More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_05780 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_05780  MIP family channel protein  100 
 
 		 315 aa  619  1e-176  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0875  MIP family channel protein  52.53 
 
 		 295 aa  292  4e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3914  MIP family channel protein  55.94 
 
 		 338 aa  277  2e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.223328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0495  MIP family channel protein  46.93 
 
 		 279 aa  223  4e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4609  MIP family channel protein  47.45 
 
 		 279 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.344473 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2986  MIP family channel protein  50.19 
 
 		 268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.862108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5125  MIP family channel protein  44.36 
 
 		 284 aa  199  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1007  MIP family channel protein  45.55 
 
 		 281 aa  198  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0697124  decreased coverage  0.00139101 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2332  MIP family channel protein  43.3 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7483  MIP family channel protein  44.25 
 
 		 275 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2435  MIP family channel protein  43.1 
 
 		 275 aa  193  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00774475 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1246  MIP family channel protein  42.22 
 
 		 246 aa  189  4e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2523  MIP family channel protein  42.2 
 
 		 274 aa  188  8e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1940  MIP family channel protein  43.66 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3532  major intrinsic protein  40.53 
 
 		 282 aa  177  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1215  MIP family channel protein  45.77 
 
 		 271 aa  176  6e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.576711  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1388  MIP family channel protein  40.29 
 
 		 275 aa  175  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1460  glycerol uptake facilitator protein  39.93 
 
 		 275 aa  174  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.316645  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0160  MIP family channel protein  38.87 
 
 		 279 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03312  hypothetical protein  43.48 
 
 		 284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4797  MIP family channel protein  39.65 
 
 		 281 aa  172  6.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000240891 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0175  MIP family channel protein  38.54 
 
 		 279 aa  172  7.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.487645  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0683  glycerol uptake facilitator protein  37.17 
 
 		 284 aa  169  5e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.962847  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0384  glycerol uptake facilitator protein  38.51 
 
 		 284 aa  166  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.418128  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002676  glycerol uptake facilitator protein  41.5 
 
 		 284 aa  166  5e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4303  glycerol uptake facilitator protein  38.31 
 
 		 281 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0409  glycerol uptake facilitator protein  43.43 
 
 		 251 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4486  glycerol uptake facilitator protein  38.31 
 
 		 281 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4333  glycerol uptake facilitator protein  38.31 
 
 		 281 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00574638  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4416  glycerol uptake facilitator protein  38.31 
 
 		 281 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2278  propanediol diffusion facilitator  37.09 
 
 		 269 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0682066  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4418  glycerol uptake facilitator protein  38.31 
 
 		 281 aa  165  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03915  MIP aquaporin (Eurofung)  39.86 
 
 		 340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.182238 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2373  propanediol diffusion facilitator  38.35 
 
 		 264 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0974119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2260  propanediol diffusion facilitator  38.35 
 
 		 264 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.394524  normal  0.201769 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2160  propanediol diffusion facilitator  38.35 
 
 		 264 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2207  propanediol diffusion facilitator  38.35 
 
 		 264 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.863127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2214  propanediol diffusion facilitator  38.35 
 
 		 264 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.839168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0253  major intrinsic protein  41.03 
 
 		 251 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.740215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4112  MIP family channel protein  39.71 
 
 		 282 aa  162  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0101  glycerol uptake facilitator protein  39.71 
 
 		 282 aa  162  8.000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0102  glycerol uptake facilitator protein  39.71 
 
 		 282 aa  162  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0109  MIP family channel protein  38.77 
 
 		 283 aa  161  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.205749  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0206  MIP family channel protein  38.29 
 
 		 275 aa  161  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0810  major intrinsic protein  42.45 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.199879 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4167  glycerol uptake facilitator protein  37.5 
 
 		 285 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4158  glycerol uptake facilitator protein  38.27 
 
 		 281 aa  161  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03812  glycerol facilitator  37.55 
 
 		 281 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4058  MIP family channel protein  37.55 
 
 		 281 aa  160  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5382  glycerol uptake facilitator protein  37.55 
 
 		 281 aa  160  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4367  glycerol uptake facilitator protein  37.55 
 
