94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0824 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0824  putative lipoprotein  100 
 
 
216 aa  446  1.0000000000000001e-124  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000106095  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4777  Allergen V5/Tpx-1 related  42.31 
 
 
214 aa  155  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.497987  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0943  Allergen V5/Tpx-1 family protein  44.75 
 
 
242 aa  146  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4778  Allergen V5/Tpx-1 related  40.98 
 
 
233 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.435965  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4870  SCP-like extracellular  40.88 
 
 
293 aa  135  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.137537 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3057  SCP-like extracellular  39.25 
 
 
205 aa  124  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1216  SCP-like extracellular  40.64 
 
 
205 aa  122  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.616786  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1168  hypothetical protein  34.76 
 
 
217 aa  121  7e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.452749  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2270  Allergen V5/Tpx-1 family protein  37.26 
 
 
208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0292  Allergen V5/Tpx-1 family protein  37.32 
 
 
208 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0796  Allergen V5/Tpx-1 related protein  38.46 
 
 
212 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5182  SCP-like extracellular  33.52 
 
 
309 aa  89.7  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1620  Allergen V5/Tpx-1 related  36.48 
 
 
217 aa  85.9  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1475  SCP-like extracellular  29.61 
 
 
192 aa  72  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0179083 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  33.33 
 
 
541 aa  70.9  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  36.36 
 
 
209 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  27.72 
 
 
276 aa  62.4  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  33 
 
 
283 aa  62  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  34.55 
 
 
213 aa  61.6  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  37.23 
 
 
458 aa  61.6  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1426  SCP-like extracellular protein  37.38 
 
 
287 aa  60.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000767316  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1399  SCP-like extracellular  37.38 
 
 
287 aa  60.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000144066  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3270  allergen V5/TPX-1 family protein  27.53 
 
 
228 aa  61.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.119543 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  34.13 
 
 
495 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2711  SCP-like extracellular  37.5 
 
 
220 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000599492  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  35.71 
 
 
270 aa  60.5  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1289  Allergen V5/Tpx-1 family protein  35.87 
 
 
443 aa  59.7  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323784  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  28.65 
 
 
275 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  30.4 
 
 
270 aa  58.9  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  37.5 
 
 
264 aa  58.5  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  34.69 
 
 
275 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  34.69 
 
 
275 aa  58.5  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  34.69 
 
 
275 aa  58.5  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  34.69 
 
 
263 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  34.69 
 
 
275 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  34.69 
 
 
270 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  34.69 
 
 
275 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  35.63 
 
 
205 aa  57.8  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  34.78 
 
 
444 aa  58.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  26.56 
 
 
328 aa  56.2  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  33.67 
 
 
244 aa  56.2  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0081  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.69 
 
 
321 aa  56.2  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  32.61 
 
 
203 aa  55.5  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0051  Allergen V5/Tpx-1 family protein  34.02 
 
 
300 aa  55.1  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000168583  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  34.31 
 
 
222 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1179  SCP-like extracellular  33.7 
 
 
465 aa  53.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249096  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  35.64 
 
 
212 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0488  Allergen V5/Tpx-1 related  32.26 
 
 
299 aa  52.8  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2217  SCP-like extracellular  30 
 
 
162 aa  52.4  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  29.25 
 
 
167 aa  52  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2043  Allergen V5/Tpx-1 related  28.03 
 
 
196 aa  52  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0276422  normal  0.319002 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  30.16 
 
 
347 aa  52  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0907  hypothetical protein  26.97 
 
 
341 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2381  Allergen V5/Tpx-1 related  32.11 
 
 
310 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0357627 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2424  SCP-like extracellular  31.37 
 
 
200 aa  51.2  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.572617  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1235  SCP-like extracellular  29.57 
 
 
399 aa  51.2  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05140  SCP-like extracellular  28.8 
 
 
258 aa  50.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1857  SCP-like extracellular  29.66 
 
 
214 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.539147  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3268  SCP-like extracellular  34.18 
 
 
410 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4392  SCP-like extracellular  32.63 
 
 
180 aa  48.9  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0393  SCP-like extracellular  32.17 
 
 
168 aa  48.9  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0611399  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  29.41 
 
 
338 aa  48.9  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2649  hypothetical protein  30.28 
 
 
320 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00790253  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0445  SCP-like extracellular  32.48 
 
 
500 aa  48.1  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000975734  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3522  SCP-like extracellular  30.26 
 
 
290 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1543  hypothetical protein  30.93 
 
 
235 aa  47.8  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3579  hypothetical protein  31.25 
 
 
293 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38499  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3350  Allergen V5/Tpx-1 related  30.21 
 
 
293 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  0.0178942 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001041  hypothetical protein  28.46 
 
 
179 aa  46.6  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  33.33 
 
 
317 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  30.34 
 
 
287 aa  46.2  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0828  SCP-like extracellular  30.53 
 
 
274 aa  45.8  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017875  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4717  SCP-like extracellular  33.96 
 
 
197 aa  45.4  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.771476  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0683  SCP-like extracellular  25.83 
 
 
423 aa  45.4  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2948  Allergen V5/Tpx-1 related  31.58 
 
 
280 aa  45.1  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0215583  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2115  SCP-like extracellular  31.91 
 
 
349 aa  45.1  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.147298  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2104  Allergen V5/Tpx-1-like  29.36 
 
 
288 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233408  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5956  SCP-like extracellular  28.87 
 
 
226 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1374  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.3 
 
 
129 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  29.82 
 
 
245 aa  44.7  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1156  Allergen V5/Tpx-1 related  33.33 
 
 
337 aa  44.3  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  28.42 
 
 
260 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1463  SCP-like extracellular  23.85 
 
 
312 aa  43.9  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00481671 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1940  SCP-like extracellular  33.33 
 
 
242 aa  43.9  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0764504  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3446  SCP-like extracellular  29.81 
 
 
589 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.118078 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  31.11 
 
 
450 aa  43.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1597  Allergen V5/Tpx-1 family protein  29.13 
 
 
602 aa  42.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0402  SCP-like extracellular  27.78 
 
 
160 aa  43.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3384  Allergen V5/Tpx-1-like  28.71 
 
 
294 aa  42.4  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0728  SCP-like extracellular  27.73 
 
 
285 aa  42.4  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0202  hypothetical protein  28.24 
 
 
156 aa  41.6  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00696457  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0470  Allergen V5/Tpx-1 related  28.1 
 
 
310 aa  41.6  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.765372 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1835  Allergen V5/Tpx-1 family protein  28.24 
 
 
156 aa  41.6  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.780904  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3169  Allergen V5/Tpx-1 family protein  27.62 
 
 
279 aa  41.6  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.635999  normal  0.126682 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>