26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1475 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1475  SCP-like extracellular  100 
 
 
192 aa  373  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0179083 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2270  Allergen V5/Tpx-1 family protein  44.44 
 
 
208 aa  149  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1168  hypothetical protein  45.7 
 
 
217 aa  143  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.452749  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0292  Allergen V5/Tpx-1 family protein  42.64 
 
 
208 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3057  SCP-like extracellular  42.93 
 
 
205 aa  131  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1216  SCP-like extracellular  43.01 
 
 
205 aa  125  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.616786  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0796  Allergen V5/Tpx-1 related protein  43.82 
 
 
212 aa  121  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4778  Allergen V5/Tpx-1 related  35.87 
 
 
233 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.435965  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4777  Allergen V5/Tpx-1 related  35.14 
 
 
214 aa  112  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.497987  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0943  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.33 
 
 
242 aa  112  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4870  SCP-like extracellular  34.66 
 
 
293 aa  97.1  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.137537 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1620  Allergen V5/Tpx-1 related  38.15 
 
 
217 aa  89.4  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0824  putative lipoprotein  26.76 
 
 
216 aa  81.6  0.000000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000106095  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5182  SCP-like extracellular  31.61 
 
 
309 aa  75.5  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3270  allergen V5/TPX-1 family protein  31.15 
 
 
228 aa  60.8  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.119543 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0323  hypothetical protein  29.01 
 
 
139 aa  48.5  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.970328  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0309  hypothetical protein  29.01 
 
 
139 aa  48.5  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1835  Allergen V5/Tpx-1 family protein  36.54 
 
 
156 aa  48.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.780904  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0202  hypothetical protein  36.54 
 
 
156 aa  48.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00696457  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  32.81 
 
 
495 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1443  Allergen V5/Tpx-1 family protein  38.24 
 
 
178 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.477266  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  33.33 
 
 
212 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0402  SCP-like extracellular  28.95 
 
 
160 aa  44.7  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  31.71 
 
 
264 aa  44.7  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0910  hypothetical protein  26.72 
 
 
184 aa  43.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0940  hypothetical protein  27.59 
 
 
184 aa  43.5  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>