14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5182 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5182  SCP-like extracellular  100 
 
 		 309 aa  620  1e-176  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4870  SCP-like extracellular  42.08 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.137537 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4777  Allergen V5/Tpx-1 related  37.3 
 
 		 214 aa  122  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.497987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3057  SCP-like extracellular  39.04 
 
 		 205 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4778  Allergen V5/Tpx-1 related  35.87 
 
 		 233 aa  112  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.435965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0292  Allergen V5/Tpx-1 family protein  36.87 
 
 		 208 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2270  Allergen V5/Tpx-1 family protein  36.57 
 
 		 208 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1216  SCP-like extracellular  37.79 
 
 		 205 aa  106  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.616786  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0796  Allergen V5/Tpx-1 related protein  36.36 
 
 		 212 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1168  hypothetical protein  33.52 
 
 		 217 aa  97.1  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.452749  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0943  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.41 
 
 		 242 aa  92  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0824  putative lipoprotein  33.52 
 
 		 216 aa  89.7  6e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000106095  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1620  Allergen V5/Tpx-1 related  32.79 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1475  SCP-like extracellular  31.76 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0179083 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>