569 aa  382  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.447977  hitchhiker  0.00974258 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0416  type IV pilus biogenesis protein PilB  40.42 
 
 
569 aa  379  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  38.39 
 
 
570 aa  381  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  38.02 
 
 
570 aa  380  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  37.7 
 
 
559 aa  380  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3243  type II secretion system protein E  48.15 
 
 
499 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1504  pilus assembly protein PilB  40.52 
 
 
574 aa  377  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0369  type IV pilus biogenesis protein PilB  39.61 
 
 
568 aa  376  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0217494  unclonable  1.24471e-05 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3605  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.42 
 
 
569 aa  379  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464844  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  39.12 
 
 
578 aa  375  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3393  type II secretion system protein E  48.32 
 
 
513 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118784  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1471  general secretory pathway protein E  51.17 
 
 
498 aa  376  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  49.13 
 
 
501 aa  379  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  42.02 
 
 
514 aa  376  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0062  general secretory pathway protein E  48.77 
 
 
498 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  49.26 
 
 
515 aa  379  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  7.85682e-05 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  39.03 
 
 
568 aa  376  1e-103  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  46.07 
 
 
514 aa  377  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0546  general secretory pathway protein E  38.49 
 
 
573 aa  372  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0871321 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>