18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1216 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1216  SCP-like extracellular  100 
 
 		 205 aa  421  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.616786  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3057  SCP-like extracellular  93.17 
 
 		 205 aa  397  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2270  Allergen V5/Tpx-1 family protein  59.8 
 
 		 208 aa  238  2.9999999999999997e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0292  Allergen V5/Tpx-1 family protein  54.08 
 
 		 208 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1168  hypothetical protein  55.25 
 
 		 217 aa  211  3.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.452749  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0796  Allergen V5/Tpx-1 related protein  52.2 
 
 		 212 aa  192  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4778  Allergen V5/Tpx-1 related  44.51 
 
 		 233 aa  159  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.435965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4777  Allergen V5/Tpx-1 related  41.36 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.497987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0943  Allergen V5/Tpx-1 family protein  40.66 
 
 		 242 aa  138  4.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0824  putative lipoprotein  38.32 
 
 		 216 aa  124  9e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000106095  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4870  SCP-like extracellular  38.46 
 
 		 293 aa  123  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.137537 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1475  SCP-like extracellular  43.02 
 
 		 192 aa  115  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0179083 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1620  Allergen V5/Tpx-1 related  40 
 
 		 217 aa  111  7.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5182  SCP-like extracellular  37.43 
 
 		 309 aa  106  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3270  allergen V5/TPX-1 family protein  31.58 
 
 		 228 aa  49.7  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.119543 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1835  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.64 
 
 		 156 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.780904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0202  hypothetical protein  33.64 
 
 		 156 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00696457  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2217  SCP-like extracellular  30.43 
 
 		 162 aa  43.1  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>