More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0994 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 285 aa  573  1.0000000000000001e-163  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1365  alpha/beta hydrolase  50.55 
 
 		 290 aa  252  4.0000000000000004e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1777  alpha/beta hydrolase fold  46.5 
 
 		 291 aa  244  9e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284717 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2766  non-heme peroxidase  46.79 
 
 		 293 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7313  Alpha/beta hydrolase fold  48.35 
 
 		 303 aa  238  8e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  45.99 
 
 		 280 aa  229  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  46.21 
 
 		 292 aa  229  4e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4458  alpha/beta hydrolase fold  45.45 
 
 		 302 aa  226  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3026  alpha/beta hydrolase fold  45.45 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0315  alpha/beta hydrolase fold  43.34 
 
 		 300 aa  219  5e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4320  alpha/beta hydrolase fold  44.48 
 
 		 312 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5259  alpha/beta hydrolase fold  43.98 
 
 		 288 aa  217  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4090  alpha/beta hydrolase fold  44.48 
 
 		 312 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0153093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4166  alpha/beta hydrolase fold  44.48 
 
 		 312 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3232  alpha/beta hydrolase fold  44.21 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3221  alpha/beta hydrolase fold  44.21 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4592  alpha/beta hydrolase fold  42.66 
 
 		 296 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3283  alpha/beta hydrolase fold  44.21 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.115306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4622  alpha/beta hydrolase fold  44.37 
 
 		 299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.772942 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4507  alpha/beta hydrolase fold  45.26 
 
 		 295 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1862  alpha/beta hydrolase fold  45.62 
 
 		 301 aa  212  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308971  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4609  alpha/beta hydrolase fold  42.69 
 
 		 294 aa  207  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13510  peroxidase bpoA (non-haem peroxidase)  44.17 
 
 		 289 aa  206  4e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2096  alpha/beta hydrolase fold  42.69 
 
 		 290 aa  205  6e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.52093  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5402  alpha/beta hydrolase fold  41.95 
 
 		 286 aa  204  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5311  alpha/beta hydrolase fold  41.52 
 
 		 285 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.106317 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3063  alpha/beta hydrolase fold  42.6 
 
 		 305 aa  189  4e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.41057  normal  0.789243 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11146  peroxidase bpoB (non-haem peroxidase)  39.56 
 
 		 302 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.354208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3907  alpha/beta hydrolase fold  41.51 
 
 		 294 aa  188  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01664  hydrolase, alpha/beta fold family, putative  41.06 
 
 		 272 aa  171  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.178176  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7311  Alpha/beta hydrolase  41.24 
 
 		 303 aa  166  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.602855  normal  0.723346 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  34.63 
 
 		 408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  30.18 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  32.31 
 
 		 257 aa  94  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 		 300 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 		 289 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  27.51 
 
 		 327 aa  88.6  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5753  alpha/beta hydrolase fold  31.05 
 
 		 298 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766272  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5377  alpha/beta hydrolase fold  31.05 
 
 		 298 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5466  alpha/beta hydrolase fold  31.05 
 
 		 298 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0306241 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  31.44 
 
 		 267 aa  85.9  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  28.73 
 
 		 258 aa  84.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  25.61 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0865  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6042  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 298 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1692  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.155751 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5586  alpha/beta hydrolase fold  30.2 
 
 		 326 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2243  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 		 274 aa  75.5  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2058  alpha/beta hydrolase fold protein  30.14 
 
 		 292 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0070331  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  30.2 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1646  alpha/beta hydrolase fold  30.91 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.969824  normal  0.0462381 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28822  predicted protein  29.63 
 
 		 386 aa  72.4  0.000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2348  alpha/beta hydrolase fold protein  31.18 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  31.77 
 
 		 2762 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27.97 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3000  alpha/beta hydrolase fold  26.17 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  29.77 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0361  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  27.68 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10044  hydrolase  28.69 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2701  putative hydrolase / acyltransferase  28.57 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  30.68 
 
 		 308 aa  68.9  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  27.17 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2704  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0111794  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3402  esterase/lipase  28.63 
 
 		 235 aa  68.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  39.66 
 
 		 280 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  26.49 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0785  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1209  esterase/lipase  23.41 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1577  putative hydrolase protein  27.17 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  26.87 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  30.28 
 
 		 229 aa  67  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 		 266 aa  67  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  26.19 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4162  alpha/beta hydrolase fold  24.5 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.685661  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5476  alpha/beta hydrolase fold  28.15 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294136  normal  0.797092 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1790  alpha/beta hydrolase fold  27.45 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.911201  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1898  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.033526 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  37.9 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  37.9 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  25.57 
 
 		 296 aa  65.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0035  hypothetical protein  27.94 
 
 		 279 aa  65.5  0.0000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  25.48 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3629  alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.030304  hitchhiker  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5337  alpha/beta hydrolase fold protein  29.46 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0345321  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3569  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0939994  normal  0.0434942 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0065  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  25.66 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  29.92 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  25.66 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  31.97 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3856  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 		 364 aa  63.9  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.775297  normal  0.514851 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3150  alpha/beta hydrolase fold  27.3 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>