20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0292 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0292  Allergen V5/Tpx-1 family protein  100 
 
 
208 aa  426  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2270  Allergen V5/Tpx-1 family protein  57.07 
 
 
208 aa  230  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3057  SCP-like extracellular  55.61 
 
 
205 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1216  SCP-like extracellular  56.04 
 
 
205 aa  206  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.616786  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1168  hypothetical protein  54.75 
 
 
217 aa  193  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.452749  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0796  Allergen V5/Tpx-1 related protein  53.33 
 
 
212 aa  189  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0943  Allergen V5/Tpx-1 family protein  40.91 
 
 
242 aa  138  7e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4777  Allergen V5/Tpx-1 related  39.89 
 
 
214 aa  137  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.497987  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4870  SCP-like extracellular  42.37 
 
 
293 aa  134  7.000000000000001e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.137537 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4778  Allergen V5/Tpx-1 related  36.45 
 
 
233 aa  134  9e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.435965  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1620  Allergen V5/Tpx-1 related  42.86 
 
 
217 aa  122  4e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1475  SCP-like extracellular  44.19 
 
 
192 aa  122  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0179083 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0824  putative lipoprotein  37.32 
 
 
216 aa  119  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000106095  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5182  SCP-like extracellular  36.87 
 
 
309 aa  108  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3270  allergen V5/TPX-1 family protein  31.09 
 
 
228 aa  60.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.119543 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2217  SCP-like extracellular  34.74 
 
 
162 aa  50.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  33.62 
 
 
222 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1835  Allergen V5/Tpx-1 family protein  34.17 
 
 
156 aa  48.5  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.780904  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0202  hypothetical protein  34.17 
 
 
156 aa  48.5  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00696457  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3565  hypothetical protein  30.7 
 
 
206 aa  45.8  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.727767  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>