More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0443 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0443  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  100 
 
 		 291 aa  600  1.0000000000000001e-171  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1151  Radical SAM domain protein  47.08 
 
 		 291 aa  273  3e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.388903 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0919  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, Fe-S oxidoreductase  42.36 
 
 		 292 aa  244  9.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2142  Radical SAM domain protein  42.86 
 
 		 291 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.608518  decreased coverage  0.00173745 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0173  radical SAM domain-containing protein  40.55 
 
 		 292 aa  237  1e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000741532  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3617  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, Fe-S oxidoreductase  38.27 
 
 		 293 aa  223  3e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0365  radical SAM domain-containing protein  38.49 
 
 		 289 aa  223  3e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00570597  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1744  radical SAM domain-containing protein  40.68 
 
 		 380 aa  223  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743194  decreased coverage  0.000183859 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2654  Radical SAM domain protein  37.59 
 
 		 291 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000344406  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2529  radical SAM domain-containing protein  38.32 
 
 		 296 aa  217  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.496911  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3790  Radical SAM domain protein  40.29 
 
 		 338 aa  210  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.135303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0717  radical SAM domain-containing protein  36.23 
 
 		 292 aa  205  9e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3023  radical SAM domain-containing protein  37.94 
 
 		 386 aa  202  6e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1475  radical SAM domain-containing protein  39.19 
 
 		 298 aa  198  7e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0640288  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2999  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase putative  35.6 
 
 		 388 aa  195  8.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2870  Radical SAM domain protein  36.95 
 
 		 373 aa  194  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.578576 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1410  Radical SAM domain protein  36.18 
 
 		 377 aa  192  6e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0201  radical SAM domain-containing protein  35.27 
 
 		 293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3059  radical SAM domain-containing protein  34.69 
 
 		 293 aa  180  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1505  radical SAM domain-containing protein  35.59 
 
 		 292 aa  181  2e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00044584 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3100  Radical SAM domain protein  36.5 
 
 		 295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.358776  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4516  radical SAM domain-containing protein  37.5 
 
 		 293 aa  179  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2265  Radical SAM domain protein  34.91 
 
 		 293 aa  178  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1162  Radical SAM domain protein  35.77 
 
 		 295 aa  177  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0199468 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3076  radical SAM family protein  37 
 
 		 292 aa  177  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0110421  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0456  radical SAM domain-containing protein  36.59 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3668  radical SAM domain-containing protein  33.95 
 
 		 293 aa  176  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0453  radical SAM domain-containing protein  36.24 
 
 		 294 aa  176  6e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0423  radical SAM family protein  32.84 
 
 		 293 aa  175  6e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1884  radical SAM family protein  35.71 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.295187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2989  radical SAM domain-containing protein  34.16 
 
 		 293 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000144866  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0528  hypothetical protein  34.84 
 
 		 295 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0530  radical SAM domain-containing protein  35.54 
 
 		 295 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3501  radical SAM domain-containing protein  35.54 
 
 		 295 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3965  radical SAM domain-containing protein  36.2 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1640  radical SAM domain-containing protein  36.43 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.387627  normal  0.955096 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0486  radical SAM domain-containing protein  36.2 
 
 		 295 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2726  Radical SAM domain protein  31.04 
 
 		 399 aa  169  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0407  hypothetical protein  36.92 
 
 		 294 aa  169  5e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0657  Radical SAM domain protein  34.1 
 
 		 292 aa  168  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2205  hypothetical protein  36.63 
 
 		 298 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42445  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25810  hypothetical protein  35.9 
 
 		 298 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.723648  normal  0.254703 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02260  Fe-S oxidoreductase  31.94 
 
 		 293 aa  162  5.0000000000000005e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04170  Fe-S oxidoreductase  34.36 
 
 		 293 aa  159  5e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.63469 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3046  radical SAM family protein  31.54 
 
 		 293 aa  159  6e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2061  radical SAM domain-containing protein  31.94 
 
 		 294 aa  159  6e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.952171  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26860  Fe-S oxidoreductase  32.16 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2963  radical SAM domain-containing protein  32.52 
 
