25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0796 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0796  Allergen V5/Tpx-1 related protein  100 
 
 		 212 aa  433  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1168  hypothetical protein  64.8 
 
 		 217 aa  236  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.452749  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2270  Allergen V5/Tpx-1 family protein  52.63 
 
 		 208 aa  202  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3057  SCP-like extracellular  50.25 
 
 		 205 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1216  SCP-like extracellular  51.61 
 
 		 205 aa  192  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.616786  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0292  Allergen V5/Tpx-1 family protein  50.73 
 
 		 208 aa  193  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4778  Allergen V5/Tpx-1 related  43.96 
 
 		 233 aa  159  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.435965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4777  Allergen V5/Tpx-1 related  42.86 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.497987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0943  Allergen V5/Tpx-1 family protein  40.33 
 
 		 242 aa  150  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1620  Allergen V5/Tpx-1 related  46.07 
 
 		 217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4870  SCP-like extracellular  40.98 
 
 		 293 aa  125  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.137537 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1475  SCP-like extracellular  43.82 
 
 		 192 aa  118  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0179083 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0824  putative lipoprotein  38.46 
 
 		 216 aa  111  8.000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000106095  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5182  SCP-like extracellular  36.36 
 
 		 309 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3270  allergen V5/TPX-1 family protein  32.76 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.119543 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0202  hypothetical protein  35.65 
 
 		 156 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00696457  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1835  Allergen V5/Tpx-1 family protein  35.65 
 
 		 156 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.780904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2358  SCP-like extracellular  37.37 
 
 		 283 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678269  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2217  SCP-like extracellular  31.18 
 
 		 162 aa  45.4  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1443  Allergen V5/Tpx-1 family protein  36.13 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.477266  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3563  hypothetical protein  36.36 
 
 		 283 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2482  SCP-like extracellular  36.73 
 
 		 283 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897986  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3350  Allergen V5/Tpx-1 related  34 
 
 		 293 aa  42.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  0.0178942 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3579  hypothetical protein  34 
 
 		 293 aa  42.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38499  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  28.46 
 
 		 203 aa  41.6  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>