70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_39100 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_7004  GTP-binding protein HSR1-related  64.74 
 
 		 610 aa  736    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.793634  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39100  GTPase of unknown function  100 
 
 		 617 aa  1217    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0000974304  normal  0.356305 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3729  hypothetical protein  35.52 
 
 		 626 aa  329  7e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.731679  normal  0.057897 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1149  hypothetical protein  28.79 
 
 		 602 aa  145  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141307  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  36.93 
 
 		 603 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  36.84 
 
 		 605 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3084  hypothetical protein  27.22 
 
 		 627 aa  112  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5964  hypothetical protein  30.14 
 
 		 641 aa  97.4  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285067  normal  0.193033 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  26.75 
 
 		 686 aa  93.6  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  26.32 
 
 		 666 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  29.5 
 
 		 605 aa  81.6  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  22.08 
 
 		 444 aa  79.7  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0273  hypothetical protein  34.3 
 
 		 608 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  27.61 
 
 		 620 aa  79.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4477  hypothetical protein  23.83 
 
 		 529 aa  77.4  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.645142  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  27.84 
 
 		 602 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0556  GTP-binding protein HSR1-related  32.38 
 
 		 602 aa  75.1  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0329351  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36820  hypothetical protein  25.41 
 
 		 624 aa  74.7  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  27.43 
 
 		 588 aa  73.9  0.000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10212  hypothetical protein  25.67 
 
 		 492 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.506116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  27.08 
 
 		 632 aa  72.8  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  27.45 
 
 		 589 aa  69.7  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  24.77 
 
 		 614 aa  68.2  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  24.77 
 
 		 614 aa  68.2  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  28.92 
 
 		 585 aa  67.8  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0447  hypothetical protein  27.76 
 
 		 619 aa  67  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.276019  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0457  hypothetical protein  27.76 
 
 		 619 aa  67  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374169  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0434  hypothetical protein  27.76 
 
 		 619 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.827508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  29.71 
 
 		 407 aa  65.9  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  32.1 
 
 		 564 aa  65.5  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  28.92 
 
 		 585 aa  64.3  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10347  isoniazid inductible gene protein iniA  24.74 
 
 		 640 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  26.15 
 
 		 693 aa  62.4  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  30.18 
 
 		 548 aa  62  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2196  dynamin family protein  21.81 
 
 		 506 aa  61.2  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  28.92 
 
 		 546 aa  59.7  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  30.05 
 
 		 614 aa  60.5  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  26.35 
 
 		 583 aa  58.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0184  hypothetical protein  26.78 
 
 		 497 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.502613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0175  hypothetical protein  26.78 
 
 		 497 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0164  hypothetical protein  27.12 
 
 		 497 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.319056 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  29.41 
 
 		 1164 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1733  hypothetical protein  26.51 
 
 		 976 aa  52  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  25.3 
 
 		 587 aa  52  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3807  dynamin family protein  29.97 
 
 		 645 aa  52  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0702524  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  27.61 
 
 		 1249 aa  50.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0370  hypothetical protein  29.25 
 
 		 346 aa  49.7  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0382536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0830  hypothetical protein  25.79 
 
 		 712 aa  50.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00896739  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0815  GTPase  25.79 
 
 		 712 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0452  hypothetical protein  25.68 
 
 		 408 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  25.24 
 
 		 674 aa  48.9  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0461  GTP-binding protein  25.89 
 
 		 569 aa  48.5  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0612543  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  21.84 
 
 		 615 aa  48.1  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  25 
 
 		 599 aa  48.1  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  26.12 
 
 		 585 aa  48.1  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2425  GTP-binding protein HSR1-related  28.86 
 
 		 533 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1510  GTP-binding protein HSR1-related  23.61 
 
 		 523 aa  48.1  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0436  GTP-binding protein  25.89 
 
 		 569 aa  47.8  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0200  hypothetical protein  25.75 
 
 		 419 aa  47.8  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0403  dynamin family protein  22.93 
 
 		 693 aa  47.4  0.0008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  26.67 
 
 		 524 aa  47  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0754256  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0337  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  28.32 
 
 		 605 aa  44.7  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1545  GTP-binding protein  25 
 
 		 569 aa  44.3  0.006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.712051  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0860  GTP-binding protein  28.7 
 
 		 601 aa  44.3  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3518  TPR repeat-containing protein  23.87 
 
 		 927 aa  44.3  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3865  hypothetical protein  23.75 
 
 		 927 aa  44.3  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2546  hypothetical protein  25.29 
 
 		 719 aa  43.9  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1219 aa  43.9  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1219 aa  43.9  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0437  GTP-binding protein  24.25 
 
 		 692 aa  43.9  0.009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>