36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3270 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3270  allergen V5/TPX-1 family protein  100 
 
 		 228 aa  475  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.119543 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0943  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30.3 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4778  Allergen V5/Tpx-1 related  28.95 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.435965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4777  Allergen V5/Tpx-1 related  27.32 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.497987  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1168  hypothetical protein  25.4 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.452749  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0824  putative lipoprotein  27.53 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000106095  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0796  Allergen V5/Tpx-1 related protein  32.76 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0292  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.09 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  34.69 
 
 		 541 aa  54.7  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3057  SCP-like extracellular  33.63 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1475  SCP-like extracellular  41.79 
 
 		 192 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0179083 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  30.84 
 
 		 287 aa  51.6  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4870  SCP-like extracellular  28.81 
 
 		 293 aa  51.2  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.137537 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  33 
 
 		 167 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2270  Allergen V5/Tpx-1 family protein  24.18 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1216  SCP-like extracellular  31.15 
 
 		 205 aa  50.1  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.616786  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  37.5 
 
 		 213 aa  48.5  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0749  SCP-like extracellular  32.48 
 
 		 355 aa  47.8  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  30.61 
 
 		 260 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5005  SCP-like extracellular  31.58 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342918  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0683  SCP-like extracellular  30.63 
 
 		 423 aa  47  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1620  Allergen V5/Tpx-1 related  28.57 
 
 		 217 aa  47  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4285  SCP-like extracellular  30.56 
 
 		 296 aa  45.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  25.83 
 
 		 347 aa  45.8  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1235  SCP-like extracellular  28.57 
 
 		 399 aa  45.8  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5831  SCP-like extracellular  34.83 
 
 		 214 aa  45.4  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.529003  normal  0.937003 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8010  SCP-like extracellular  30 
 
 		 232 aa  45.4  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  32.18 
 
 		 211 aa  45.4  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1426  SCP-like extracellular protein  32.04 
 
 		 287 aa  45.1  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000767316  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1399  SCP-like extracellular  32.04 
 
 		 287 aa  45.1  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000144066  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0140  Allergen V5/Tpx-1 family protein  29.73 
 
 		 372 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.697458  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4039  hypothetical protein  32.11 
 
 		 344 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.784658  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3764  SCP-like extracellular  29.77 
 
 		 373 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  31.87 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2640  hypothetical protein  29.63 
 
 		 353 aa  43.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0937186  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  32.79 
 
 		 495 aa  42  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.20701 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>