 		 293 aa  157  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3395  radical SAM domain-containing protein  36.86 
 
 		 292 aa  157  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00495336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13790  Fe-S oxidoreductase  31.85 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1360  radical SAM domain-containing protein  34.66 
 
 		 300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.397431  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25530  Fe-S oxidoreductase  31.23 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.261112  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0622  radical SAM domain-containing protein  30.58 
 
 		 311 aa  139  3.9999999999999997e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.044899  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24530  Fe-S oxidoreductase  32.73 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3411  Elongator protein 3/MiaB/NifB  34.45 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0066  Radical SAM domain protein  30.94 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.628263  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1019  Radical SAM domain protein  26.69 
 
 		 390 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1372  radical SAM domain-containing protein  29.54 
 
 		 402 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16730  Fe-S oxidoreductase  28.78 
 
 		 332 aa  112  7.000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.359613 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25380  Fe-S oxidoreductase  26.33 
 
 		 300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.76381  normal  0.564969 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3579  radical SAM domain-containing protein  30.43 
 
 		 409 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.630491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2640  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.38 
 
 		 296 aa  98.2  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00660  Fe-S oxidoreductase  26.03 
 
 		 321 aa  87  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3838  radical SAM domain-containing protein  34.35 
 
 		 156 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0353  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  24.29 
 
 		 485 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.90319 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1009  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  25.98 
 
 		 479 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1038  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  25.98 
 
 		 479 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000337224 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0504  radical SAM domain-containing protein  27.09 
 
 		 471 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1898  Radical SAM domain protein  29.91 
 
 		 459 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2393  radical SAM domain-containing protein  23.83 
 
 		 490 aa  63.2  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.386797  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2566  radical SAM family protein  27.54 
 
 		 441 aa  63.2  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3555  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 448 aa  62.4  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0875  radical SAM family Fe-S protein  27.1 
 
 		 495 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2963  radical SAM domain-containing protein  25.74 
 
 		 476 aa  61.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000286011  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3090  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  27.72 
 
 		 476 aa  60.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000038537  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2185  Radical SAM domain protein  25.34 
 
 		 473 aa  60.1  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000424629  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0878  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  23.72 
 
 		 473 aa  59.7  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.858521  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00191  Mg-protoporphyrin IX monomethyl ester oxidative cyclase  25.46 
 
 		 506 aa  60.1  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3165  Fe-S oxidoreductase  29.66 
 
 		 459 aa  59.7  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00148517 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4964  radical SAM family protein  25.12 
 
 		 476 aa  59.3  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.576294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3127  radical SAM domain-containing protein  28.48 
 
 		 475 aa  59.3  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3151  radical SAM domain-containing protein  25.62 
 
 		 351 aa  58.9  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207208  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1179  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  27.46 
 
 		 474 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.846685  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3382  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  23.72 
 
 		 473 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1178  radical SAM domain-containing protein  29.06 
 
 		 439 aa  57.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1150  oxidative cyclase-related protein  25.98 
 
 		 475 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0577  radical SAM domain-containing protein  28 
 
 		 473 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2859  Fe-S oxidoreductase  28 
 
 		 473 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1750  radical SAM domain-containing protein  28 
 
 		 473 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.499976  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1713  radical SAM domain-containing protein  28.23 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2416  radical SAM family protein  24.38 
 
 		 475 aa  58.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000137144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1944  Radical SAM domain protein  23.62 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1767  radical SAM domain-containing protein  27 
 
 		 503 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580532  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3569  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  23.83 
 
 		 478 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.663184 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2796  radical SAM domain-containing protein  28 
 
 		 481 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0536346  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2852  radical SAM domain-containing protein  28 
 
 		 481 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2737  radical SAM domain-containing protein  28 
 
 		 481 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2825  radical SAM domain-containing protein  24.88 
 
 		 476 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000393045  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17330  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  26.2 
 
 		 389 aa  57.4  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.395345  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1061  Radical SAM domain protein  26.42 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8315700000000001e-19 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>