150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0011 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1007  hemolysin activation/secretion protein-like  99.47 
 
 
567 aa  1147  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0746  hemolysin activation/secretion protein-like  100 
 
 
567 aa  1151  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.63759  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0011  hemolysin activation/secretion protein-like  100 
 
 
567 aa  1151  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.811976  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0690  Hemolysin activator HlyB domain protein  50.77 
 
 
442 aa  440  1e-122  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0727  hemolysin activation/secretion protein-like  37.29 
 
 
575 aa  307  3e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.494827  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2665  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  36.56 
 
 
574 aa  295  2e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3060  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  34.58 
 
 
590 aa  284  3e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2281  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  34.56 
 
 
595 aa  280  7e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127506  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37880  hypothetical protein  33.47 
 
 
550 aa  254  2e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335494  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3704  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.71 
 
 
554 aa  247  3e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.509582 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1782  putative heme-hemopexin utilization protein B  32.5 
 
 
554 aa  238  2e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  29.21 
 
 
553 aa  223  8e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.43 
 
 
583 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.85 
 
 
572 aa  207  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4107  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.47 
 
 
554 aa  207  6e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416704  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3061  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.3 
 
 
578 aa  200  7e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0377809  decreased coverage  0.00167141 
 
 
-
 
NC_003296  RS03098  activation/secretion signal peptide protein  28.39 
 
 
556 aa  195  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.604865  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2107  activation/secretion signal peptide protein  28.83 
 
 
548 aa  190  6e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.385271  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  29.17 
 
 
607 aa  187  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58890  putative hemolysin activation/secretion protein  31.35 
 
 
545 aa  185  2e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0280329 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.68 
 
 
585 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5176  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.98 
 
 
586 aa  173  8e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.058555  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1054  activation/secretion signal peptide protein  27.56 
 
 
576 aa  170  7e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  2.17377e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3175  putative lipoprotein  29.72 
 
 
596 aa  166  7e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.849554  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3313  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.72 
 
 
596 aa  166  7e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3325  putative lipoprotein  29.72 
 
 
596 aa  164  5e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.112603  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1056  hemolysin activation/secretion protein-like  28.07 
 
 
576 aa  163  8e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  5.36803e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.48 
 
 
567 aa  162  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0939  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.99 
 
 
561 aa  157  4e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.247088  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2395  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.41 
 
 
569 aa  155  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2173  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.06 
 
 
692 aa  153  8e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0036053  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0530  putative outer-membrane protein  27.87 
 
 
551 aa  150  8e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1744  hypothetical protein  27.87 
 
 
551 aa  150  8e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.222058  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0764  putative outer-membrane protein  27.69 
 
 
508 aa  142  2e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.408754  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1531  hypothetical protein  26.73 
 
 
597 aa  137  4e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.76 
 
 
571 aa  132  1e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.35 
 
 
592 aa  126  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.763446 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0087  hypothetical protein  24.79 
 
 
581 aa  122  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00223104  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.3 
 
 
545 aa  115  2e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.16346e-09 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  26.32 
 
 
558 aa  115  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0068  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.03 
 
 
559 aa  105  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.503427 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3266  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  25.97 
 
 
1349 aa  101  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6061  hypothetical protein  25.1 
 
 
599 aa  100  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3489  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  25.32 
 
 
1391 aa  99.8  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3487  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  24.89 
 
 
1570 aa  96.3  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3763  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.42 
 
 
567 aa  95.1  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61190  hypothetical protein  22.5 
 
 
568 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324339  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0654  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.54 
 
 
546 aa  92.8  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.745868  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5270  hypothetical protein  22.5 
 
 
568 aa  92  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3230  hemolysin activator protein, HlyB family  24.24 
 
 
569 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23 
 
 
747 aa  86.7  1e-15  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1143  surface antigen (D15)  22.22 
 
 
584 aa  85.5  3e-15  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908627  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1533  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  23.44 
 
 
692 aa  85.1  3e-15  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0363151  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  24.13 
 
 
565 aa  84.7  5e-15  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  3.23092e-06 
 