 		 281 aa  160  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.481473 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4336  MIP family channel protein  37.87 
 
 		 283 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.277655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03761  hypothetical protein  37.55 
 
 		 281 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4091  MIP family channel protein  37.55 
 
 		 281 aa  160  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4461  glycerol uptake facilitator protein  37.55 
 
 		 281 aa  160  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.625465  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45700  glycerol uptake facilitator protein  38.63 
 
 		 279 aa  159  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1105  MIP family channel protein  36.46 
 
 		 283 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4090  MIP family channel protein  36.16 
 
 		 265 aa  159  6e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3904  major intrinsic protein  36.77 
 
 		 285 aa  159  7e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.333674  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1076  MIP family channel protein  36.76 
 
 		 283 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1117  MIP family channel protein  36.76 
 
 		 283 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.178893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4409  glycerol uptake facilitator protein  37.55 
 
 		 281 aa  159  8e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0436905  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01532  glycerol uptake facilitator protein GlpF  40 
 
 		 289 aa  159  8e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4046  MIP family channel protein  38.24 
 
 		 281 aa  158  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3802  MIP family channel protein  39.07 
 
 		 281 aa  158  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4531  Aquaporin  35.79 
 
 		 283 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174053  normal  0.147352 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0275  glycerol uptake facilitator protein  40.46 
 
 		 232 aa  154  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1562  glycerol uptake facilitator protein  37.83 
 
 		 279 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3650  MIP family channel protein  41.26 
 
 		 250 aa  151  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1065  MIP family channel protein  41.95 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.547307  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17980  glycerol uptake facilitator protein  37.36 
 
 		 279 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151974  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1653  glycerol uptake facilitator protein  39.85 
 
 		 237 aa  149  6e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1267  MIP family channel protein  37.69 
 
 		 275 aa  149  9e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000541866  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1019  MIP family channel protein  41.06 
 
 		 242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2846  MIP family channel protein  39.92 
 
 		 236 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324919  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0245  glycerol uptake facilitator  42.48 
 
 		 254 aa  145  6e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2149  MIP family channel protein  39.46 
 
 		 272 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1487  glycerol uptake facilitator  37.31 
 
 		 242 aa  142  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00172082  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1358  MIP family channel protein  39.23 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00322648  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1384  MIP family channel protein  39.23 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000466  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0866  glycerol uptake facilitator protein  37.45 
 
 		 274 aa  139  6e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.306502  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0726  major intrinsic protein  40.87 
 
 		 247 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000820267 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0947  MIP family channel protein  36.15 
 
 		 273 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000138868  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1170  putative glycerol uptake facilitator protein  37.5 
 
 		 234 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.351362  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1001  glycerol uptake facilitator protein  37.5 
 
 		 234 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.379218  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0480  glycerol uptake facilitator related permease (major Intrinsic protein family)  33.96 
 
 		 289 aa  135  9.999999999999999e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000000262851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0897  MIP family channel protein  35.59 
 
 		 274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1915  major intrinsic protein  33.33 
 
 		 281 aa  133  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0598  glycerol uptake facilitator protein  37.84 
 
 		 238 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0724  glycerol uptake facilitator protein  37.84 
 
 		 238 aa  133  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.122714  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2451  glycerol uptake facilitator protein  37.84 
 
 		 238 aa  133  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0239  glycerol uptake facilitator protein  37.84 
 
 		 238 aa  133  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.160483  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0905  glycerol uptake facilitator protein  37.84 
 
 		 238 aa  133  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0738  glycerol uptake facilitator protein  37.84 
 
 		 238 aa  133  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2707  glycerol uptake facilitator protein  37.84 
 
 		 238 aa  133  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2370  glycerol uptake facilitator protein  37.84 
 
 		 238 aa  133  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.925384  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3322  MIP family channel protein  37.45 
 
 		 237 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.218114 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5041  major intrinsic protein  40.84 
 
 		 240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0637  major intrinsic protein, glycerol uptake channel  37.07 
 
 		 237 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1065  glycerol uptake facilitator protein  35.63 
 
 		 273 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000246889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>