 
-
 
NC_003296  RS02601  activation/secretion signal peptide protein  25.19 
 
 
557 aa  84.3  5e-15  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591465  normal  0.415625 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  24.32 
 
 
562 aa  84.3  6e-15  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.612794 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2776  hypothetical protein  23.79 
 
 
562 aa  84  7e-15  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816054  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1912  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.21 
 
 
558 aa  83.2  1e-14  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1285  hypothetical protein  24.28 
 
 
565 aa  82.4  2e-14  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000102142  hitchhiker  1.79621e-05 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2178  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.59 
 
 
554 aa  82  2e-14  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0042  hypothetical protein  23.59 
 
 
562 aa  82.4  2e-14  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4403  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.43 
 
 
557 aa  80.9  6e-14  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0052  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.49 
 
 
568 aa  79.7  1e-13  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.148517  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4351  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.51 
 
 
581 aa  79.3  2e-13  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.891663 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4241  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.51 
 
 
581 aa  79.3  2e-13  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.398994  normal  0.613369 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3502  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.65 
 
 
553 aa  78.6  3e-13  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.898931  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3648  putative activation/secretion signal peptide protein  22.15 
 
 
558 aa  77.8  5e-13  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5402  activation/secretion signal peptide protein  24.44 
 
 
555 aa  77.4  6e-13  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.68 
 
 
585 aa  77  9e-13  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1646  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.7 
 
 
569 aa  76.3  2e-12  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2523  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.75 
 
 
554 aa  73.9  7e-12  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4182  surface antigen variable number  21.75 
 
 
608 aa  73.6  9e-12  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000105717 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0281  surface antigen (D15)  22.71 
 
 
568 aa  73.2  1e-11  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1034  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  25.21 
 
 
561 aa  72.8  1e-11  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.278848  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1514  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.21 
 
 
561 aa  72.8  1e-11  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2806  putative hemolysin activation/secretion signal peptide protein, FhaC/HxuB  27.32 
 
 
569 aa  72.8  2e-11  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1048  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  19.3 
 
 
561 aa  72.8  2e-11  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0850333 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3152  hemolysin activator HlyB  24.06 
 
 
570 aa  72  3e-11  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575639  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1490  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.56 
 
 
561 aa  70.9  6e-11  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00938115  hitchhiker  6.15286e-05 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4426  surface antigen variable number  20.97 
 
 
595 aa  70.9  7e-11  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4013  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.43 
 
 
538 aa  70.5  8e-11  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1044  hypothetical protein  23.77 
 
 
559 aa  70.1  9e-11  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0938674  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1007  hypothetical protein  23.77 
 
 
551 aa  70.5  9e-11  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1396  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.69 
 
 
561 aa  70.1  9e-11  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304051  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0159  hypothetical protein  23.77 
 
 
551 aa  70.5  9e-11  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1491  hypothetical protein  23.77 
 
 
551 aa  70.5  9e-11  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1780  hypothetical protein  23.77 
 
 
551 aa  70.1  1e-10  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2550  hypothetical protein  23.66 
 
 
597 aa  69.7  1e-10  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0719761  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1931  putative exported heme utilisation related protein  23.77 
 
 
559 aa  69.7  1e-10  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3443  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.28 
 
 
639 aa  69.7  1e-10  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2673  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.73 
 
 
584 aa  70.1  1e-10  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.784893  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1436  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.29 
 
 
561 aa  69.3  2e-10  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0737479  normal  0.0360186 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1759  hypothetical protein  23.77 
 
 
551 aa  68.6  3e-10  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.301432  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2932  hemolysin activator HlyB  21.96 
 
 
582 aa  68.2  3e-10  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1739  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.15 
 
 
561 aa  68.2  4e-10  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.484199  hitchhiker  4.99827e-05 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2348  surface antigen variable number  22.01 
 
 
588 aa  67.4  7e-10  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.825907  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3523  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.7 
 
 
548 aa  67  9e-10  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0281  surface antigen (D15)  22.71 
 
 
568 aa  66.2  1e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0573  hypothetical protein  25.71 
 
 
574 aa  66.6  1e-09  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2460  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.55 
 
 
587 aa  65.9  2e-09  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.118018  normal  0.349655 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>